Ankorbin - Ankycorbin
| Rai14 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||||||||||||||||||||
| Takma adlar | 1700008J19Rik1700020L11RikAnkycorbinNorpegmKIAA1334retinoik asit kaynaklı 14 | ||||||||||||||||||||||||
| Harici kimlikler | HomoloGene: 9199 GeneCard'lar: [1] | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortologlar | |||||||||||||||||||||||||
| Türler | İnsan | Fare | |||||||||||||||||||||||
| Entrez |
| ||||||||||||||||||||||||
| Topluluk |
| ||||||||||||||||||||||||
| UniProt |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNA) |
| ||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (protein) |
| ||||||||||||||||||||||||
| Konum (UCSC) | Tarih 15: 10.57 - 10.71 Mb | yok | |||||||||||||||||||||||
| PubMed arama | [1] | yok | |||||||||||||||||||||||
| Vikiveri | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Ankorbin bir ankyrin tekrarı ve sarmal bobin alan içeren protein insanlarda kodlanır RAI14 gen. Çeşitli insan dokularında ifade edilir ve ektoplazmik uzmanlaşmanın aktin regülasyonunda, sperm polaritesinin oluşumunda ve sperm yapışmasında rol oynadığı düşünülmektedir. Ayrıca kan testis bariyerindeki Sertoli hücre sıkı bağlantılarının bütünlüğünü de teşvik edebilir.
Gen
yer
RAI14, 15 içerir Eksonlar ve artı şeridinde bulunur kromozom numarası 5 5p13.2 konumunda. 5.068'i kapsar baz çiftleri 34,656,328'den 34,832,612'ye.[2]
Gene Mahalle
Genler TTC23L ve LOC105374721, kromozom 5'te RAI14'e komşu.
İfade
RAI14, geniş bir insan dokusunda eksprese edilir. TPM tarafından en yüksek ekspresyonun bazı alanları (milyon başına transkript), endometriyum, düz kas, serviks, serviks, testis ve dalak dokularını içerir. İnsan beyninde RAI14 ifadesi beyin sapı çevresindeki alanda bol miktarda bulunur ve medulla. En yüksek ifade seviyeleri, miyelensefalon, embriyonik beynin daha sonra medulla oblongata haline gelecek bir bölgesi.[3]
Homoloji
Paraloglar
RAI14'te hiç yok paraloglar.
Ortologlar
Ankokorbin proteininin tüm dizisinin çoğu, memelilerin çoğunluğu ve omurgalılar.[4] Daha uzaktan ilgili ortologlar köpekbalıkları gibi, benzerliğini yitirmeye ve daha az korunmaya başlar. C-terminali proteinin sonu. Ankycorbin, mercan gibi omurgasızlar içinde hiç iyi korunmaz. Proteinin ikinci yarısı büyük ölçüde eksiktir ve bir miktar koruma benzerliğini koruyan tek kısım, ankirin tekrar alanı ile ilişkili N-terminaline yakın alandır.
| Cins ve Türler | Yaygın isim | Iraksama Tarihi (kimden Homo Sapiens) | NCBI Erişimi Numara | Sıra Uzunluğu (Amino asitler) | Sıra Kimlik |
|---|---|---|---|---|---|
| Homo sapiens | İnsan | NP_001138992.1 | 980 | 100% | |
| Castor canadensis | Kuzey Amerika Kunduzu | 88 MYA | XP_020026070.1 | 980 | 92% |
| Delphinapterus leucas | Beluga balinası | 94 MYA | XP_022455298.1 | 980 | 90% |
| Pelecanus crispus | Tepeli pelikan | 320 MYA | XP_009485865.1 | 977 | 69% |
| Python bivittatus | Birmanya pitonu | 320 MYA | XP_007432514.1 | 992 | 66% |
| Xenopus laevis | Afrika pençeli kurbağa | 353 MYA | XP_018100022.1 | 971 | 53% |
| Rhincodon typus | Balina köpekbalığı | 465 MYA | XP_020373853.1 | 719 | 46% |
| Stylophora pistillata | Mercan | 685 MYA | XP_022783988.1 | 653 | 31% |
Protein
Transkriptler
Ankycorbin'de dört farklı izoformlar (A, B, C ve D) çoğu izoformu, esas olarak farklılık gösteren bir veya daha fazla ekleme varyantı içeren 5 'UTR. İzoform D, 983 amino asit uzunluğunda bilinen en uzun izoformdur, ancak izoform A (980 amino asit), proteinin en baskın şeklidir.[5]
Genel Özellikler
RAI14 proteininin tahmini ağırlığı 110.0 kDal ve izoelektrik noktası 5.87'dir. Ayrıca, 914-978 nükleotidleri arasında glutamin açısından zengin bir bölgeye sahip olduğu tahmin edilmektedir ve aksi takdirde, glisin ve fenilalanin bakımından fakirken lisin, glutamat ve serin açısından zengin olduğu tahmin edilmektedir.[6] Çözünür bir proteindir.[7]
Yapı ve Alanlar
Ankycorbin, bir Ankirin yakınında bulunan bölgeyi tekrarlayın N-terminal[8] 6 ankirin tekrarından oluşur. Protein, ağırlıklı olarak alfa sarmallarından ve tahmini beta-yaprak yapıları içermeyen çift kıvrımlı alanlardan oluşur.
Çeviri Sonrası Değişiklikler
RAI14, yüzlerce tahmini fosforilasyon bölgesi olan yüksek oranda fosforile edilmiş bir proteindir. Nükleer bir protein olduğu tahmin edilmektedir ve 3 nükleer lokalizasyon sinyali içerir.
Fonksiyon
RAI14'ün hücre-hücre yapışma bölgelerinde, özellikle de hücre-hücre etkileşimlerinde bir rol oynadığı tahmin edilmektedir. Sertoli hücreleri testis içinden. Sertoli hücreleri, kan testis bariyeri ve içinde özel, korumalı bir ortam sağlar. seminifer tübüller için testis üreme hücresi geliştirme.[9]
Referanslar
- ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ "RAI14 retinoik asit, 14 [Homo sapiens (insan)] indükledi". 4 Şubat 2018. Alındı 19 Şubat 2018.
- ^ "Allen Beyin Atlası: İnsan Beyni". Allen Beyin Atlası.
- ^ "NCBI: Protein Patlaması". Alındı 2 Mart, 2018.
- ^ "ankorbin izoformu bir [Homo sapiens]". NCBI. Ekim 2, 2017. Alındı 19 Şubat 2018.
- ^ "SAPS". EMBL-EBI.
- ^ Hirikawa, T .; Boon-Chieng, S .; Mitaku, S. "SOSUI: zar proteinleri için sınıflandırma ve ikincil yapı tahmin sistemi".
- ^ "PSORT II". PSORT: Amino Asit Dizilerinde Protein Sıralama ve Lokalizasyon Bölgelerinin Tahmin Edilmesi. Alındı 27 Nisan 2018.
- ^ Martin CM, Kleid JJ (2015). "Pseudofusion, kalp pili arızası gibi görünmekten daha iyidir." Elektrokardiyoloji Dergisi. 7 (2): 179–81. doi:10.1016 / S0022-0736 (74) 80028-2. PMID 4822540.