Kompozit transpozon - Composite transposon

Bir bileşik transpozon işlev olarak benzerdir basit transpozonlar ve ekleme dizisi (IS) öğeleri protein kodlamasına sahip olması DNA transposaz enzimleri tarafından tanınabilen ters çevrilmiş, tekrarlanan dizilerle çevrili bölümler. Bir kompozit transpozon bununla birlikte, tam kopyalar olabilen veya olmayabilen iki ayrı IS öğesi tarafından çevrelenmiştir. Her bir IS elemanının ayrı ayrı hareket etmesi yerine, bir IS elemanından diğerine uzanan tüm DNA uzunluğu tek bir tam birim olarak aktarılır. Kompozit transpozonlar ayrıca genellikle bir veya daha fazla gen taşır. antibiyotik direnci.

Memeli genomlarında SINE'lerle çevrili

İki SINE, araya giren tek kopya DNA dizisini yandan kuşatmak ve harekete geçirmek için birlikte hareket edebilir. Bu, sığır beta globin geninin 710 bp'lik bir DNA sekansı için bildirilmiştir.[1] DNA düzenlemesi, varlığı tam olarak teyit edilen bir kompozit transpozon oluşturur. sığır genomik dizisi mobilize sekans, contig'de sığır kromozomu 15'te bulunabilir. NW_001493315.1 nükleotidler # 1085432–1086142 ve kaynak sekans, contig'de sığır kromozomu 2'de bulunabilir NW_001501789.2 nükleotidler # 1096679–1097389. Diğer sığır genomik bölgelerinde ve diğer memeli genomlarında benzer kompozit transpozonların bulunması muhtemeldir. Uygun algoritmalar ile tespit edilebilirler.

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Zelnick CR, Burks DJ, Duncan CH (Aralık 1987). "İnek fetal globin genine kompozit bir transpozon 3 ', diziye özgü bir faktörü bağlar". Nükleik Asitler Res. 15 (24): 10437–53. doi:10.1093 / nar / 15.24.10437. PMC  339954. PMID  2827124.