Candidatus Carsonella ruddii - Candidatus Carsonella ruddii

Candidatus Carsonella ruddii
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
Bakteri
Şube:
Proteobakteriler
Sınıf:
Gama Proteobakterileri
Sipariş:
sınıflandırılmamış
Cins:
Candidatus Carsonella
Türler:
CA. C. ruddii
Binom adı
Candidatus Carsonella ruddii
Thao vd. 2000

Candidatus Carsonella ruddii bir mecbur etmek endosimbiyotik Gama Proteobakteri[1] en küçüğünden biriyle genomlar karakterize edilmiş herhangi bir bakterinin.[2]

Endosimbiyoz

Tür bir endosymbiont tüm türlerde bulunan floem bitki özüyle beslenen böcekler olarak bilinir pisil.[3][4] Endosymbionts, bakteriyom.

C. ruddii, konukçu böceğiyle olan ilişkisinde tamamen parazitik değildir; konakçıya bazı temel amino asitler sağlar. Bu nedenle, muhtemelen bir evrimsel süreçtedir. organel, benzer mitokondri bir endosimbiyondan evrimleşen ökaryotik hücreler.[5]

Genetik şifre

2006'da genomu CA. C. ruddii suşu Pv (Carsonella-Pv) Hackberry yaprak sapı gall psyllid, Pachypsylla venusta, şurada sıralandı: RIKEN Japonya'da ve Arizona Üniversitesi. Genomun 159,662'lik dairesel bir kromozomdan oluştuğu gösterildi. baz çiftleri ve yüksek kodlama yoğunluğuna (% 97) sahip olduğunu ve birçok örtüşen genler ve azaltılmış gen uzunluğu. Tahmini sayısı genler 182 idi, aynı zamanda kayıtlardaki en düşük seviye (NCBI-Genom ). Karşılaştırıldığında, Mycoplasma genitalium Herhangi bir serbest yaşayan organizmanın en küçük genomuna sahip olan, 521 genlik bir genoma sahiptir. Yaşam için gerekli olduğu düşünülen çok sayıda genin eksik olduğu görülüyor, bu da türlerin başarmış olabileceğini düşündürüyor. organel benzeri durum.[2]

Sıralanması sırasında, C. ruddii'nin karakterize edilen tüm bakteri türleri arasında en küçük genoma sahip olduğu düşünülüyordu.[6] Nasuia deltocephalinicola artık bilinen en küçük bakteri genomuna (112kb) sahip olduğu kabul edilmektedir.[7]

C. ruddii ve ilgili türler, aktif olarak gen kaybı.[8]

Referanslar

  1. ^ Spaulding, A. W .; von Dohlen, C.D. (1998). "Psyllids'de (Hemiptera: Sternorrhyncha) Bakteriyel Endosymbiyontların Filogenetik Karakterizasyonu ve Moleküler Evrimi". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 15 (11): 1506–1513. doi:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025878. PMID  12572614.
  2. ^ a b Nakabachi A, Yamashita A, Toh H, Ishikawa H, Dunbar H, Moran N, Hattori M (2006). "Bakteriyel endosymbiont Carsonella'nın 160 kilobazlık genomu". Bilim. 314 (5797): 267. doi:10.1126 / science.1134196. PMID  17038615.
  3. ^ Thao, M.L. (2000). "Psyllidlerin ve Bunların Birincil Prokaryotik Endosymbiyontlarının Konusu". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 66 (7): 2898–2905. doi:10.1128 / aem.66.7.2898-2905.2000. PMC  92089. PMID  10877784.
  4. ^ Thao, M.L. (2001). "Dikey olarak iletilen psyllid endosymbionts (Candidatus Carsonella ruddii) 'nin atpAGD ve rpoC'ye dayalı filogenetik analizi: 16S-23S rDNA'dan türetilmiş filogeniyle karşılaştırmalar". Güncel Mikrobiyoloji. 42 (6): 419–21. doi:10.1007 / s002840010240. PMID  11381334.
  5. ^ Tortora (1), Funke (2), Vaka (3), Gerard J (1), Berdell R (2), Christine L (3) (2016). Mikrobiyoloji: Giriş (12. Baskı). ABD: Pearson. s. 315. ISBN  978-0321929150.CS1 bakimi: birden çok ad: yazarlar listesi (bağlantı)
  6. ^ Moran, Nancy A .; Bennett, Gordon M. (8 Eylül 2014). "En Küçük Minik Genomlar". Mikrobiyolojinin Yıllık İncelemesi. 68 (1): 195–215. doi:10.1146 / annurev-micro-091213-112901. PMID  24995872.
  7. ^ Bennett, G. M .; Moran, N.A. (5 Ağustos 2013). "Küçük, Daha Küçük, En Küçük: Floem Besleyen Bir Böcekte Antik İkili Ortakyaşamların Kökenleri ve Evrimi". Genom Biyolojisi ve Evrim. 5 (9): 1675–1688. doi:10.1093 / gbe / evt118. PMC  3787670. PMID  23918810.
  8. ^ Sloan, D. B .; Moran, N.A. (19 Temmuz 2012). "Psyllidlerin Birincil ve İkincil Bakteriyel Simbiyiyonları Arasında Genom Azaltma ve Birlikte Evrim". Moleküler Biyoloji ve Evrim. 29 (12): 3781–3792. doi:10.1093 / molbev / mss180. PMC  3494270. PMID  22821013.

Dış bağlantılar