Kafeterya roenbergensis - Cafeteria roenbergensis

Kafeterya roenbergensis
Cafeteria roenbergensis FENCHEL ve D J PATTERSON şematik çizim.svg
bilimsel sınıflandırma Düzenle
Clade:SAR
Şube:Bigyra
Sınıf:Bicosoecophyceae
Sipariş:Bicosoecales
Aile:Kafeterya
Cins:Kafeterya
Fenchel ve Patterson, 1988
Türler:
C. roenbergensis
Binom adı
Kafeterya roenbergensis
Fenchel ve Patterson, 1988[1]

Kafeterya roenbergensis Küçük bakteri içeren deniz kamçılı. Danimarkalı deniz ekolojisti tarafından keşfedildi Tom Fenchel ve onun ve taksonomist tarafından adlandırıldı David J. Patterson 1988 yılında. üç cinsin birinde yer almaktadır. bisiksoesitler ve bilinen iki taneden ilk keşfedilen Kafeterya Türler. Bicosoesidler diatomları, kahverengi ve altın algleri içeren geniş bir gruba, stramenopiles'e aittir. Heterokonta opalinidler ve aktinofrid heliozoa gibi protozoa ve oomycete mantarları. Tür, esas olarak, üzerinde otladığı yüksek bakteri konsantrasyonlarının bulunduğu kıyı sularında bulunur. Doyurucu iştahı, bakteri popülasyonlarının düzenlenmesinde önemli bir rol oynar.[2]

Fizyoloji

Kafeterya roenbergensis hafif basık, böbrek şeklinde bicosoesid. Hücresi tipik olarak 3 ila 10 μm arasındadır ve yaklaşık 20 μm³ hacme sahiptir.[3] Renksizdir ve iki eşit büyüklükte kamçıya sahiptir. Pürüzsüz kamçı, arkaya doğru açılıdır, daha kısadır ve hareketsiz hücrelerdeki alt tabakalara yapışır, ancak hareketli hücreler. Tüylü kamçı, bir yay çizerek öne doğru sapsız hücreler. Kafeterya bir ökaryotik organizma, bu nedenle tipik organelleri içerir. mitokondri ve çekirdek.[3]

Kafeterya roenbergensis aseksüel olarak çoğalır ikiye bölünerek çoğalma[kaynak belirtilmeli ]hücre bölünmeden önce flagella ve iç organellerin kopyalanması. Bu tür için hiçbir cinsel aktivite bilinmemektedir. Hücreler 10 saatin altında çoğalabilir.

Davranış

Kafeterya roenbergensis bir süspansiyon besleyicidir, yani askıdaki bakterileri, birincil besin kaynağını ve sudan diğer partikül maddeleri filtreleyerek beslenir.[4] Onun iki kamçı alt tabakalara besleme, hareket ve bağlanmayı kolaylaştırır. Ön kamçı, hareket ve beslenmeden sorumludur. Hücreyi hızlı bir spiral hareketle iter. Beslenme sırasında, saniyede yaklaşık 100 mikrometre hareket eden bir su akımı oluşturmak için saniyede yaklaşık 40 kez atar. Bu akım, bakterileri ağız kısımlarına getirir. Yiyecek, ventral taraf olarak adlandırılan flagella tabanının altında yutulur. Hareketsiz olarak C. roenbergensis hücreler, (kendilerini bir alt tabakaya sabitlemeyi tercih eden hücreler) posterior flagellum, organizmanın beslenirken bir alt tabakaya bağlanmasına yardımcı olur.[5] Flagella, 'kökçük' şeritleri ve hücre altı halatlarla sabitlenir. Gibi davranırlar iskelet ve ayrıca ağız bölgesini destekler.

Ekoloji

Bakteriyel nanoflagellatlar, genel grup C. roenbergensis aittir, okyanusların önemli bir bölümünü oluşturur ' tek hücreli tatlı su, toprak ve diğer habitatlarda yaşayanların yanı sıra topluluklar. Pek çok habitatta bakteri popülasyonlarını "otlarken" kontrol eden birincil bakteri tüketicisi oldukları bildirilmektedir.[6]

Yetişme ortamı

Kafeterya roenbergensis incelenen tüm okyanuslarda bulunmuştur, ancak özellikle kıyı sularında yaygındır.[2] Bu protistler, "mikrobiyal topluluklar" olarak bilinen bir tür biyosferde meydana gelir. Bu, çok düşük miktarlarda bulundukları, kolayca tespit edilemedikleri ve yalnızca aşağıdaki gibi özel izolasyon teknikleri kullanılarak geri alınabilecekleri ve izole edilebilecekleri anlamına gelir. akış sitometrisi.[7] Ishigaki ve Sleigh (2001) bunu buldu C. roenbergensis Otladıkları bakteri konsantrasyonu 2.0 × 10'un altına düştüğünde çoğalmayı bıraktı7 hücre ml−1.[8] Diğer kamçılılar çok daha düşük bakteri konsantrasyonlarında çoğalmayı başardı, bu da bakteri konsantrasyonunun bir sınırlayıcı faktör için Kafeterya. Flagellatlar, kamçılarıyla ağızlarına bakteri toplama konusunda çeşitli yeteneklere sahiptir ve bu çalışma, Kafeterya türler diğer kamçılılardan daha düşük olabilir, çünkü Kafeterya genellikle özeldir nişler yüksek bakteri konsantrasyonları ile.[4]

Virüs

Dev bir virüs, Kafeterya roenbergensis virüsü (CroV) enfekte eder ve parçalanmasına neden olur C. roenbergensis.[9] Etkisi CroV doğal popülasyonları hakkında C. roenbergensis bilinmeyen kalır; bununla birlikte, virüsün çok konağa özgü olduğu ve diğer yakın ilişkili organizmaları enfekte etmediği bulunmuştur.[4] Kafeterya roenbergensis de ikinci bir virüsle enfekte olmuştur. Mavirüs virofajı, sadece CroV varlığında çoğaltılabilir.[10] Bu virüs, CroV replikasyonuna müdahale eder ve bu da C. roenbergensis hücreler. Mavirüs hücrelerin genomuna entegre olabilir C. roenbergensisve böylece nüfusa bağışıklık kazandırır [11]

Taksonomi

Kafeterya "Heterotrofik grubu ". Cinsinde bilinen bir başka türü daha vardır, Kafeterya minuta1990 yılında Larsen ve Patterson tarafından tropikal deniz çökeltilerinde yaşayan bulundu.[6]

İsim

İlk tanımlayan iki tür otoritesinden biri olan deniz biyoloğu Tom Fenchel C. roenbergensis, chromalveolate ismiyle ilgili şaka yaptığı biliniyor: "Rønbjerg'de bir deniz alanı kursu sırasında yeni bir siliyer türü bulduk ve adını Kafeterya roenbergensis yerel kafeteryada birçok akşam yemeği tartışmasından sonra doymak bilmez ve gelişigüzel iştahı nedeniyle. "- Tom Fenchel[12]

Mitokondriyal Genom

Kafeterya roenbergensis arasında benzersiz ökaryotlar çünkü oldukça kompakt mitokondriyal genetik şifre % 3,4'ten azını içeren intronlar. Bazı kaynaklar, mitokondriyal genomunun hiç intron içermediğini iddia ediyor.[13] Mitokondriyal tercüme kod C. roenbergensis bilinen en yakın akrabalarına kıyasla standart değildir, Phytophthora infestans ve Ochromonas danica. Gibi davranmak yerine kodonu durdur, içinde Kafeterya, UGA kodları triptofan.[14]

Kültür

Çünkü büyümeleri kolay kültür, Kafeterya roenbergensis Bu türün ökaryotlar arasında en işlevsel olarak kompakt DNA'ya sahip olduğunu ortaya çıkaran genomik ve ekolojik çalışmalar gibi daha ayrıntılı çalışmalara konu olmuştur.[2] Kültürde iken, Kafeterya beslendi Vibrio bakteri. Park ve Simpson tarafından 2010 yılında yapılan bir testte, Kafeterya hücreler en iyi 3 ppm ila 100 ppm tuzlulukta büyür, ancak daha yüksek konsantrasyonlarda yaşayamaz.[15]

Referanslar

  1. ^ Fenchel, T., Patterson, D. J. (1988). Kafeterya roenbergensis kas. gen., kas. sp., deniz planktonundan bir heterotrofik mikroflagellat. Deniz Mikrobiyal Gıda Ağları, 3, 9–19, [1].
  2. ^ a b c O'Kelly, C. J .; G. Burger (29 Temmuz 1994). "Kafeterya roenbergensis MtDNA ". Evrimsel ve Bütünleştirici Genomik. PID. Alındı 8 Ocak 2012.
  3. ^ a b Otto, K .; D. Weichart ve S. Kjelleberg (1997). "Denizler arasında plazmid transferi Vibrio heterotrofik mikroflagellat tarafından avlanma sırasında suşlar Kafeterya reonbergensis". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 63 (2): 749–752. doi:10.1128 / AEM.63.2.749-752.1997.
  4. ^ a b c Massana, Ramon; Javier Del Campo; Christian Dinter; Ruben Sommaruga (2007). "Deniz heterotrofik kamçılı popülasyonunun çökmesi Kafeterya roenbergensis viral enfeksiyonla ". Çevresel Mikrobiyoloji. 9 (11): 2660–2669. doi:10.1111 / j.1462-2920.2007.01378.x. PMID  17922751. S2CID  30191542.
  5. ^ Guiry, M. D .; Guiry, G.M. (2012). "Yosun Tabanı". İrlanda Ulusal Üniversitesi, Galway. Alındı 16 Ocak 2012.
  6. ^ a b Cavalier-Smith, T., Chatton, Moestrup, T. Fenchel, D. J. Patterson ve Larsen. "Taksonomi Tarayıcısı: Algaebase." Algaebase :: Dünyanın Yosunlarını Listeleme. Yosun Tabanı. Ağ. 16 Ocak 2012. <http://www.algaebase.org/browse/taxonomy/?id=6698 >.
  7. ^ Munn, C.B. (2011). Deniz Mikrobiyolojisi: Ekoloji ve Uygulamalar. New York: Garland Bilimi.
  8. ^ Thomas Ishigaki; M.A. Kızak (2001). "Üç nanoflagellat için iki farklı sıcaklıkta otlatma özellikleri ve büyüme verimlilikleri Vibrio üç farklı konsantrasyonda bakteri ". Mikrobiyal Ekoloji. 41 (3): 264–271. doi:10.1007 / s002480000060. JSTOR  4251819. PMID  11391464.
  9. ^ Fischer, M. G .; Allen, M. J .; Wilson, W. H .; Suttle, C.A. (2010). "Dikkat çekici bir gen tamamlayıcısına sahip dev virüs, deniz zooplanktonunu enfekte eder" (PDF). Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 107 (45): 19508–19513. Bibcode:2010PNAS..10719508F. doi:10.1073 / pnas.1007615107. PMC  2984142. PMID  20974979.
  10. ^ Fischer MG, Suttle CA (Nisan 2011). "Büyük DNA transpozonlarının kaynağında bir virofaj". Bilim. 332 (6026): 231–4. Bibcode:2011Sci ... 332..231F. doi:10.1126 / science.1199412. PMID  21385722.
  11. ^ Fischer MG, Hackl (Aralık 2016). "Konak genom entegrasyonu ve virofaj mavirüsünün dev virüs kaynaklı yeniden aktivasyonu". Doğa. 540 (7632): 288–91. Bibcode:2016Natur.540..288F. doi:10.1038 / nature20593. PMID  27929021.
  12. ^ Fenchel, T. (1988). "Deniz planktonları besin zincirleri". Ekoloji ve Sistematiğin Yıllık Değerlendirmesi. 19: 19–38. doi:10.1146 / annurev.es.19.110188.000315.
  13. ^ Patterson, David J. "Kafeterya roenbergensis. "Encyclopedia of Life. Web. 9 Ocak 2012. <http://eol.org/pages/912371/overview >
  14. ^ O'Kelly, C.J., B.F. Lang ve G. Burger. "Kafeterya roenbergensis –Mitokondriyal Genom Organizasyonu ... "Evrimsel ve Bütünleştirici Genomik. Montreal Üniversitesi. Web. 16 Ocak 2012. <http://megasun.bch.umontreal.ca/ogmp/projects/croen/gen.html >.
  15. ^ Park, J. S .; Simpson, A.G. B. (2010). "Deniz formlarından farklı olan halotolerant Bicosoecida ve Placididea'nın (Stramenopila) karakterizasyonu ve heterotrofik stramenopillerdeki tuzluluk tercihinin filogenetik modeli". Çevresel Mikrobiyoloji. 12 (5): 1173–1184. doi:10.1111 / j.1462-2920.2010.02158.x. PMID  20132281. S2CID  20449399.