Avibase - Avibase

Avibase
Site türü
Taksonomik veritabanı
Uygun105 dil
Tarafından yaratıldıDenis Lepage
URLavibase.bsc-eoc.org
Başlatıldı2003
Şu anki durumAktif

Avibase çevrimiçi taksonomik veritabanı organize eden kuş taksonomik ve küresel olarak dağıtım verileri. Veritabanı özünde şu kavramına dayanır: taksonomik kavramlar.[açıklama gerekli ][1][2] taksonomik isimler yerine[3] (Ayrıca bakınız[4][5][6] taksonomik kavramları kullanmanın mantığı için). Avibase, ana kuş taksonomik yayıncılarından (Dünya Kuşlarının Clements Kontrol Listesi,[7] Dünya Kuşları El Kitabı, BirdLife International,[8] IOC Kontrol Listesi[9] ve Howard ve Moore, Dünyanın Kuşları için Eksiksiz Kontrol Listesi[10]) ve diğer bölgesel kaynaklar (örn. Amerikan Ornitoloji Derneği Kuzey Amerika Kuşları Kontrol Listesi 1886'dan beri). 230'dan fazla farklı taksonomik kaynaktan taksonomik kavramlar haritalandı ve Avibase kavramlarına çapraz referans verildi.

Web sitesi aynı zamanda dünyanın 20.000'den fazla coğrafi bölgesi için kontrol listeleri, taksonomik bilgiler ve eşanlamlılar içeren tür sayfaları ve gözlemcilerin kendi görüşlerini sürdürmeleri ve raporlar elde etmeleri için araçlar (örn. Ülkeleri gösteren harita veya eBird yaşam listelerinden birinde eksik olan hedef türlerin sayısıyla birlikte sıcak noktalar).

Tarih ve amaç

Avibase, şu anda veri bilimi ve teknolojisi kıdemli müdürü Denis Lepage tarafından oluşturulmuş ve sürdürülmektedir. Kuşlar Kanada. Avibase'de yer alan veriler 1991'den başlayarak toplandı.[11] Avibase web sitesi Haziran 2003'te açıldı ve ev sahipliğini Kuşlar Kanada (eski adıyla Bird Studies Canada) başlangıcından bu yana.

Özellikleri

Taksonomik kavramlar. Veritabanı, öncelikle benzersiz taksonomik kavramlar tablosu etrafında düzenlenmiştir. Her kavram benzersiz bir biyolojik sınırlamayı temsil eder ve adında benzersiz bir alfanümerik kimlik atanmıştır. Avibase Kimliği. Avibase ID'leri, yayın kaynakları arasında uygun taksonomik kavramların izlenmesine izin verir. Avibase'de açıklanan yaklaşık 58.000 benzersiz taksonomik kavram vardır. Bunlar, geleneksel olarak tür olarak tanınan kavramları içerir ve alt türler, aynı zamanda diğer taksonomik gruplamalar (alt tür grupları), tarihsel olarak tanınan çeşitli alternatif taksonomik işlemler ve temsil eden diğer kavramlar melezler, renk morfları ve geçersiz veya şüpheli formlar.

İsimlendirme verileri. Her biri bilimsel ad ayrıca alıntı verilerini ve orijinal açıklamayla ilişkili adı içerecek şekilde açıklanmaktadır. Yaklaşık 48.000 perde[açıklama gerekli ] Avibase'de kaydedilmiştir ve çeşitli eş anlamlı ayrıca mevcuttur.

Bölgesel türler kontrol listeleri dünyanın 20.000'den fazla bölgesi için mevcuttur. Bu, tüm ülkeleri, bölgeleri ve bağımlılıkları ve burada tanımlanan çoğu bölgeyi içerir. GADM iller, eyaletler, iller, ilçeler, departmanlar, belediyeler ve ilçeler (GADM seviyeleri 1 ve 2) gibi alt ulusal katmanların yanı sıra 2.500'den fazla ada. Bölgesel kontrol listeleri birkaç taksonomik formatta mevcuttur ve ayrıca şunları içerebilir: ortak isimler çeşitli dillerde. Bölgesel kontrol listelerine ilişkin veriler, eBird EBD veri kümesi ve Facebook Küresel Nadir Kuş Uyarısı gibi forumlar gibi çok sayıda kaynaktan gelmektedir.

Ortak isimler ve eşanlamlılar 271 farklı dilde ve bölgesel varyantlarda mevcuttur ve bilinen bir ortak ada sahip türlerin% 85'inden fazlasını kapsayan 21 dil vardır.

MyAvibase2013'te piyasaya sürülen, kendi işlerini sürdürmek isteyen kullanıcılar için ücretsiz araçlar sağlar. hayat listeleri ve gözlemcinin henüz görmediği hedef türleri (nereye gidecek, ne görecek, ne zaman gidecek, ne kadar süre ziyaret edecek) veya genel bölgesel istatistikler (örneğin, ülkeye göre toplam tür sayısı) bulmaya odaklanan raporlar oluşturun.

Veritabanı bilgilerinin kullanımı

Avibase, birçok web ve hakemli yayında kaynak veri olarak kullanılmaktadır. Örneğin, genellikle ana kaynak olarak kullanılır. Wikipedia. Ayrıca 600'den fazla yayında alıntılanmış ve verileri kullanılmıştır.[12] özellikle ekoloji alanlarında,[13] koruma[14] parazitoloji[15] insan sağlığı,[16] taksonomi[17][18] ve biyoinformatik.[19]

Avibase ID'leri, kuşların bilimsel isimlerindeki belirsizlikleri çözmenin bir yolu olarak kullanılmaktadır ve Kuzey Amerika Kuşlarının AOS Kontrol Listesi,[20] ve şurada mevcuttur: Vikiveri takson projesi.[21] Avibase ayrıca, aşağıdaki gibi araştırma grupları tarafından taksonomik bilgiler için bir referans olarak kullanılır. Grip Araştırma Veritabanı.

Notlar

  1. ^ "Veritabanlarındaki 'potansiyel takson' kavramı." Berendsohn WG (1995) Taxon 44: 207–212.
  2. ^ "Taksonomik bilgiler için standart veri modeli gösterimi." Kennedy J, Hyam R, Kukla R, Paterson T (2006). OMICS: Bütünleştirici Biyoloji Dergisi 10: 220–230.
  3. ^ "Avibase - Taksonomik Kavramları Yönetmek ve Organize Etmek İçin Bir Veritabanı Sistemi.", Lepage, Denis, Gaurav Vaidya ve Robert Guralnick, ZooKeys, 420 (25 Haziran 2014): 117–35.
  4. ^ "İnsanlar veya Bilgisayarlar için Taksonomi? Büyük Veriler için Bilişsel Pragmatik." Sterner, Beckett ve Nico M. Franz. 2017. Biyolojik Teori 12 (2): 99–111.
  5. ^ Güveni Artırmak İçin Toplu Biyoçeşitlilik Verilerinin Arkasındaki Sosyal Tasarımı Değiştirin. Franz, Nico M. ve Beckett W. Sterner. 2018. Veritabanı 2018 (Ocak).
  6. ^ "Taksonomik Değişkeni Kontrol Etmek: Güneydoğu Amerika Birleşik Devletleri Herbaryum Portalı için Taksonomik Kavram Çözümü." Franz, Nico, Edward Gilbert, Bertram Ludäscher ve Alan Weakley. 2016. Araştırma Fikirleri ve Sonuçları 2 (Eylül): e10610.
  7. ^ EBird / Clements Dünya Kuşları Kontrol Listesi: v2019 Clements, J. F., T. S. Schulenberg, M.J. Iliff, S. M. Billerman, T.A. Fredericks, B. L. Sullivan ve C.L. Wood. 2019.
  8. ^ Handbook of the Birds of the World ve BirdLife International dünya kuşlarının dijital kontrol listesi. Sürüm 4. HBW and BirdLife International (Aralık 2019)
  9. ^ IOC Dünya Kuş Listesi (v10.1) Gill F, D Donsker & P Rasmussen (Eds). 2020.
  10. ^ Howard ve Moore The Birds of the World'ün Tam Kontrol Listesi, sürüm 4.1 (İndirilebilir kontrol listesi) Christidis vd. 2018.
  11. ^ "Avibase - Dünya Kuş Veritabanı". avibase.bsc-eoc.org.
  12. ^ "Avibase - Dünya Kuş Veritabanı". avibase.bsc-eoc.org.
  13. ^ "Küresel Evrimsel İzolasyon Önlemleri, Yakın Kutup ve Neotropik Kuş Topluluklarındaki Önemli Yerel Koruma Türlerini Yakalayabilir." Redding, David W., Arne O. Mooers, Çağan H. Şekercioğlu ve Ben Collen. 2015. Royal Society B'nin Felsefi İşlemleri: Biyolojik Bilimler 370 (1662): 20140013.
  14. ^ "Austral ve Neotropical America'da Koruma: Zorluklara Eşit Bilimsel Kapasite Oluşturma." Rodríguez, Jon Paul, Javier A. Simonetti, Andrea Premoli ve Miguel Ângelo Marini. 2005. Koruma Biyolojisi 19 (3): 969–72.
  15. ^ "DNA Metabarkodlama ile Açığa Çıkarılan Beklenmedik Kuş-Tüy Akarı İlişkileri Dinamik Bir Ekoevrim Senaryosunu Ortaya Çıkarıyor." Doña, Jorge, David Serrano, Sergey Mironov, Alicia Montesinos ‐ Navarro ve Roger Jovani. 2019. Moleküler Ekoloji 28 (2): 379–90.
  16. ^ "İnsan Patojen Zenginliği ve Yaygınlığının Küresel Etmenleri." Dunn, Robert R., T. Jonathan Davies, Nyeema C. Harris ve Michael C. Gavin. 2010. Royal Society B: Biyolojik Bilimler 277 (1694): 2587–95 Bildirileri.
  17. ^ "Uzlaşı Sınıflamasına Alternatif Olarak Muhalefeti Koordine Etmek: Biyo-Ontolojiler için Sistematiğin Öngörülerinden." Sterner, Beckett, Joeri Witteveen ve Nico Franz. 2020. Yaşam Bilimleri Tarihi ve Felsefesi 42 (1): 8.
  18. ^ "Taksonomi Çoğulculuğa İhtiyaç Duyar, Ama Kontrollü ve Yönetilebilir.". Minelli, Alessandro. 2020. Megataxa 1 (1): 9–18.
  19. ^ "Omurgalı Takson Adı Çözünürlüğü için Standartlaştırılmış Referans Veri Kümesi." Zermoglio, Paula F., Robert P. Guralnick ve John R. Wieczorek. 2016. PLoS ONE 11 (1): e0146894.
  20. ^ "Kuzey Amerika Kuşlarının kontrol listesi (çevrimiçi)." Chesser, R.T., K. J. Burns, C. Cicero, J.L. Dunn, A.W. Kratter, I.J. Lovette, P. C. Rasmussen, J. V. Remsen, Jr., D. F. Stotz ve K. Winker. 2019. Amerikan Ornitoloji Derneği.
  21. ^ "Vikiveri takson projesi".

Referanslar

  • Mitch, Leslie (2004), "Kartalların ve Serçelerin Cesaret Ettiği Yer", Bilim, 304: 935, JSTOR  3836936
  • Dickinson, Edward C. (2016), "Ornitolojik İsimlendirmenin Temellerini Güçlendirmek: Sherborn'un ve Richmond'un Bibliyografik Keşif Tarihi Mirasındaki Boşlukları Doldurmak.", ZooKeys (550): 107–134, doi:10.3897 / zookeys.550.9546, PMID  26877660

Dış bağlantılar