Arginin baskılayıcı ArgR - Arginine repressor ArgR
| Arginin baskılayıcı, C-terminal alanı | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 escherichia coli arginin baskılayıcı / l-arginin kompleksinin c-terminal alanı; pb türevi | |||||||||
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | Arg_repressor_C | ||||||||
| Pfam | PF02863 | ||||||||
| InterPro | IPR020899 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
| Arginin baskılayıcı, DNA bağlanma alanı | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | Arg_repressor | ||||||||
| Pfam | PF01316 | ||||||||
| SCOP2 | 1aoy / Dürbün / SUPFAM | ||||||||
| |||||||||
Moleküler biyolojide, arginin baskılayıcı (ArgR) bir baskılayıcıdır prokaryotik arginin deiminaz yolları.
arginin dihidrolaz (AD) yolu birçok prokaryotlar ve bazı ökaryotlar, ikincisinin bir örneği Giardia lamblia (Giardia intestinalis).[1] Üç enzimli anaerobik yol, L-argininini parçalara ayırarak 1 mol ATP'nin karbon dioksit ve amonyak. Bazı bakterilerde ilk enzim, arginin deiminaz, toplamın% 10'unu oluşturabilir hücre protein.[1]
Çoğu prokaryotik arginin deiminaz yolları bir baskılayıcı gen, ArgR olarak adlandırılır.[2] Bu negatif bir düzenleyicidir ve yalnızca arginin deiminazını serbest bırakır. operon için ifade arginin varlığında.[3] kristal yapı apo-ArgR'nin Bacillus stearothermophilus ile 2.5A olarak belirlenmiştir. X-ışını kristalografisi.[4] Protein, özdeş alt birimlerden oluşan bir heksamer olarak bulunur ve arginine bağlandığında merkezi bir oligomerik çekirdek etrafında kümelenmiş altı DNA bağlama alanına sahip olduğu gösterilmiştir. Ağırlıklı olarak etkileşim A.T ile kalıntılar ARG kutularında. Bu heksamerik protein bağlar Arginin biyosentezini bastırmak veya arjininini aktive etmek için N terminalindeki DNA katabolizma. Biraz Türler birkaç ArgR'ye sahip olmak paraloglar. Komşu birleşen bir ağaçta bunlardan bazıları paralel diziler uzun dallar gösterir ve iyi korunmuş C-terminal bölgesinden önemli ölçüde farklıdır.
Referanslar
- ^ a b Brown DM, Upcroft JA, Edwards MR, Upcroft P (Ocak 1998). "Antik ökaryotta anaerobik bakteri metabolizması Giardia duodenalis". Int. J. Parasitol. 28 (1): 149–64. doi:10.1016 / S0020-7519 (97) 00172-0. PMID 9504342.
- ^ Lu CD, Houghton JE, Abdelal AT (Mayıs 1992). "Salmonella typhimurium kaynaklı arginin baskılayıcısının karakterizasyonu ve carAB operatörü ile etkileşimleri". J. Mol. Biol. 225 (1): 11–24. doi:10.1016 / 0022-2836 (92) 91022-H. PMID 1583685.
- ^ Maghnouj A, de Sousa Cabral TF, Stalon V, Vander Wauven C (Aralık 1998). "Bacillus licheniformis'in arginin deiminaz yolunu kodlayan arcABDC gen kümesi ve arginin baskılayıcı argR tarafından aktivasyonu". J. Bakteriyol. 180 (24): 6468–75. doi:10.1128 / JB.180.24.6468-6475.1998. PMC 107747. PMID 9851988.
- ^ Ni J, Sakanyan V, Charlier D, Glansdorff N, Van Duyne GD (Mayıs 1999). "Bacillus stearothermophilus kaynaklı arginin baskılayıcısının yapısı". Nat. Struct. Biol. 6 (5): 427–32. doi:10.1038/8229. PMID 10331868. S2CID 24763624.