BRDT - BRDT
Bromodomain testise özgü protein bir protein insanlarda kodlanır BRDT gen. Üyesidir. Bromodomain ve Ekstra terminal motif (BET) protein ailesi.[5][6]
BRDT, RING3 proteini aile. 2 sahiptir bromodomain motifler ve hızlı hücre içi bozunmaya uğrayan proteinlerin özelliği olan bir PEST dizisi (bir prolin, glutamik asit, serin ve treonin kalıntıları kümesi). Bromodomain, transkripsiyonu düzenleyen proteinlerde bulunur. Bu gen için aynı proteini kodlayan iki transkript varyantı bulunmuştur.[6]
Üç farklı fare modelinin (Brdt nakavt fareler, işlevsel olmayan bir Brdt ifade eden fareler ve ilk bromodomaininden yoksun mutasyona uğramış bir Brdt ifade eden fareler) kullanılması, Brdt'nin bir mayotik ve mayoz sonrası gen ifade programını çalıştırdığını gösterdi. Ayrıca, uzayan spermatidlerde histon hiperasetilasyonundan sonra meydana gelen genom çapında post-mayotik genom yeniden organizasyonunu da kontrol eder.[6][7]
Model organizmalar
| Karakteristik | Fenotip |
|---|---|
| Homozigot canlılık | Normal |
| Doğurganlık | Anormal |
| Vücut ağırlığı | Normal |
| Kaygı | Normal |
| Nörolojik değerlendirme | Normal |
| Kavrama gücü | Normal |
| Sıcak tabak | Normal |
| Dismorfoloji | Normal |
| Dolaylı kalorimetri | Normal |
| Glükoz dayanımı testi | Normal |
| İşitsel beyin sapı yanıtı | Normal |
| DEXA | Normal |
| Radyografi | Anormal[8] |
| Vücut ısısı | Normal |
| Göz morfolojisi | Normal |
| Klinik kimya | Normal |
| Plazma immünoglobulinler | Normal |
| Hematoloji | Normal |
| Mikronükleus testi | Normal |
| Kalp ağırlığı | Normal |
| Kuyruk epidermisi wholemount | Normal |
| Deri Histopatolojisi | Normal |
| Beyin histopatolojisi | Normal |
| Salmonella enfeksiyon | Normal[9] |
| Citrobacter enfeksiyon | Normal[10] |
| Tüm testler ve analizler[11][12] |
Model organizmalar BRDT işlevi çalışmasında kullanılmıştır. Bir koşullu nakavt fare hat, aradı Brdttm1a (EUCOMM) Wtsi[13][14] parçası olarak oluşturuldu Uluslararası Nakavt Fare Konsorsiyumu program - hayvan hastalık modellerini oluşturmak ve ilgilenen bilim adamlarına dağıtmak için yüksek verimli bir mutagenez projesi.[15][16][17]
Erkek ve dişi hayvanlar standartlaştırılmış fenotipik ekran silme işleminin etkilerini belirlemek için.[11][18] Yirmi beş test yapıldı mutant fareler ve iki önemli anormallik gözlendi.[11] Homozigot mutant erkekler yarı doğurgan idi ve her iki cinsiyette daha az sayıda bel ve sakral omurlar.[11]
Erkek doğum kontrol ilaçlarının hedefi olma potansiyeli
BET inhibitörleri gibi JQ1 BRDT'nin kromatin bağlanmasından sorumlu bölgesini bloke eder ve farelerde sperm üretimi, sperm kalitesi ve testisin boyutunda tersine çevrilebilir bir azalmaya neden olur.[19]JQ1'in etki mekanizması, Brdt'nin testise özgü gen ekspresyonunun ve mayoz sonrası kromatin yeniden organizasyonunun bir itici gücü olarak işlevleri dikkate alınarak açıklanabilir.[6][7] BET inhibitörleri ayrıca diğer BET proteinleri BRD2, BRD3 ve BRD4'ü de inhibe ettiğinden, insanlarda geçici erkek kısırlığının ötesinde etkilere sahip olmaları muhtemeldir.
Referanslar
- ^ a b c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000137948 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000029279 - Topluluk, Mayıs 2017
- ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
- ^ Jones MH, Numata M, Shimane M (Ocak 1998). "BRDT'nin tanımlanması ve karakterizasyonu: Bromodomain genleri RING3 ve Drosophila fsh ile ilgili testise özgü bir gen". Genomik. 45 (3): 529–34. doi:10.1006 / geno.1997.5000. PMID 9367677.
- ^ a b c d "Entrez Geni: BRDT bromodomain, testise özgü".
- ^ a b Gaucher J, Boussouar F, Montellier E, Curtet S, Buchou T, Bertrand S, Hery P, Jounier S, Depaux A, Vitte AL, Guardiola P, Pernet K, Debernardi A, Lopez F, Holota H, Imbert J, Wolgemuth DJ , Gérard M, Rousseaux S, Khochbin S (2012). "Bromodomain bağımlı aşamaya özgü erkek genom programlama Brdt tarafından". EMBO J. 31 (19): 3809–20. doi:10.1038 / emboj.2012.233. PMC 3463845. PMID 22922464.
- ^ "Brdt için radyografi verileri". Hoş Geldiniz Güven Sanger Enstitüsü.
- ^ "Salmonella Brdt için enfeksiyon verileri ". Hoş Geldiniz Güven Sanger Enstitüsü.
- ^ "Citrobacter Brdt için enfeksiyon verileri ". Hoş Geldiniz Güven Sanger Enstitüsü.
- ^ a b c d Gerdin AK (2010). "Sanger Fare Genetiği Programı: Nakavt farelerin yüksek verimli karakterizasyonu". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. doi:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
- ^ Fare Kaynakları Portalı, Hoş Geldiniz Güven Sanger Enstitüsü.
- ^ "Uluslararası Nakavt Fare Konsorsiyumu".[kalıcı ölü bağlantı ]
- ^ "Fare Genom Bilişimi".
- ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Bushell, W .; Iyer, V .; Mujica, A. O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Jackson, D .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Nefedov, M .; De Jong, P. J .; Stewart, A. F .; Bradley, A. (2011). "Fare gen işlevinin genom çapında incelenmesi için koşullu bir nakavt kaynağı". Doğa. 474 (7351): 337–342. doi:10.1038 / nature10163. PMC 3572410. PMID 21677750.
- ^ Dolgin E (2011). "Fare kitaplığı nakavt edilecek". Doğa. 474 (7351): 262–3. doi:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Collins FS, Rossant J, Wurst W (2007). "Her Nedene Uygun Bir Fare". Hücre. 128 (1): 9–13. doi:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247.
- ^ van der Weyden L, Beyaz JK, Adams DJ, Logan DW (2011). "Fare genetiği araç seti: işlevi ve mekanizmayı ortaya çıkarma". Genom Biol. 12 (6): 224. doi:10.1186 / gb-2011-12-6-224. PMC 3218837. PMID 21722353.
- ^ "Yapım aşamasında olan bir erkek doğum kontrol hapı mı?". 16 Ağustos 2012. Alındı 17 Ağustos 2012.
Dış bağlantılar
- İnsan BRDT genom konumu ve BRDT gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.
daha fazla okuma
- Zheng Y, Yuan W, Zhou Z, vd. (2005). "Moleküler klonlama ve BRDT geninin yeni bir alternatif ekleme varyantının ifadesi". Int. J. Mol. Orta. 15 (2): 315–21. doi:10.3892 / ijmm.15.2.315. PMID 15647849.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH Tam Boy cDNA Projesinin Durumu, Kalitesi ve Genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Pivot-Pajot C, Caron C, Govin J, vd. (2003). "Testise Özgü Bromodomain İçeren Bir Protein olan BRDT Tarafından Asetilasyona Bağlı Kromatin Yeniden Düzenlenmesi". Mol. Hücre. Biol. 23 (15): 5354–65. doi:10.1128 / MCB.23.15.5354-5365.2003. PMC 165724. PMID 12861021.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). "In Vitro Siteye Özgü Rekombinasyon Kullanarak DNA Klonlama". Genom Res. 10 (11): 1788–95. doi:10.1101 / gr.143000. PMC 310948. PMID 11076863.
- Scanlan MJ, Altorki NK, Gure AO, vd. (2000). "Akciğer kanserinde kanser-testis antijenlerinin ifadesi: yeni bir CT geni, CT9 olarak bromodomain testis spesifik genin (BRDT) tanımı". Yengeç Harfi. 150 (2): 155–64. doi:10.1016 / S0304-3835 (99) 00385-7. PMID 10704737.
- Dhalluin C, Carlson JE, Zeng L, ve diğerleri. (1999). "Histon asetiltransferaz bromodomainin yapısı ve ligandı". Doğa. 399 (6735): 491–6. doi:10.1038/20974. PMID 10365964.