Azurosidin 1 - Azurocidin 1

AZU1
Mevcut yapılar
PDB	İnsan UniProt araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1A7S, 1AE5, 1FY1, 1FY3
Tanımlayıcılar
Takma adlar	AZU1, AZAMP, AZU, CAP37, HBP, HUMAZUR, NAZC, hHBP, azurocidin 1
Harici kimlikler	OMIM: 162815 HomoloGene: 74404 GeneCard'lar: AZU1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 19 (insan)
Son	832,018 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• heparin bağlama; • peptidaz aktivitesi; • GO: 0001948 protein bağlama; • heparan sülfat proteoglikan bağlanması; • toksik madde bağlama; • serin tipi endopeptidaz aktivitesi;
Hücresel bileşen	• zar; • azurofil granülü; • azurofil granül membran; • hücre dışı eksozom; • zarın dışsal bileşeni; • hücre dışı bölge; • hücre dışı; • azurofil granül lümen;
Biyolojik süreç	• MHC sınıf II biyosentetik işleminin pozitif düzenlenmesi; • fagositozun pozitif düzenlenmesi; • apoptotik sürecin olumsuz düzenlenmesi; • protein kinaz C sinyali; • mikroglial hücre aktivasyonu; • proteoliz; • pozitif kemotaksisin indüksiyonu; • monosit aktivasyonu; • kemotaksis; • vasküler geçirgenliğin düzenlenmesi; • gen ifadesinin pozitif düzenlenmesi; • makrofaj kemotaksisi; • protein kinaz C-aktive eden G-protein bağlı reseptör sinyal yolu; • bakteriye savunma tepkisi; • peptidil-treonin fosforilasyonunun pozitif düzenlenmesi; • bakterinin nötrofil aracılı öldürülmesi; • Gram negatif bakteriye karşı savunma tepkisi; • hücre kemotaksisi; • hücresel ekstravazasyon; • Tahrik edici cevap; • hücre içi kalsiyum kaynağı kullanarak kalsiyum aracılı sinyalleşme; • glial hücre göçü; • hücre yapışmasının pozitif düzenlenmesi; • protein kinaz aktivitesinin pozitif düzenlenmesi; • nötrofil degranülasyonu;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	566
	n / a
	ENSG00000278624; ENSG00000172232
	n / a
	P20160
	n / a
	NM_001700
	n / a
	NP_001691
	n / a
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle

Azurosidin Ayrıca şöyle bilinir katyonik antimikrobiyal protein CAP37 veya heparin bağlayıcı protein (HBP) bir protein insanlarda kodlanır AZU1 gen.^[3]^[4]

Fonksiyon

Azurofil granülleri, uzman lizozomlar of nötrofil mikroorganizmaların öldürülmesinde rol oynayan en az 10 protein içerir. Bu gen tarafından kodlanan protein, monosit kemotaktik ve antibakteriyel aktiviteye sahip bir azurofil granül antimikrobiyal proteindir. Aynı zamanda önemli bir çok işlevli inflamatuar aracı.^[5] Bu proteini, nötrofil elastaz 2 ve proteinaz 3'ü kodlayan genler, 19pter kromozomunda bulunan bir kümede bulunur. 3 genin tümü koordineli olarak ifade edilir ve bunların protein ürünleri nötrofil farklılaşması sırasında birlikte azurofil granüllerine paketlenir.^[4]

Yapısı

Azurocidin 1 yapısının (psödoproteaz) aynı üst aileden Chymotrypsin (fonksiyonel proteaz) ile karşılaştırılması

Bu kodlanmış protein, proteazların PA klanının bir üyesidir, ancak bir serin proteinaz değildir, çünkü aktif bölge serin ve histidin kalıntıları değiştirilerek onu bir sözde enzim.^[6]

Klinik önemi

Ateşli hastalarda HBP'nin yüksek plazma seviyeleri, hastanın gelişme riskinin yüksek olduğunu gösterir. sepsis ile dolaşım çökmesi.^[7]

Referanslar

^ ^a ^b ^c ENSG00000172232 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000278624, ENSG00000172232 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Morgan JG, Sukiennicki T, Pereira HA, Spitznagel JK, Guerra ME, Larrick JW (Kasım 1991). "İnsan granülositlerinden mikrobisidal ve kemotaktik bir protein olan serin proteaz homolog CAP37 / azurosidin için cDNA'nın klonlanması". J Immunol. 147 (9): 3210–4. PMID 1919011.
^ ^a ^b "Entrez Geni: AZU1 azurosidin 1 (katyonik antimikrobiyal protein 37)".
^ Soehnlein, Oliver; Lindbom, Lennart (2009). "Nötrofil kaynaklı azurosidin bağışıklık sistemini uyarır". Lökosit Biyolojisi Dergisi. 85 (3): 344–351. doi:10.1189 / jlb.0808495. ISSN 1938-3673. PMID 18955543. S2CID 23637918.
^ Iversen, L. F .; Kastrup, J. S .; Bjørn, S. E .; Rasmussen, P. B .; Wiberg, F. C .; Flodgaard, H. J .; Larsen, I. K. (1997). "HBP'nin yapısı, serin proteinaz katlamalı çok işlevli bir protein". Doğa Yapısal Biyoloji. 4 (4): 265–268. doi:10.1038 / nsb0497-265. ISSN 1072-8368. PMID 9095193. S2CID 19949043.
^ Linder A, Christensson B, Herwald H, Björck L, Akesson P (Ekim 2009). "Heparin bağlayıcı protein: sepsiste dolaşım yetmezliğinin erken bir belirteci". Clin. Infect. Dis. 49 (7): 1044–50. doi:10.1086/605563. PMID 19725785.

Dış bağlantılar

İnsan AZU1 genom konumu ve AZU1 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

daha fazla okuma

Morgan JG, Pereira HA, Sukiennicki T, vd. (1992). "İnsan nötrofil granül katyonik proteini CAP37, enflamatuar proteinazlarla homolojiyi paylaşan spesifik bir makrofaj kemotaksinidir". Adv. Tecrübe. Med. Biol. Deneysel Tıp ve Biyolojideki Gelişmeler. 305: 89–96. doi:10.1007/978-1-4684-6009-4_11. ISBN 978-1-4684-6011-7. PMID 1755383.
Watorek W (2004). "Azurocidin - çok işlevli bir enflamatuar aracı olarak işlev gören inaktif serin proteinaz homoloğu". Açta Biochim. Pol. 50 (3): 743–52. doi:10.18388 / abp.2003_3665. PMID 14515154.
Zimmer M, Medcalf RL, Fink TM, ve diğerleri. (1992). "Miyelomonosit soyunda koordineli olarak ifade edilen üç insan elastaz benzeri gen, 19pter'de tek bir genetik lokus olarak düzenlenmiştir". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 89 (17): 8215–9. doi:10.1073 / pnas.89.17.8215. PMC 49888. PMID 1518849.
Green BG, Weston H, Ashe BM, ve diğerleri. (1991). "PMN elastazları: insan izozimlerinin özgüllüğünün ve diğer türlerden enzimin substratlara ve inhibitörlere karşı karşılaştırılması". Arch. Biochem. Biophys. 286 (1): 284–92. doi:10.1016 / 0003-9861 (91) 90042-H. PMID 1897955.
Flodgaard H, Ostergaard E, Bayne S, vd. (1991). "Domuz ve insan kaynaklı iki yeni nötrofil lökosit türevi proteininin kovalent yapısı. Güçlü monosit ve fibroblast kemotaktik aktivitelere sahip nötrofil elastaz homologları". Avro. J. Biochem. 197 (2): 535–47. doi:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb15942.x. PMID 2026172.
Almeida RP, Melchior M, Campanelli D, vd. (1991). "İnsan nötrofil azurosidinin tamamlayıcı DNA dizisi, serin proteazlara geniş homolojisi olan bir antibiyotik". Biochem. Biophys. Res. Commun. 177 (2): 688–95. doi:10.1016 / 0006-291X (91) 91843-2. PMID 2049091.
Pohl J, Pereira HA, Martin NM, Spitznagel JK (1990). "Yapısal olarak nötrofil elastaza benzer bir insan nötrofil granülünden türetilmiş antibakteriyel ve monosit spesifik kemotaktik glikoprotein olan CAP37'nin amino asit dizisi". FEBS Lett. 272 (1–2): 200–4. doi:10.1016 / 0014-5793 (90) 80484-Z. PMID 2226832. S2CID 36779510.
Campanelli D, Detmers PA, Nathan CF, Gabay JE (1990). "Azurocidin ve nötrofillerden homolog bir serin proteaz. Farklı antimikrobiyal ve proteolitik özellikler". J. Clin. Yatırım. 85 (3): 904–15. doi:10.1172 / JCI114518. PMC 296509. PMID 2312733.
Pereira HA, Shafer WM, Pohl J, vd. (1990). "CAP37, monosit spesifik aktiviteye sahip insan nötrofilden türetilmiş bir kemotaktik faktör". J. Clin. Yatırım. 85 (5): 1468–76. doi:10.1172 / JCI114593. PMC 296594. PMID 2332502.
Wilde CG, Snable JL, Griffith JE, Scott RW (1990). "Nötrofil elastaza aktif bölge homolojisi ile iki azurfil granül proteazının karakterizasyonu". J. Biol. Kimya. 265 (4): 2038–41. PMID 2404977.
Pereira HA, Spitznagel JK, Pohl J, vd. (1990). "37 kD insan nötrofil granül katyonik proteini olan CAP 37, enflamatuar proteinazlarla homolojiyi paylaşır". Hayat Bilimi. 46 (3): 189–96. doi:10.1016 / 0024-3205 (90) 90104-Y. PMID 2406527.
Gabay JE, Scott RW, Campanelli D, vd. (1989). "İnsan polimorfonükleer lökositlerinin antibiyotik proteinleri". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 86 (14): 5610–4. doi:10.1073 / pnas.86.14.5610. PMC 297672. PMID 2501794.
Pereira HA, Erdem I, Pohl J, Spitznagel JK (1993). "CAP37'ye dayalı sentetik bakterisidal peptit: 37 kDa'lık bir insan nötrofil granülü ile ilişkili katyonik antimikrobiyal protein, monositler için kemotaktik". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 90 (10): 4733–7. doi:10.1073 / pnas.90.10.4733. PMC 46587. PMID 8506327.
Chertov O, Michiel DF, Xu L, vd. (1996). "Defensin-1, defensin-2 ve CAP37 / azurosidin'in interlökin-8 ile uyarılan nötrofillerden salınan T hücresi kemoatraktan proteinler olarak belirlenmesi". J. Biol. Kimya. 271 (6): 2935–40. doi:10.1074 / jbc.271.6.2935. PMID 8621683.
Iversen LF, Kastrup JS, Bjørn SE, ve diğerleri. (1997). "HBP'nin yapısı, serin proteinaz katlamalı çok işlevli bir protein". Nat. Struct. Biol. 4 (4): 265–8. doi:10.1038 / nsb0497-265. PMID 9095193. S2CID 19949043.
Karlsen S, Iversen LF, Larsen IK, vd. (1998). "İnsan HBP / CAP37 / azurosidinin atomik çözünürlük yapısı". Açta Crystallogr. D. 54 (Pt 4): 598–609. doi:10.1107 / S0907444997016193. PMID 9761855.
Olofsson AM, Vestberg M, Herwald H, vd. (1999). "Mitokondriyal bölmelere hedeflenen heparin bağlayıcı protein, endotel hücrelerini apoptozdan korur". J. Clin. Yatırım. 104 (7): 885–94. doi:10.1172 / JCI6671. PMC 408551. PMID 10510329.
Lindmark A, Garwicz D, Rasmussen PB, vd. (1999). "İnsan HBP / CAP37 / azurocidin'in biyosentezinin, işlenmesinin ve sınıflandırılmasının karakterizasyonu". J. Leukoc. Biol. 66 (4): 634–43. doi:10.1002 / jlb.66.4.634. PMID 10534120. S2CID 27897421.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 19 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000172232 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000278624, ENSG00000172232 - Topluluk, Mayıs 2017

[2] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid1919011-3] Morgan JG, Sukiennicki T, Pereira HA, Spitznagel JK, Guerra ME, Larrick JW (Kasım 1991). "İnsan granülositlerinden mikrobisidal ve kemotaktik bir protein olan serin proteaz homolog CAP37 / azurosidin için cDNA'nın klonlanması". J Immunol. 147 (9): 3210–4. PMID 1919011.

[entrez-4] "Entrez Geni: AZU1 azurosidin 1 (katyonik antimikrobiyal protein 37)".

[5] Soehnlein, Oliver; Lindbom, Lennart (2009). "Nötrofil kaynaklı azurosidin bağışıklık sistemini uyarır". Lökosit Biyolojisi Dergisi. 85 (3): 344–351. doi:10.1189 / jlb.0808495. ISSN 1938-3673. PMID 18955543. S2CID 23637918.

[6] Iversen, L. F .; Kastrup, J. S .; Bjørn, S. E .; Rasmussen, P. B .; Wiberg, F. C .; Flodgaard, H. J .; Larsen, I. K. (1997). "HBP'nin yapısı, serin proteinaz katlamalı çok işlevli bir protein". Doğa Yapısal Biyoloji. 4 (4): 265–268. doi:10.1038 / nsb0497-265. ISSN 1072-8368. PMID 9095193. S2CID 19949043.

[pmid19725785-7] Linder A, Christensson B, Herwald H, Björck L, Akesson P (Ekim 2009). "Heparin bağlayıcı protein: sepsiste dolaşım yetmezliğinin erken bir belirteci". Clin. Infect. Dis. 49 (7): 1044–50. doi:10.1086/605563. PMID 19725785.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]