Aktinobakteriyel faj holin ailesi - Actinobacterial phage holin family

Aktinobakteriyel Faj Holin (APH) Ailesi (TC # 1.E.57 ) uzunluk olarak 105 ve 180 amino asil kalıntısı arasında oldukça büyük bir protein ailesidir, tipik olarak N-terminalinin yakınında tek bir zar geçiş bölümü (TMS) sergiler. APH ailesine ait olan proteinlerin temsili bir listesi, Taşıyıcı Sınıflandırma Veritabanı.[1]

Bu ailedeki arketip proteinlerinden biri, Gp5 holinidir. mikobakteriyofaj Ms6. Mikobakteriyofaj Ms6, çift sarmallı bir DNA'dır (dsDNA) bakteriyofaj bu, öngörülen endolizin (LysA) -holin (Gp4) liziz sistemine ek olarak, liziz modülünde üç ek proteini kodlar: Gp1, LysB ve Gp5.[2]

Ms6 Gp4 (TC # 1.E.18.1.2 ) daha önce sınıf II holin benzeri bir protein olarak tanımlanmıştı. İkinci bir varsayılan holin geni (gp5) tahmin edilen tek bir N-terminal TMS ile bir proteini (Gp5) kodlayan, Ms6 litik operonunun sonunda belirlendi. Ne varsayılan sınıf II holin ne de tek TMS polipeptidi tetikleyemez liziz endolizin LysA ile ikili kombinasyonlarda Escherichia coli. Bununla birlikte, daha ileri çalışmalar, Ms6'nın Gp4 ve Gp5'in birbirleriyle etkileşime girdiğini göstermiştir. Bu, Ms6 enfeksiyonunda, doğru ve programlanmış liziz zamanlamasının Gp4 ve Gp5'in birleşik eylemi ile elde edildiğini gösterir.[2]

Ayrıca bakınız

daha fazla okuma

  • Petrovski, Steve; Seviour, Robert J .; Tillett Daniel (2011). "Aktif Çamur Bitkilerinde Gordonia-, Rhodococcus- ve Nocardia-Stabilize Köpüklerin Biyokontrolü İçin Potansiyeli Olan Çok Değerlikli Lytic Bakteriyofaj GTE2 Genomunun Karakterizasyonu". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 77 (12): 3923–3929. doi:10.1128 / AEM.00025-11. PMC  3131622. PMID  21498753.
  • Reddy, Bhaskara L .; Saier Jr, Milton H. (2013). "Bakteriyel holin ailelerinin ve süper ailelerin topolojik ve filogenetik analizleri". Biochimica et Biophysica Açta (BBA) - Biyomembranlar. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbamem.2013.07.004. PMC  3788059. PMID  23856191.
  • Saier, Milton H .; Reddy, Bhaskara L. (2015). "Bakteriler, Ökaryotlar ve Arkealardaki Holinler: Potansiyel Biyoteknolojik ve Biyomedikal Uygulamalara Sahip Çok Fonksiyonlu Ksenologlar". Bakteriyoloji Dergisi. 197 (1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. PMC  4288690. PMID  25157079.
  • Wang, I.N .; Smith, D. L .; Genç, R. (2000). "Holinler: bakteriyofaj enfeksiyonlarının protein saatleri". Mikrobiyolojinin Yıllık İncelemesi. 54: 799–825. doi:10.1146 / annurev.micro.54.1.799. PMID  11018145.

Referanslar

  1. ^ "1.E.57. Aktinobakteriyel Faj Holin (APH) Ailesi". TCDB. Alındı 2016-03-29.
  2. ^ a b Catalão, Maria João; Gil, Filipa; Moniz-Pereira, José; Pimentel, Madalena (2011-06-01). "Mikobakteriyofaj Ms6'nın holin benzeri proteinlerinin fonksiyonel analizi". Bakteriyoloji Dergisi. 193 (11): 2793–2803. doi:10.1128 / JB.01519-10. ISSN  1098-5530. PMC  3133122. PMID  21441511.

İtibariyle bu düzenleme, bu makale şuradan içerik kullanıyor: "1.E.57. Aktinobakteriyel Faj Holin (APH) Ailesi", altında yeniden kullanıma izin verecek şekilde lisanslanmıştır. Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported Lisansıama altında değil GFDL. İlgili tüm şartlara uyulmalıdır.