Kapsamlı Antibiyotik Direnci Veritabanı - Comprehensive Antibiotic Resistance Database - Wikipedia

Kapsamlı Antibiyotik Direnci Veritabanı
McArthur Lab Logo.png
İçerik
AçıklamaKapsamlı Antibiyotik Direnci Veritabanı, antimikrobiyal direncin moleküler temeli ile ilgili veriler, modeller ve algoritmalar sağlar.
Veri tipleri
yakalanan		Antimikrobiyal direnç genleri ve fenotipleri
OrganizmalarBakteri
İletişim
Araştırma MerkeziMcMaster Üniversitesi
Birincil alıntıPMID  27789705
Giriş
İnternet sitesikart.mcmaster.CA
URL'yi indirİndir
Çeşitli
Yer imlerine eklenebilir
varlıklar		Evet

Kapsamlı Antibiyotik Direnci Veritabanı (CARD) bir biyolojik veritabanı referans bilgilerini toplayan ve düzenleyen antimikrobiyal direnç genler, proteinler ve fenotipler.[1] [2] Veritabanı, tüm ilaç sınıflarını ve direnç mekanizmalarını kapsar ve verilerini bir ontolojiye dayalı olarak yapılandırır. CARD veritabanı, antimikrobiyal direnç genlerini kapsayan ilk kaynaklardan biriydi.[3] Kaynak aylık olarak güncellenir [4] ve kullanıcıların yeni dizilenmiş genomlarda potansiyel antibiyotik direnç genlerini bulmasına olanak tanıyan araçlar sağlar. CARD'a eklenen bilgiler şunları içerir: antibiyotik direnç genleri, antibiyotik ontolojisi ve antibiyotik direnci etki mekanizması. Şu anda Haziran 2020 itibariyle, CARD 4463 Ontoloji Terimi, 2984 Referans Sırası, 1334 SNP, 2685 Yayın, 3030 AMR Saptama Modeli içermektedir. Resistome tahminleri: 88 patojen, 9560 kromozom, 21362 plazmit, 102181 WGS düzeneği, 222011 alel.[4]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Alcock BP, Raphenya AR, Lau TTY, Tsang KK, Bouchard M, Edalatmand A; et al. (2020). "CARD 2020: kapsamlı antibiyotik direnci veri tabanı ile antibiyotik resistome sürveyansı". Nükleik Asitler Res. 48 (D1): D517 – D525. doi:10.1093 / nar / gkz935. PMC  7145624. PMID  31665441.CS1 bakım: birden çok isim: yazarlar listesi (bağlantı)
  2. ^ Jia, B; Raphenya, AR; Alcock, B; Waglechner, N; Guo, P; Tsang, KK; Lago, BA; Dave, BM; Pereira, S; Sharma, AN; Doshi, S; Courtot, M; Lo, R; Williams, LE; Frye, JG; Elsayegh, T; Sardar, D; Westman, EL; Pawlowski, AC; Johnson, TA; Brinkman, FS; Wright, GD; McArthur, AG (4 Ocak 2017). "CARD 2017: kapsamlı antibiyotik direnci veritabanının genişletilmesi ve model merkezli kürasyonu". Nükleik Asit Araştırması. 45 (D1): D566 – D573. doi:10.1093 / nar / gkw1004. PMC  5210516. PMID  27789705.
  3. ^ McArthur, AG; Waglechner, N; Nizam, F; Yan, A; Azad, MA; Baylay, AJ; Bhullar, K; Canova, MJ; De Pascale, G; Ejim, L; Kalan, L; Kral, AM; Koteva, K; Morar, M; Mulvey, MR; O'Brien, JS; Pawlowski, AC; Piddock, LJ; Spanogiannopoulos, P; Sutherland, AD; Tang, I; Taylor, PL; Thaker, M; Wang, W; Yan, M; Yu, T; Wright, GD (Temmuz 2013). "Kapsamlı antibiyotik direnci veritabanı". Antimikrobiyal Ajanlar ve Kemoterapi. 57 (7): 3348–57. doi:10.1128 / AAC.00419-13. PMC  3697360. PMID  23650175.
  4. ^ a b "CARD web sitesi". Alındı 5 Haziran 2020.