Beta-savunma 2 - Beta-defensin 2 - Wikipedia

DEFB4B
Mevcut yapılar
PDBİnsan UniProt araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarDEFB4B, DEFB4P, defensin beta 4B
Harici kimliklerHomoloGene: 122147 GeneCard'lar: DEFB4B
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 8 (insan)
Chr.Kromozom 8 (insan)[1]
Kromozom 8 (insan)
DEFB4B için genomik konum
DEFB4B için genomik konum
Grup8p23.1Başlat7,414,855 bp[1]
Son7,416,863 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001205266

yok

RefSeq (protein)

NP_001192195
NP_004933

yok

Konum (UCSC)Chr 8: 7,41 - 7,42 Mbyok
PubMed arama[2]yok
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle

Beta-savunma 2 (BD-2) olarak da bilinir cilt antimikrobiyal peptit 1 (SAP1) bir peptid insanlarda kodlanır DEFB4 (savunma, beta 4) gen.[3]

İnsan beta-defensin-2 (hBD-2), lezyonel deride yakın zamanda keşfedilen, sisteinden zengin katyonik düşük moleküler ağırlıklı bir antimikrobiyal peptiddir.

Yapısı

hBD-2, birincil yapısı 64 aminoasit tarafından yapılan bir proteindir. ≤2.4 mM konsantrasyonlarda, hBD-2 monomeriktir.[4] Yapı amfifilik pozitif yükün düzgün olmayan bir yüzey dağılımına sahip ve üç sarmallı, antiparalel dahil olmak üzere birkaç temel yapısal eleman içerir. beta sayfası 2 ve 3 telli beta firkete konformasyon. Diğer yapısal elemanların belirlenmesi kullanılan tekniğe bağlıdır. X-ışını kristalografisi kullanıldığında alfa sarmalı şurada görülebilir N terminali proteinin sonu (PDB kodları: 1fd3​,1fd4Ve 6cs9). NMR kullanılırken bu alfa-sarmal görünmez (PDB kodu: 1e4q), Bununla birlikte, bu yapı, ilk 4 amino asidi eksik olan ve bu tutarsızlığın nedeni olabilecek, hBD-2'nin kesilmiş bir versiyonu kullanılarak belirlendi.

Fonksiyon

Savunmacılar mikrop öldürücü bir aile oluşturur ve sitotoksik tarafından yapılan peptitler nötrofiller. Defensin ailesinin üyeleri, protein dizisi açısından oldukça benzerdir. Beta-defensin 2, yerel olarak düzenlenmiş bir antibiyotik peptididir. iltihap.[5]

İnsan beta-defensin 2, bir dizi epitel hücrelere karşı güçlü antimikrobiyal aktivite sergiler ve Gram negatif bakteriler ve Candida ama Gram pozitif değil S. aureus. Beta-defensin 2'nin cilt ve akciğer dokusunda Gram-negatif enfeksiyonların seyrekliğine katkıda bulunabileceği düşünülmektedir.[6]

hBD-2, epitel hücrelerinin mikroorganizmalar ile temas yoluyla uyarılmasının ardından üretilen ilk insan defensinini temsil eder. P. aeruginosa veya TNF-alfa ve IL-1 beta gibi sitokinler. HBD-2 geni ve proteini yerel olarak şu şekilde ifade edilir: keratinositler iltihaplı deri lezyonları ile ilişkilidir. HBD-2'nin, yüzeyleri enfeksiyondan koruma rolü olan deri ve solunum yolunun lokal epitel savunma sisteminin dinamik bir bileşeni olduğunu ve Gram-negatif bakterilerin neden olduğu deri ve akciğer enfeksiyonlarının olası bir nedenini sağladığını söylemek ilgi çekicidir. oldukça nadir.[6]

Bu proteinin Gram-pozitif bakterilere karşı herhangi bir antibakteriyel aktivitesi olmamasına rağmen, hBD-2 ile diğer proteinler arasında bir sinerji olduğunu gösteren bir çalışma var.[7] Bu sinerjik etkinin bir örneği, bazı suşlar tarafından ayrılmış bir protein olan epiP ile verilebilir. S. epidermidis. epiP ile el ele tutuşan hBD2, öldürme yeteneğine sahiptir S. aureus, insan hastalıklarından sorumlu bir Gram-pozitif bakteri.

Referanslar

  1. ^ a b c ENSG00000275444, ENSG00000285433 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000177257, ENSG00000275444, ENSG00000285433 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  3. ^ Harder J, Bartels J, Christophers E, Schröder JM (Haziran 1997). "İnsan derisinden bir peptit antibiyotik". Doğa. 387 (6636): 861. doi:10.1038/43088. PMID  9202117. S2CID  4354862.
  4. ^ Sawai MV, Jia HP, Liu L, Aseyev V, Wiencek JM, McCray PB, Ganz T, Kearney WR, Tack BF (Nisan 2001). "İnsan beta-defensin-2'nin NMR yapısı, yeni bir alfa-sarmal segmenti ortaya koymaktadır". Biyokimya. 40 (13): 3810–3816. doi:10.1021 / bi002519d. PMID  11300761.
  5. ^ "Entrez Gene: DEFB4 defensin, beta 4".
  6. ^ a b Schröder JM, Harder J (Haziran 1999). "İnsan beta-defensin-2". Uluslararası Biyokimya ve Hücre Biyolojisi Dergisi. 31 (6): 645–651. doi:10.1016 / S1357-2725 (99) 00013-8. PMID  10404637.
  7. ^ Iwase T, Uehara Y, Shinji H, Tajima A, Seo H, Takada K, Agata T, Mizunoe Y (Mayıs 2010). "Staphylococcus epidermidis Esp, Staphylococcus aureus biyofilm oluşumunu ve nazal kolonizasyonu inhibe eder". Doğa. 465 (7296): 346–349. doi:10.1038 / nature09074. PMID  20485435. S2CID  4392908.

Dış bağlantılar

daha fazla okuma