Addgene - Addgene
 | Görünüşe göre bu makaleye en büyük katkıda bulunanlardan biri, yakın bağlantı konusu ile. (Aralık 2015) (Bu şablon mesajını nasıl ve ne zaman kaldıracağınızı öğrenin) |
 | |
| Kurulmuş | 2004 |
|---|---|
| Kurucu | Benjie Chen Kenneth Fan Melina Yelpazesi |
| Tür | Kar amacı gütmeyen kuruluş Biyolojik kaynak merkezi |
| yer |
|
| Hizmetler | Plazmid deposu |
Addgene kar amacı gütmeyen plazmid depo. Addgene, dünyadaki kar amacı gütmeyen laboratuvarlara plazmitler ve bunlarla ilgili klonlama verilerini sunarak laboratuvarlar arasında genetik materyal alışverişini kolaylaştırır. Addgene, yaygın olarak kullanılan vektör omurgalarının listeleri dahil olmak üzere, plazmid klonlama bilgilerinin ve referanslarının ücretsiz bir çevrimiçi veritabanı sağlar. lentiviral plazmitler ve moleküler klonlama protokoller.
Tarih
Addgene, 2004 yılında Melina Fan, Kenneth Fan ve Benjie Chen tarafından kuruldu.[1][2]
Operasyonlar
Addgene'nin genel merkezi şu konumdadır: Watertown, Massachusetts.
Addgene, araştırmacılardan plazmitleri dağıtım ve arşivleme için kabul eder. Addgene, ticari satış için ücretsiz depoyu kullanarak gelir ve lisans ücretlerini elde eder ve kâr amacı gütmeyen varsayılan operasyonunun kâr kazançları için endüstriyel fiyattan 501 (c) 3 kar amacı gütmeyen kuruluşa edinilen depo plazmidlerini satma konusunda isteğe bağlı olarak seçici davranır.
Organizasyon, plazmit isteyen bilim adamlarına nominal bir ücret talep ederek koleksiyonun sürdürülmesi ve iyileştirilmesi için işletme maliyetlerini karşılar.[3]
Plazmid deposu
2014 itibariyle Addgene'nin deposu, 1.700 laboratuar tarafından saklanan 30.000 plazmidden oluşuyordu.[4] Plazmid koleksiyonu, aşağıdaki gibi işlevler için kullanılan plazmidleri içerir. genom mühendisliği (CRISPRS dahil), gen ifadesi, shRNA knockdown, viral aracılı gen dağıtımı, tespit miRNA ve destekleyici aktivite. Plazmid koleksiyonu şunları içerir:
- Genom mühendisliği
- CRISPR'ler
- Transkripsiyon Aktivatör Benzeri Efektör Nükleaz (TALEN) kitleri
- Çinko parmak nükleaz kitler
- Boş omurgalar
- Türe özgü ifade
- Epitop etiketleri
- Füzyon proteinleri
- Seçilebilir işaretçiler
- Floresan işaretleyici
- Viral vektörler
- Retroviral / Lentiviral
- Adenoviral
- AAV
- cDNA ifade
- shRNA ifadesi
Araçlar ve kılavuzlar
Moleküler biyoloji araçları
Vektör Veritabanı —İlgili klonlama bilgileri ve bakteri üreme koşulları dahil olmak üzere 4.000'den fazla vektör omurgasından oluşan küratörlü bir liste.
Dizi Analizörü —Açıklanmış özelliklere ve kısıtlama sitelerine sahip dizilerden plazmid haritaları oluşturmak için bir Addgene yazılım aracı.
Moleküler Biyoloji Referansı —Primerler, kısıtlama enzimleri ve antibiyotik konsantrasyonları gibi moleküler biyoloji reaktifleri için bir referans koleksiyonu.
Plazmid Klonlama Kılavuzları
Moleküler Klonlama Kılavuzları —Bilim adamlarının plazmit klonlama deneyleri tasarlamasına yardımcı olacak referanslar, kısıtlama enzimi sindirimi ve PCR tabanlı klonlama üzerine öğreticiler dahil.
Moleküler Klonlama Protokolleri —Bakteriyel kolonilerin izolasyonu, DNA saflaştırması gibi çeşitli plazmid klonlama teknikleri için spesifik protokoller jel elektroforezi ve bakteri dönüşümü.
İşbirlikleri
Addgene, belirli amaçlar için plazmid koleksiyonlarını iyileştirmek için enstitüler ve konsorsiyumlarla işbirliği yapar. Bu işbirliklerinin örnekleri arasında Yapısal Genomik Konsorsiyumu, Zinc Finger Consortium, the Cell Migration Consortium, the KLF koleksiyon ve Michael J. Fox Vakfı.[5] Plazmitler hem akademik hem de endüstri laboratuvarlarında mevcuttur.
Mevduat sahipleri
Kayda değer mudiler şunları içerir:[kaynak belirtilmeli ]
- 12 Nobel Ödülü sahibi; John Gurdon, Shinya Yamanaka, Bruce Beutler, Mario Capecchi, Andrew Fire, Richard Axel, Eric Wieschaus, Phillip Sharp, Robert Lefkowitz, Martin Chalfie, Roger Tsien ve Johann Deisenhofer.
- Yaşam Bilimlerinde 8 Atılım Ödülü kazananlar; Cori Bargmann, David Botstein, Lewis C. Cantley, Hans Clevers, Titia de Lange, Bert Vogelstein, Robert Weinberg ve Shinya Yamanaka.
Elektronik Malzeme Transferi Sözleşmeleri
Addgene gerektirir Malzeme Transferi Sözleşmeleri (MTA'lar), plazmid depolayıcıların fikri mülkiyetini korumak için Addgene aracılığıyla aktarılan tüm malzemeler için. Addgene, MTA'ları işlemek için ilk elektronik sistemlerden birini geliştirdi.[6] Standart Evrensel Biyolojik Materyal Transfer Anlaşmasını (UBMTA) kullanarak ve elektronik imzalar uygulayarak, Addgene’in elektronik MTA (eMTA) sistemi plazmid siparişleri için onay sürecini hızlandırır.
Ödüller
Addgene, Yeniliklerde Mükemmeliyet için Mass Kâr Amacı Gütmeyen Ağ Ödülü dahil olmak üzere yenilik ve araştırma için ödüller kazandı,[7][8] Cambridge ödül programı 2014 Araştırma ve Geliştirme Laboratuvarları Ödülü,[9] Kitle Teknolojisi Liderliği Ödülü Finalisti 2012.[10]
Referanslar
- ^ Scudellari Megan (2012). "Paylaşmak Daha Kolay". Bilim insanı. Alındı 21 Kasım 2012.
- ^ Fan, M; Tsai, J; Chen, B; Fan, K; LaBaer, J (25 Mart 2005). "Yayınlanmış plazmitler için merkezi bir depo". Bilim. 307 (5717): 1877. doi:10.1126 / science.307.5717.1877a. PMID 15790830.
- ^ Kamens, J (2012). "Plazmit var mı?" (PDF). Lab Times. s. 58–59. Alındı 21 Kasım 2012.
- ^ Baker, Monya. "Kod depoları temel araştırma araçlarını paylaşır". Nature.com. Alındı 8 Mayıs 2014.
- ^ Resende, Patricia (3 Ekim 2012). "Addgene, Michael J. Fox Vakfı ile ortak". Kitle Yüksek Teknoloji. Arşivlenen orijinal 9 Ekim 2012 tarihinde. Alındı 21 Kasım 2012.
- ^ Herscovitch, Melanie; Perkins, Eric; Baltus, Andy; Fan, Melina (10 Nisan 2012). "Addgene, plazmid paylaşımı için açık bir forum sağlar". Doğa Biyoteknolojisi. 30 (4): 316–317. doi:10.1038 / nbt.2177. PMID 22491276.
- ^ "kitlesel kar amacı gütmeyen ağ addgene'i mükemmellik ödülü için aday gösteriyor" (PDF). Alındı 9 Mayıs 2014.
- ^ "kâr amacı gütmeyen toplu kuruluş, inovasyon finalistlerinde 2013 mükemmelliği ödülü". Arşivlenen orijinal 2013-09-02 tarihinde. Alındı 9 Mayıs 2014.
- ^ "cambridge tanıma ödülü". Alındı 9 Mayıs 2014.
- ^ "Mass Tech finalisti açıkladı". Alındı 9 Mayıs 2014.