AP3D1 - AP3D1

AP3D1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	4AFI
Tanımlayıcılar
Takma adlar	AP3D1, ADTD, hBLVR, adaptörle ilgili protein kompleksi 3 delta 1 alt birimi, HPS10, adaptörle ilgili protein kompleksi 3 alt birim delta 1
Harici kimlikler	OMIM: 607246 MGI: 107734 HomoloGene: 2926 GeneCard'lar: AP3D1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 19 (insan)
Son	2,164,468 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 10 (fare)
Son	80,742,264 bp
RNA ifadesi Desen
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• taşıyıcı faaliyeti;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • Golgi cihazı; • zar; • Golgi zarı; • akson; • lizozomal membran; • terminal bouton; • membran kaplama; • endozom zarı; • akson sitoplazması; • AP-3 adaptör kompleksi; • presinaptik endozom; • hücre zarı; • presynapse; • postsynapse; • glutamaterjik sinaps;
Biyolojik süreç	• organelde protein lokalizasyonu; • membranda protein lokalizasyonu; • antijen işleme ve sunumu; • göz pigmenti biyosentetik süreci; • anterograd aksonal taşıma; • melanozom organizasyonu; • sinaptik vezikül zarı organizasyonu; • endozomdan melanozoma taşınması; • protein taşınması; • çinko iyonunun tutulmasının düzenlenmesi; • antijen işleme ve sunumu, MHC sınıf Ib yoluyla eksojen lipid antijen; • NK T hücre farklılaşmasının pozitif düzenlenmesi; • anterograd sinaptik vezikül taşınması; • hücre içi protein taşınması; • vezikül aracılı nakil; • endozomdan sinaptik vezikül tomurcuklanması; • nörotransmiter reseptör taşınması, postsinaptik endozomdan lizozoma; • Ulaşım; • vakuole hedefleyen protein; • Golgi'den vakuole nakliyesi; • sinapsta vezikül aracılı taşıma;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	8943
	11776
	ENSG00000065000
	ENSMUSG00000020198
	O14617
	O54774
	NM_001077523; NM_001261826; NM_003938; NM_001374799
	NM_007460
	NP_001248755; NP_003929; NP_001361728
	NP_031486
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

AP-3 karmaşık alt birimi delta-1 bir protein insanlarda kodlanır AP3D1 gen.^[5]^[6]^[7]

Fonksiyon

AP3D1, klatrin ile ilişkili olmayan AP3 adaptör benzeri kompleksin bir alt birimidir. AP3D1 alt birimi, hücre içi biyogenezde ve pigment granüllerinin ve muhtemelen trombosit yoğun granüllerin ve nörotransmiter veziküllerin trafiğinde rol oynar. [OMIM tarafından sağlanır]^[7]

Etkileşimler

AP3D1'in gösterdiği etkileşim ile SYBL1.^[8]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000065000 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000020198 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Simpson F, Peden AA, Christopoulou L, Robinson MS (Mayıs 1997). "Adaptörle ilgili protein kompleksinin karakterizasyonu, AP-3". Hücre Biyolojisi Dergisi. 137 (4): 835–45. doi:10.1083 / jcb.137.4.835. PMC 2139840. PMID 9151686.
^ Ooi CE, Moreira JE, Dell'Angelica EC, Poy G, Wassarman DA, Bonifacino JS (Ağu 1997). "Yeni bir adaptinin değiştirilmiş ifadesi, Drosophila göz rengi mutant granatında kusurlu pigment granül biyogenezine yol açar". EMBO Dergisi. 16 (15): 4508–18. doi:10.1093 / emboj / 16.15.4508. PMC 1170077. PMID 9303295.
^ ^a ^b "Entrez Geni: AP3D1 adaptörle ilgili protein kompleksi 3, delta 1 alt birimi".
^ Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, Daviet L, Formstecher E, Hamburger A, Filippini F, D'Esposito M, Galli T (Temmuz 2003). "Ekzositik v-SNARE'lerin lokalizasyonunu ve işlevini kontrol eden ikili bir mekanizma". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 100 (15): 9011–6. doi:10.1073 / pnas.1431910100. PMC 166429. PMID 12853575.

Dış bağlantılar

İnsan AP3D1 genom konumu ve AP3D1 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

daha fazla okuma

Höning S, Sandoval IV, von Figura K (Ağustos 1998). "LIMP-II'nin sitoplazmik kuyruğundaki di-lösin bazlı bir motif ve tirozinaz, AP-3'ün seçici bağlanmasına aracılık eder". EMBO Dergisi. 17 (5): 1304–14. doi:10.1093 / emboj / 17.5.1304. PMC 1170479. PMID 9482728.
Kantheti P, Qiao X, Diaz ME, Peden AA, Meyer GE, Carskadon SL, Kapfhamer D, Sufalko D, Robinson MS, Noebels JL, Burmeister M (Temmuz 1998). "Mocha faresindeki AP-3 deltasındaki mutasyon, endozomal taşınmayı trombositler, melanozomlar ve sinaptik veziküllerdeki depolama eksikliğine bağlar". Nöron. 21 (1): 111–22. doi:10.1016 / S0896-6273 (00) 80519-X. PMID 9697856. S2CID 17237941.
Rehling P, Darsow T, Katzmann DJ, Emr SD (2000). "AP-3 taşıma ara ürünlerinin oluşumu, Vps41 işlevini gerektirir". Doğa Hücre Biyolojisi. 1 (6): 346–53. doi:10.1038/14037. PMID 10559961. S2CID 24932376.
Craig HM, Reddy TR, Riggs NL, Dao PP, Guatelli JC (Mayıs 2000). "HIV-1 nef'in adaptör protein kompleksleri 1, 2 ve 3'ün mu alt birimleri ile etkileşimleri: dileusine dayalı sıralama motifinin rolü". Viroloji. 271 (1): 9–17. doi:10.1006 / viro.2000.0277. PMID 10814565.
Crump CM, Xiang Y, Thomas L, Gu F, Austin C, Tooze SA, Thomas G (Mayıs 2001). "Adaptörlere PACS-1 bağlanması, asidik küme motifi aracılı protein trafiği için gereklidir". EMBO Dergisi. 20 (9): 2191–201. doi:10.1093 / emboj / 20.9.2191. PMC 125242. PMID 11331585.
Austin C, Boehm M, Tooze SA (Nisan 2002). "Bölgeye özgü çapraz bağlama, sınıf 1, 2 ve 3 ADP-ribosilasyon faktörlerinin adaptör protein kompleksleri 1 ve 3 ile farklı bir doğrudan etkileşimini ortaya çıkarır". Biyokimya. 41 (14): 4669–77. doi:10.1021 / bi016064j. PMID 11926829.
Janvier K, Craig H, Hitchin D, Madrid R, Sol-Foulon N, Renault L, Cherfils J, Cassel D, Benichou S, Guatelli J (Mart 2003). "HIV-1 Nef, adaptör protein komplekslerinin membranlarla ilişkisini stabilize eder". Biyolojik Kimya Dergisi. 278 (10): 8725–32. doi:10.1074 / jbc.M210115200. PMID 12486136.
Nie Z, Boehm M, Boja ES, Vass WC, Bonifacino JS, Fales HM, Randazzo PA (Eylül 2003). "Adaptör protein kompleksi AP-3'ün Arf GAP AGAP1 tarafından özel düzenlenmesi". Gelişimsel Hücre. 5 (3): 513–21. doi:10.1016 / S1534-5807 (03) 00234-X. PMID 12967569.
Salazar G, Love R, Werner E, Doucette MM, Cheng S, Levey A, Faundez V (Şubat 2004). "Çinko taşıyıcı ZnT3, AP-3 ile etkileşime girer ve tercihen farklı bir sinaptik vezikül alt popülasyonunu hedef alır". Hücrenin moleküler biyolojisi. 15 (2): 575–87. doi:10.1091 / mbc.E03-06-0401. PMC 329249. PMID 14657250.
Lefrançois S, Janvier K, Boehm M, Ooi CE, Bonifacino JS (Ekim 2004). "Kulak-çekirdek etkileşimi AP-3 kompleksinin membranlara alınmasını düzenler". Gelişimsel Hücre. 7 (4): 619–25. doi:10.1016 / j.devcel.2004.08.009. PMID 15469849.
Coleman SH, Van Damme N, Day JR, Noviello CM, Hitchin D, Madrid R, Benichou S, Guatelli JC (Şubat 2005). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 Nef ile adaptör protein kompleksleri arasındaki lösine özgü, fonksiyonel etkileşimler". Journal of Virology. 79 (4): 2066–78. doi:10.1128 / JVI.79.4.2066-2078.2005. PMC 546596. PMID 15681409.
Dong X, Li H, Derdowski A, Ding L, Burnett A, Chen X, Peters TR, Dermody TS, Woodruff E, Wang JJ, Spearman P (Mart 2005). "AP-3, HIV-1 Gag'ın hücre içi trafiğini yönetir ve partikül birleşmesinde önemli bir rol oynar". Hücre. 120 (5): 663–74. doi:10.1016 / j.cell.2004.12.023. PMID 15766529. S2CID 14528434.
Theos AC, Tenza D, Martina JA, Hurbain I, Peden AA, Sviderskaya EV, Stewart A, Robinson MS, Bennett DC, Cutler DF, Bonifacino JS, Marks MS, Raposo G (2006). "Endozomlardan melanozomlara tirozinaz sınıflandırmasında adaptör protein (AP) -3 ve AP-1'in işlevleri". Hücrenin moleküler biyolojisi. 16 (11): 5356–72. doi:10.1091 / mbc.E05-07-0626. PMC 1266432. PMID 16162817.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 19 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000065000 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000020198 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid9151686-5] Simpson F, Peden AA, Christopoulou L, Robinson MS (Mayıs 1997). "Adaptörle ilgili protein kompleksinin karakterizasyonu, AP-3". Hücre Biyolojisi Dergisi. 137 (4): 835–45. doi:10.1083 / jcb.137.4.835. PMC 2139840. PMID 9151686.

[pmid9303295-6] Ooi CE, Moreira JE, Dell'Angelica EC, Poy G, Wassarman DA, Bonifacino JS (Ağu 1997). "Yeni bir adaptinin değiştirilmiş ifadesi, Drosophila göz rengi mutant granatında kusurlu pigment granül biyogenezine yol açar". EMBO Dergisi. 16 (15): 4508–18. doi:10.1093 / emboj / 16.15.4508. PMC 1170077. PMID 9303295.

[entrez-7] "Entrez Geni: AP3D1 adaptörle ilgili protein kompleksi 3, delta 1 alt birimi".

[pmid12853575-8] Martinez-Arca S, Rudge R, Vacca M, Raposo G, Camonis J, Proux-Gillardeaux V, Daviet L, Formstecher E, Hamburger A, Filippini F, D'Esposito M, Galli T (Temmuz 2003). "Ekzositik v-SNARE'lerin lokalizasyonunu ve işlevini kontrol eden ikili bir mekanizma". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 100 (15): 9011–6. doi:10.1073 / pnas.1431910100. PMC 166429. PMID 12853575.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]