Siklik peptid - Cyclic peptide

α-Amanitin
Basitrasin
Siklosporin

Siklik peptitler vardır polipeptit zincirleri dairesel bir bağ dizisi içeren. Bu, peptidin amino ve karboksil uçları arasındaki bir bağlantı yoluyla olabilir, örneğin siklosporin; amino ucu ile bir yan zincir arasındaki bir bağlantı, örneğin basitrasin; karboksil ucu ve bir yan zincir, örneğin kolistin; veya iki yan zincir veya daha karmaşık düzenlemeler, örneğin Amanitin. Doğada birçok siklik peptid keşfedilmiştir ve diğerleri laboratuvarda sentezlenmiştir. Uzunlukları sadece iki amino asit kalıntısından yüzlercee kadar değişir. Doğası gereği sıklıkla antimikrobiyal veya toksiktirler; tıpta, örneğin antibiyotikler ve immünosupresif ajanlar gibi çeşitli uygulamaları vardır.[1]İnce Katmanlı Kromatografi (TLC), biyokütleden ham ekstraktta siklik peptitleri saptamak için uygun bir yöntemdir.[2]

Sınıflandırma

Siklik peptitler, halkayı oluşturan bağ türlerine göre sınıflandırılabilir.

  • Siklosporin A gibi homodetik siklik peptitler, halkanın yalnızca normal peptit bağlarından (yani bir kalıntının alfa karboksilinden diğerinin alfa aminine) oluştuğu peptitlerdir. Bu tür en küçük türler 2,5-diketopiperazinler,[3] bir dipeptidin siklizasyonundan türetilmiştir.
  • Siklik izopeptidler, mikrosistin ve basitrasin'de olduğu gibi, bir kalıntının yan zinciri ile başka bir kalıntının alfa karboksil grubu arasındaki bağlantı gibi en az bir alfa olmayan amid bağı içerir.
  • Döngüsel depsipeptidler, gibi aureobasidin A ve HUN-7293, amidlerden birinin yerine en az bir lakton (ester) bağlantısına sahiptir. Bazı siklik depsipeptidler, C-terminal karboksil ile zincirdeki bir Thr veya Ser kalıntısının yan zinciri arasında siklize edilir, örneğin kahalalide F, theonellapeptolide ve didemnin B.
  • Gibi bisiklikler Amanitins ve falloidinler genellikle yan zincirlerin ikisi arasında bir köprüleme grubu içerir. Amatoksinlerde bu, bir sülfoksit Trp ve Cys kalıntıları arasındaki köprü. Diğer bisiklik peptitler arasında ekinomisin, triostin A ve Celogentin C bulunur.
  • Çok sayıda bi ve monosiklik peptid vardır ve bunlar bir disülfür bağı ikisi arasında sisteinler, oksitosin dikkate değer bir örnek.

Biyosentez

Bitkilerdeki siklik peptidler iki aşamalı bir işlemle sentezlenir; tercüme doğrusal bir peptit zincirinin ve bunun ardından proteaz benzeri bir enzimin aktiviteleri veya başka yollarla döngüsel bir yapıya dönüşümü.[4][5][6]

Özellikler ve uygulamalar

Siklik peptitler, sindirim sürecine aşırı derecede dirençli olma eğilimindedir ve bu da onları yeni oral ilaçlar üzerinde çalışan bilim adamlarının ilgisini çeker.[7]

Örnekler şunları içerir:

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Jensen, Knud (2009/09/01). Biyofarmasötik Uygulamalar için Peptit ve Protein Tasarımı. John Wiley & Sons. ISBN  9780470749715.
  2. ^ Wenyan, Xu; Jun, Tang; Changjiu, Ji; Wenjun, He; Ninghua, Tan (2008). "Bitkilerde siklotitlerin saptanması için TLC kimyasal yönteminin uygulanması". Bilim Bülteni. 53 (11): 1671–1674. doi:10.1007 / s11434-008-0178-8.
  3. ^ Borthwick AD (Mayıs 2012). "2,5-Diketopiperazinler: Sentez, Reaksiyonlar, Tıbbi Kimya ve Biyoaktif Doğal Ürünler". Kimyasal İncelemeler. 112 (7): 3641–3716. doi:10.1021 / cr200398y. PMID  22575049.
  4. ^ Barber, Carla J. S .; Pujara, Pareshkumar T .; Reed, Darwin W .; Chiwocha, Shiela; Zhang, Haixia; Covello Patrick S. (2013). "Caryophyllaceae Bitki Ailesinin Bir Üyesinde Doğrusal Öncülerden Döngüsel Peptitlerin İki Aşamalı Biyosentezi, Serin Proteaz Benzeri Bir Enzim Tarafından Siklizasyonu İçerir". Biyolojik Kimya Dergisi. 288 (18): 12500–12510. doi:10.1074 / jbc.M112.437947. PMC  3642298. PMID  23486480.
  5. ^ Wenyan Xu; et al. (2011). "Ribozomal olmayan peptit sentazlarından bağımsız olarak sentezlenen öncüllerden siklopeptit üretiminde çeşitli mekanizmalar". Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 43 (10): 757–762. doi:10.1093 / abbs / gmr062. PMC  3180235. PMID  21764803.
  6. ^ Wenyan Xu; et al. "Bitki Siklopeptitleri ve Olası Biyosentetik Mekanizmalar". Alıntı dergisi gerektirir | günlük = (Yardım)
  7. ^ David J. Craik (17 Mart 2006). "Kesintisiz Proteinler Gevşek Uçlarını Bağlar". Bilim. 311 (5767): 1563–7. doi:10.1126 / science.1125248. PMID  16543448.

Dış bağlantılar