CCT5 (gen) - CCT5 (gene)

CCT5
Tanımlayıcılar
Takma adlar	CCT5, CCT-epsilon, CCTE, HEL-S-69, TCP-1-epsilon, PNAS-102, chaperonin içeren TCP1 alt birimi 5
Harici kimlikler	OMIM: 610150 MGI: 107185 HomoloGene: 6287 GeneCard'lar: CCT5
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 5 (insan)
Son	10,266,389 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 15 (fare)
Son	31,601,804 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• nükleotid bağlanması; • G-protein beta alt birimi bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama; • beta-tübülin bağlanması; • ATP bağlama; • protein katlanmasında rol oynayan protein bağlanması; • katlanmamış protein bağlanması; • mRNA 3'-UTR bağlanması; • mRNA 5'-UTR bağlanması;
Hücresel bileşen	• vücut hücresi; • sentrozom; • miyelin; • mikrotübül düzenleme merkezi; • zona pellucida reseptör kompleksi; • çekirdekçik; • şaperonin içeren T kompleksi; • mikrotübüller; • hücre dışı eksozom; • hücre iskeleti; • sitoplazma; • sitozol;
Biyolojik süreç	• Cajal gövdesine protein lokalizasyonunun pozitif düzenlenmesi; • telomere protein lokalizasyonunun kurulmasının pozitif düzenlenmesi; • virüse tepki; • protein stabilizasyonu; • telomeraz yoluyla telomer bakımının pozitif düzenlenmesi; • toksin nakli; • protein katlanması; • Cajal gövdesine telomeraz RNA lokalizasyonunun pozitif düzenlenmesi; • spermin zona pellucida'ya bağlanması; • 'de novo' protein katlama; • şaperon aracılı protein katlanması;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	22948
	12465
	ENSG00000150753
	ENSMUSG00000022234
	P48643
	P80316
	NM_001306153; NM_001306154; NM_001306155; NM_001306156; NM_012073
	NM_007637; NM_001348035
	NP_001293082; NP_001293083; NP_001293084; NP_001293085; NP_036205
	NP_001334964; NP_031663
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

T-kompleks protein 1 alt birim epsilon bir protein insanlarda kodlanır CCT5 gen.^[5]

Fonksiyon

Bu gen, bir moleküler şaperonu kodlar. TRiC karmaşık. Bu kompleks, her biri sekiz farklı protein içeren iki özdeş yığın halkadan oluşur. Katlanmamış polipeptitler, kompleksin merkezi boşluğuna girer ve ATP'ye bağımlı bir şekilde katlanır. Kompleks, aktin ve tübülin dahil olmak üzere çeşitli proteinleri katlar. Bu genin alternatif transkripsiyonel birleşme varyantları gözlemlendi, ancak tam olarak karakterize edilmedi.^[5]

Etkileşimler

CCT5 (gen), etkileşim ile PPP4C.^[6]^[7]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000150753 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000022234 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b "Entrez Geni: TCP1, alt birim 5 (epsilon) içeren CCT5 şaperonin".
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (Ekim 2008). "PP4R4 / KIAA1622, fosfoprotein fosfataz 4 ile yeni bir stabil sitosolik kompleks oluşturur". Biyolojik Kimya Dergisi. 283 (43): 29273–84. doi:10.1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.
^ Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (Kasım 2005). "Cisplatin duyarlılığında yer alan yeni, evrimsel olarak korunmuş protein fosfataz kompleksi" (PDF). Moleküler ve Hücresel Proteomik. 4 (11): 1725–40. doi:10.1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.

Dış bağlantılar

İnsan CCT5 genom konumu ve CCT5 gen ayrıntıları sayfası UCSC Genom Tarayıcısı.

daha fazla okuma

Roobol A, Holmes FE, Hayes NV, Baines AJ, Carden MJ (Nisan 1995). "Sitoplazmik şaperonin kompleksleri, in vitro gelişen nöritlere girer ve tek hücreler içindeki alt birim bileşiminde farklılık gösterir". Hücre Bilimi Dergisi. 108 (4): 1477–88. PMID 7615668.
Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, Tabata S, Ishikawa K, Kawarabayasi Y, Kotani H (1995). "Tanımlanamayan insan genlerinin kodlama dizilerinin tahmini. III. İnsan hücre hattı KG-1'den cDNA klonlarının analizi ile çıkarılan 40 yeni genin (KIAA0081-KIAA0120) kodlama dizileri". DNA Araştırması. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
Kubota H, Hynes G, Carne A, Ashworth A, Willison K (Şubat 1994). "TCP-1 içeren şaperoninin ıraksak alt birimlerini kodlayan altı Tcp-1 ilişkili genin tanımlanması". Güncel Biyoloji. 4 (2): 89–99. doi:10.1016 / S0960-9822 (94) 00024-2. PMID 7953530. S2CID 31300131.
Liou AK, Willison KR (Temmuz 1997). "CCT mikro komplekslerinin alt birim bileşiminden CCT'de (şaperonin içeren TCP1) alt birim oryantasyonunun açıklanması". EMBO Dergisi. 16 (14): 4311–6. doi:10.1093 / emboj / 16.14.4311. PMC 1170057. PMID 9250675.
Roperch JP, Lethrone F, Prieur S, Piouffre L, Israeli D, Tuynder M, Nemani M, Pasturaud P, Gendron MC, Dausset J, Oren M, Amson RB, Telerman A (Tem 1999). "SIAH-1, protein katlanması, açılması ve trafiğinin düzenlenmesini içeren bir ağ aracılığıyla apoptozu ve tümör baskılamasını destekler: p53 ve p21 (Waf1) ile ortak efektörlerin belirlenmesi". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 96 (14): 8070–3. doi:10.1073 / pnas.96.14.8070. PMC 22189. PMID 10393949.
Yanaka N, Kobayashi K, Wakimoto K, Yamada E, Imahie H, Imai Y, Mori C (Mayıs 2000). "Murin kisimo lokusunun insersiyonel mutasyonu spermatogenezde bir kusura neden oldu". Biyolojik Kimya Dergisi. 275 (20): 14791–4. doi:10.1074 / jbc.C901047199. PMID 10747865.
Yoo BC, Kim SH, Cairns N, Fountoulakis M, Lubec G (Ocak 2001). "Alzheimer hastalığı olan hastaların beyinlerinde moleküler şaperonların bozuk ifadesi". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 280 (1): 249–58. doi:10.1006 / bbrc.2000.4109. PMID 11162507.
Yoo BC, Vlkolinsky R, Engidawork E, Cairns N, Fountoulakis M, Lubec G (Nisan 2001). "Down sendromlu hastaların beyninde moleküler şaperonların farklı ifadesi". Elektroforez. 22 (6): 1233–41. doi:10.1002 / 1522-2683 () 22: 6 <1233 :: AID-ELPS1233> 3.0.CO; 2-M. PMID 11358150.
Yokota S, Yanagi H, Yura T, Kubota H (Eylül 2001). "Sitosolik şaperonin içeren t-kompleks polipeptidi 1, hücre döngüsü sırasında substrat bağlama ve katlama aktiviteleri ile birlikte belirli bir alt birim türünün içeriğini değiştirir". Avrupa Biyokimya Dergisi / FEBS. 268 (17): 4664–73. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02393.x. PMID 11532003.
McCormack EA, Llorca O, Carrascosa JL, Valpuesta JM, Willison KR (Ağustos 2001). "Beta-aktin küçük ve büyük alanlarını birbirine bağlayan bir menteşedeki nokta mutasyonları, sitozolik şaperonin CCT'ye bağlanan sıkışmış katlanma ara ürünleriyle sonuçlanır". Yapısal Biyoloji Dergisi. 135 (2): 198–204. doi:10.1006 / jsbi.2001.4385. PMID 11580269. Tarih değerlerini kontrol edin: | yıl = / | tarih = uyumsuz (Yardım)
Llorca O, Martín-Benito J, Gómez-Puertas P, Ritco-Vonsovici M, Willison KR, Carrascosa JL, Valpuesta JM (Ağustos 2001). "Ökaryotik şaperonin CCT ve substratları aktin ve tübülin arasındaki etkileşimin analizi". Yapısal Biyoloji Dergisi. 135 (2): 205–18. doi:10.1006 / jsbi.2001.4359. PMID 11580270. Tarih değerlerini kontrol edin: | yıl = / | tarih = uyumsuz (Yardım)
Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (Aralık 2002). "SMRT-histon deasetilaz 3 bastırma kompleksinin montajı TCP-1 halka kompleksini gerektirir". Genler ve Gelişim. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735. Tarih değerlerini kontrol edin: | yıl = / | tarih = uyumsuz (Yardım)
Ludwig A, Dietel M, Lage H (2003). "Klasik ve atipik çoklu ilaca dirençli mide karsinom hücrelerinde farklı şekilde ifade edilen genlerin belirlenmesi". Antikanser Araştırması. 22 (6A): 3213–21. PMID 12530067.
Imai Y, Soda M, Murakami T, Shoji M, Abe K, Takahashi R (Aralık 2003). "Parkine bitişik insan geninin bir ürünü, Lewy cisimciklerinin bir bileşenidir ve Pael reseptörünün neden olduğu hücre ölümünü bastırır". Biyolojik Kimya Dergisi. 278 (51): 51901–10. doi:10.1074 / jbc.M309655200. PMID 14532270. Tarih değerlerini kontrol edin: | yıl = / | tarih = uyumsuz (Yardım)
Lehner B, Sanderson CM (Temmuz 2004). "İnsan mRNA bozulması için bir protein etkileşim çerçevesi". Genom Araştırması. 14 (7): 1315–23. doi:10.1101 / gr.2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Lukov GL, Hu T, McLaughlin JN, Hamm HE, Willardson BM (Haziran 2005). "Phosducin benzeri protein, G proteini betagamma dimer düzeneği için bir moleküler şaperon görevi görür". EMBO Dergisi. 24 (11): 1965–75. doi:10.1038 / sj.emboj.7600673. PMC 1142607. PMID 15889144.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (Eylül 2005). "Bir insan protein-protein etkileşim ağı: proteomu açıklama için bir kaynak". Hücre. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 5 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000150753 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000022234 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-5] "Entrez Geni: TCP1, alt birim 5 (epsilon) içeren CCT5 şaperonin".

[pmid18715871-6] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (Ekim 2008). "PP4R4 / KIAA1622, fosfoprotein fosfataz 4 ile yeni bir stabil sitosolik kompleks oluşturur". Biyolojik Kimya Dergisi. 283 (43): 29273–84. doi:10.1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

[pmid16085932-7] Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (Kasım 2005). "Cisplatin duyarlılığında yer alan yeni, evrimsel olarak korunmuş protein fosfataz kompleksi" (PDF). Moleküler ve Hücresel Proteomik. 4 (11): 1725–40. doi:10.1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]