Benzerliklerin analizi - Analysis of similarities

Benzerliklerin analizi (ANOSIM) bir parametrik olmayan istatistiksel test alanında yaygın olarak kullanılmaktadır ekoloji. Test ilk olarak K.R. Clarke tarafından önerildi[1] olarak ANOVA benzeri test, üzerinde çalışmak yerine nerede işlenmemiş veri, derecelendirilmiş bir farklılıkla çalışır matris.

Bir sıra matrisi verildiğinde farklılıklar bir dizi örnek arasında, her biri yalnızca bir Tedavi grubu ANOSIM, sıfır hipotezi gruplar arasındaki benzerliğin daha büyük veya eşit olduğuna benzerlik gruplar içinde.

Test istatistiği R şu şekilde hesaplanır:

nerede rB farklı sitelerden kaynaklanan örnek çiftlerinin (veya tekrarlarının) sıra benzerliklerinin ortalamasıdır, rW çiftlerin ortalama sıra benzerliği kopyalar siteler içinde ve M = n(n - 1) / 2 nerede n örnek sayısıdır.

Test istatistiği R to1 ile 1 arasında sınırlandırılmıştır, burada pozitif sayılar siteler içinde daha fazla benzerlik önermek ve sıfıra yakın değerler, siteler içinde ve siteler içinde benzerlikler arasında hiçbir fark olmadığını temsil eder. Olumsuz R değerler, siteler arasında sahaların içinde olduğundan daha fazla benzerlik olduğunu gösterir ve örneklerin sahalara yanlış atanması olasılığını artırabilir.

Amacıyla hipotez sıfır hipotezinin, sitelerdeki benzerliklerin siteler arasındaki benzerliklerden daha küçük veya eşit olduğu olduğu durumlarda, R istatistik genellikle bir dizi ile karşılaştırılır R ′ numuneler arasında rastgele karıştırılan site etiketleri aracılığıyla elde edilen değerler ve ortaya çıkan R ′, birçok kez tekrarlandı. Gerçek olan zamanların yüzdesi R aştı permütasyonlar türetilmiş R ′ değerler, gerçek için p-değeridir R istatistik.

ANOSIM ve NMDS'deki (metrik olmayan çok boyutlu ölçekleme) farklılığın sıralaması el ele gider. Her iki yöntemi birleştirmek, grup farklılıklarının görselleştirmesini tamamlar. anlamlılık testi.[2]

ANOSIM, PRIMER, R Vegan paketi ve PAST dahil olmak üzere çeşitli istatistiksel yazılımlarda uygulanmaktadır.

Referanslar

  1. ^ Clarke, K.R (1993). "Topluluk yapısındaki değişikliklerin parametrik olmayan çok değişkenli analizleri". Austral Ekoloji. 18 (1): 117–143. doi:10.1111 / j.1442-9993.1993.tb00438.x. ISSN  1442-9985.
  2. ^ Buttigieg, Pier Luigi; Ramette, Alban (2014). "Mikrobiyal ekolojide istatistiksel analiz kılavuzu: çok değişkenli veri analizlerinin topluluk odaklı, canlı bir incelemesi". FEMS Mikrobiyoloji Ekolojisi. 90 (3): 543–550. doi:10.1111/1574-6941.12437. ISSN  0168-6496. PMID  25314312.

Dış bağlantılar