B3GALT5 - B3GALT5

B3GALT5
Tanımlayıcılar
Takma adlar	B3GALT5, B3GalT-V, B3GalTx, B3T5, GLCT5, beta-1,3-GalTase 5, beta-3-Gx-T5, beta3Gal-T5, beta-1,3-galaktosiltransferaz 5
Harici kimlikler	OMIM: 604066 MGI: 2136878 HomoloGene: 13230 GeneCard'lar: B3GALT5
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 21 (insan)
Son	39,673,137 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 16 (fare)
Son	96,319,859 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• transferaz aktivitesi; • UDP-galaktoz: beta-N-asetilglukozamin beta-1,3-galaktosiltransferaz aktivitesi; • galaktosiltransferaz aktivitesi; • transferaz aktivitesi, glikozil grupları transfer etme; • asetilgalaktosaminiltransferaz aktivitesi;
Hücresel bileşen	• zarın ayrılmaz bileşeni; • Golgi zarı; • Golgi cihazı; • endoplazmik retikulum; • zar;
Biyolojik süreç	• protein glikosilasyonu; • protein N-bağlantılı glikosilasyon; • oligosakkarit biyosentetik süreci;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	10317
	93961
	ENSG00000183778
	ENSMUSG00000074892
	Q9Y2C3
	Q9JI67
NM_033173; NM_001278650; NM_006057; NM_033170; NM_033171;
	NM_033172; NM_001356336; NM_001356338; NM_001356339
	NM_001122993; NM_033149; NM_001358389; NM_001358390
NP_001265579; NP_006048; NP_149360; NP_149361; NP_149362;
	NP_001343265; NP_001343267; NP_001343268
	NP_001116465; NP_149161; NP_001345318; NP_001345319
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Beta-1,3-galaktosiltransferaz 5 bir enzim insanlarda kodlanır B3GALT5 gen.^[5]^[6]

Bu gen, beta-1,3- üyesidir.galaktosiltransferaz (beta3GalT) gen ailesi. Bu aile tip II kodlar zara bağlı glikoproteinler farklı donör substratları kullanan çeşitli enzimatik işlevlerle (UDP-galaktoz ve UDP-N-asetilglukozamin ) ve farklı alıcı şekerler (N-asetilglukozamin, galaktoz, N-asetilgalaktozamin ). Beta3GalT genleri, Drosophila Brainiac geni ile uzaktan ilişkilidir ve proteine sahiptir. kodlama dizisi tek bir ekson. Beta3GalT proteinleri ayrıca beta4GalT veya alpha3GalT proteinlerinde bulunmayan korunmuş dizileri içerir. Bu enzimler tarafından sentezlenen karbonhidrat zincirleri tip 1 olarak adlandırılırken, beta4GalT enzimleri tip 2 karbonhidrat zincirlerini sentezler. Tip 1: tip 2 zincirlerin oranı, embriyojenez. Tarafından dizi benzerliği beta3GalT genleri en az iki gruba ayrılır: beta3GalT4 ve diğer 4 beta3GalT geni (beta3GalT1-3, beta3GalT5). Bu gen, tip 1'in sentezi için en olası adayı kodlar. Lewis antijenleri sıklıkla yüksek olduğu tespit edilen gastrointestinal ve pankreas kanserleri. Kodlanmış protein, N-bağlantılı glikoproteinler ile inaktiftir ve müsin glikosilasyon. Farklı olan beş transkript varyantı tanımlanmıştır. 5 'UTR. Tüm transkript varyantları aynı proteini kodlar.^[6]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000183778 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000074892 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Isshiki S, Togayachi A, Kudo T, Nishihara S, Watanabe M, Kubota T, Kitajima M, Shiraishi N, Sasaki K, Andoh T, Narimatsu H (Haziran 1999). "Yeni bir UDP-galaktozun klonlanması, ekspresyonu ve karakterizasyonu: beta-N-asetilglukozamin beta1,3-galaktosiltransferaz (beta3Gal-T5), kolorektal ve pankreas epitelinde tip 1 zincir sentezinden sorumlu ve bunlardan türetilen tümör hücreleri". J Biol Kimya. 274 (18): 12499–507. doi:10.1074 / jbc.274.18.12499. PMID 10212226.
^ ^a ^b "Entrez Geni: B3GALT5 UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,3-galaktosiltransferaz, polipeptit 5".

daha fazla okuma

Amado M, Almeida R, Schwientek T, Clausen H (2000). "Büyük galaktosiltransferaz gen ailelerinin tanımlanması ve karakterizasyonu: tüm fonksiyonlar için galaktosiltransferazlar". Biochim. Biophys. Açta. 1473 (1): 35–53. doi:10.1016 / S0304-4165 (99) 00168-3. PMID 10580128.
Kalyanaraman VS, Rodriguez V, Veronese F, vd. (1990). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1'in salgılanan, doğal gp120 ve gp160 karakterizasyonu". AIDS Res. Hum. Retrovirüsler. 6 (3): 371–80. doi:10.1089 / yardım.1990.6.371. PMID 2187500.
Pal R, Hoke GM, Sarngadharan MG (1989). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1'in zarf glikoproteinlerinin işlenmesi ve olgunlaşmasında oligosakaritlerin rolü". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 86 (9): 3384–8. Bibcode:1989PNAS ... 86.3384P. doi:10.1073 / pnas.86.9.3384. PMC 287137. PMID 2541446.
Dewar RL, Vasudevachari MB, Natarajan V, Salzman NP (1989). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 zarf glikoproteinlerinin biyosentezi ve işlenmesi: monensinin glikosilasyon ve taşıma üzerindeki etkileri". J. Virol. 63 (6): 2452–6. doi:10.1128 / jvi.63.6.2452-2456.1989. PMC 250699. PMID 2542563.
Kozarsky K, Penman M, Basiripour L, vd. (1989). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 zarf proteininin glikosilasyonu ve işlenmesi". J. Acquir. Bağışıklık Eksikliği. Syndr. 2 (2): 163–9. PMID 2649653.
Robinson WE, Montefiori DC, Mitchell WM (1988). "Mannosil kalıntılarının insan immün yetmezlik virüsü tip 1 (HIV-1) patogenezinde rol oynadığına dair kanıt". AIDS Res. Hum. Retrovirüsler. 3 (3): 265–82. doi:10.1089 / yardım.1987.3.265. PMID 2829950.
Zhou D, Berger EG, Hennet T (1999). "Bir insan UDP-galaktozunun moleküler klonlaması: GlcNAcbeta1,3GalNAc beta1, 3 galaktosiltransferaz geni O-bağlantılı bir core3-uzama enzimini kodlamaktadır". Avro. J. Biochem. 263 (2): 571–6. doi:10.1046 / j.1432-1327.1999.00541.x. PMID 10406968.
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, vd. (2000). "İnsan kromozomu 21'in DNA dizisi". Doğa. 405 (6784): 311–9. Bibcode:2000Natur.405..311H. doi:10.1038/35012518. PMID 10830953.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Dunn CA, Medstrand P, Mager DL (2004). "Bir endojen retroviral uzun terminal tekrarı, kolondaki insan β1,3-galaktosiltransferaz 5 için baskın hızlandırıcıdır". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 100 (22): 12841–6. doi:10.1073 / pnas.2134464100. PMC 240706. PMID 14534330.
Sato T, Furukawa K (2004). "Kanser hücrelerinde insan beta-1,4-galaktosiltransferaz V geninin transkripsiyonel regülasyonu: transkripsiyon faktörü Sp1'in temel rolü". J. Biol. Kimya. 279 (38): 39574–83. doi:10.1074 / jbc.M405805200. PMID 15263012.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH Tam Boy cDNA Projesinin Durumu, Kalitesi ve Genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Dunn CA, van de Lagemaat LN, Baillie GJ, Mager DL (2006). "Kullanıma hazır mobil promoter olarak endojen retrovirüs uzun terminal tekrarları: primat beta3GAL-T5 durumu". Gen. 364: 2–12. doi:10.1016 / j.gene.2005.05.045. PMID 16112824.
Hu YH, Warnatz HJ, Vanhecke D, vd. (2006). "Hücre dizisi tabanlı hücre içi lokalizasyon taraması, insan kromozom 21 proteinlerinin yeni fonksiyonel özelliklerini ortaya çıkarır". BMC Genomics. 7: 155. doi:10.1186/1471-2164-7-155. PMC 1526728. PMID 16780588.

Dış bağlantılar

B3GALT5 insan gen konumu UCSC Genom Tarayıcısı.
B3GALT5 insan geni ayrıntıları UCSC Genom Tarayıcısı.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 21 bir Taslak. Wikipedia'ya şu şekilde yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000183778 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000074892 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10212226-5] Isshiki S, Togayachi A, Kudo T, Nishihara S, Watanabe M, Kubota T, Kitajima M, Shiraishi N, Sasaki K, Andoh T, Narimatsu H (Haziran 1999). "Yeni bir UDP-galaktozun klonlanması, ekspresyonu ve karakterizasyonu: beta-N-asetilglukozamin beta1,3-galaktosiltransferaz (beta3Gal-T5), kolorektal ve pankreas epitelinde tip 1 zincir sentezinden sorumlu ve bunlardan türetilen tümör hücreleri". J Biol Kimya. 274 (18): 12499–507. doi:10.1074 / jbc.274.18.12499. PMID 10212226.

[entrez-6] "Entrez Geni: B3GALT5 UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,3-galaktosiltransferaz, polipeptit 5".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]