Hesaplamalı mikroskopi - Computational microscopy

Hesaplamalı mikroskopi alt alanı hesaplamalı görüntüleme, nesnelerin mikroskobik görüntülerini yakalamak için algoritmik yeniden yapılandırmayı algılama ile birleştiren.[1][2] Hesaplamalı mikroskopide kullanılan algoritmalar, yinelemeli teknikler veya makine öğrenimi kullanarak toplu bir 2D veya 3D görüntü oluşturmak için genellikle çeşitli aydınlatma veya ölçümler kullanılarak yakalanan birkaç görüntünün bilgilerini birleştirir.[3][4] Hesaplamalı mikroskopinin dikkate değer biçimleri şunları içerir: süper çözünürlüklü floresan mikroskobu, kantitatif faz görüntüleme, ve Fourier pikografisi.[5][6][7][8][9] Hesaplamalı mikroskopi, bilgisayar Bilimi ve optik.[10][11][12]

Referanslar

  1. ^ Ikoma, Hayato. "Numune analizi için hesaplamalı mikroskopi." PhD tezi, Massachusetts Institute of Technology, 2014.
  2. ^ de Haan, Kevin, Yair Rivenson, Yichen Wu ve Aydoğan Özcan. "Optik mikroskopide derin öğrenme tabanlı görüntü yeniden yapılandırma ve iyileştirme." IEEE 108 tutanakları, no. 1 (2019): 30-50.
  3. ^ Waller, Laura ve Lei Tian. "Hesaplamalı görüntüleme: 3D mikroskopi için makine öğrenimi." Nature 523.7561 (2015): 416-417.
  4. ^ Yeh, Li-Hao, Shwetadwip Chowdhury, Nicole A. Repina ve Laura Waller. "3B faz ve floresan hesaplamalı mikroskopi için benek yapılı aydınlatma." Biyomedikal optik ekspres 10, no. 7 (2019): 3635-3653.
  5. ^ McLeod, Euan ve Aydoğan Özcan. "Geleneksel olmayan görüntüleme yöntemleri: hesaplamalı mikroskopi ve kompakt uygulamalar." Fizikte İlerleme Raporları 79, no. 7 (2016): 076001.
  6. ^ Horstmeyer, Roarke. Hesaplamalı mikroskopi: Megapikselleri gigapiksellere çevirme. 2016.
  7. ^ Pham, Minh. "Hesaplamalı Mikroskopide Yeni Algoritmalar." Doktora tezi, UCLA, 2020.
  8. ^ Chen, Claire Lifan, Ata Mahjoubfar, Li-Chia Tai, Ian K. Blaby, Allen Huang, Kayvan Reza Niazi ve Bahram Jalali. "Etiketsiz hücre sınıflandırmasında derin öğrenme." Bilimsel Raporlar 6 (2016): 21471.
  9. ^ Yuan, Shuai ve Chrysanthe Preza. "Küresel sapmanın 3B hesaplamalı floresan mikroskopi görüntüleme üzerindeki etkisini azaltmak için noktaya yayılmış işlev mühendisliği." Optics Express 19, hayır. 23 (2011): 23298-23314.
  10. ^ Hollmann, Joseph L., Andrew K. Dunn ve Charles A. DiMarzio. "Embriyo görüntülemede hesaplamalı mikroskopi." Optik Mektuplar 29, hayır. 19 (2004): 2267-2269.
  11. ^ Eggeling, Christian ve Alf Honigmann. "Boşluğu kapatmak: biyomembran organizasyonunu ortaya çıkarmak için optik ve hesaplamalı mikroskopi yaklaşımı." Biochimica et Biophysica Açta (BBA) -Biomembranes 1858, no. 10 (2016): 2558-2568.
  12. ^ Greenbaum, Alon, Yibo Zhang, Alborz Feizi, Ping-Luen Chung, Wei Luo, Shivani R. Kandukuri ve Aydoğan Özcan. "Lens içermeyen çip üstü mikroskopi kullanarak patoloji slaytlarının geniş alanlı hesaplamalı görüntülemesi." Science translational Medicine 6, no. 267 (2014): 267ra175-267ra175.