DEFA4 - DEFA4

DEFA4
Mevcut yapılar
PDB	İnsan UniProt araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1ZMM
Tanımlayıcılar
Takma adlar	DEFA4, DEF4, HNP-4, HP-4, HP4, defensin alfa 4
Harici kimlikler	OMIM: 601157 HomoloGene: 48059 GeneCard'lar: DEFA4
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 8 (insan)
Son	6,938,306 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• protein homodimerizasyon aktivitesi;
Hücresel bileşen	• Golgi lümeni; • hücre dışı bölge; • azurofil granülü; • hücre dışı; • özel granül lümen;
Biyolojik süreç	• savunma tepkisi; • bakteriye savunma tepkisi; • nötrofil degranülasyonu; • doğuştan bağışıklık sistemi; • antimikrobiyal peptidin aracılık ettiği antimikrobiyal humoral immün yanıt; • T hücre kemotaksisi; • antimikrobiyal humoral yanıt; • diğer organizmanın hücrelerinin öldürülmesi; • mantara karşı savunma tepkisi; • mukozada doğal bağışıklık tepkisi; • antibakteriyel humoral yanıt; • Gram negatif bakteriye karşı savunma tepkisi; • Gram pozitif bakteriye karşı savunma tepkisi; • diğer organizmada zar bozulması; • lipopolisakkaride hücresel yanıt;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	1669
	n / a
	ENSG00000164821; ENSG00000285318
	n / a
	P12838
	n / a
	NM_001925
	n / a
	NP_001916
	n / a
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle

Defensin, alfa 4 (DEFA4), Ayrıca şöyle bilinir nötrofil savunması 4 veya HNP4, bir insan savunma peptid tarafından kodlanan DEFA4 gen.^[3]^[4] HNP4 şu şekilde ifade edilir: granüller of nötrofil ev sahibini nerede savunur bakteri^[5] ve virüsler.^[6]

Fonksiyon

Savunucular bir peptid ailesinin sitotoksik mikrobisitler dahil doğuştan gelen bağışıklık.^[7] Defensin ailesinin üyeleri, korunan altı kişi ile ayırt edilir.sistein motif. HNP4 dahil olmak üzere birçok insan alfa defensin geni, kromozom 8. DEFA4 Görünüşe göre kodlama bölgesi içinde yeni bir çoğaltmanın sonucu olan ekstra 83 bazlı bir segment ile diğer defensin genlerinden farklıdır. HNP4 inhibe eder kortikotropin uyarılmış kortikosteron üretim.^[3]

Referanslar

^ ^a ^b ^c ENSG00000285318 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000164821, ENSG00000285318 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b "Entrez Geni: DEFA4; defensin, alfa 4, kortikostatin (Homo sapiens)".
^ Wu Z, Ericksen B, Tucker K, vd. (2004). "İnsan alfa-defensinleri 4-6 sentezi ve karakterizasyonu". J Pept Res. 64 (3): 118–25. doi:10.1111 / j.1399-3011.2004.00179.x. PMID 15317502.
^ Ericksen B, Wu Z, Lu W, Lehrer RI (2005). "Altı İnsan α-Defensininin Antibakteriyel Aktivitesi ve Özgünlüğü". Antimicrob. Ajanlar Kemoterapi. 49 (1): 269–75. doi:10.1128 / AAC.49.1.269-275.2005. PMC 538877. PMID 15616305.
^ Wu Z, Cocchi F, Gentles D, vd. (3 Ocak 2005). "İnsan nötrofil alfa-defensin 4, in vitro HIV-1 enfeksiyonunu inhibe eder". FEBS Lett. 579 (1): 162–6. doi:10.1016 / j.febslet.2004.11.062. PMID 15620707. S2CID 84062495.
^ T Ganz; M E Selsted; D Szklarek; et al. (1985). "Defensinler. İnsan nötrofillerinin doğal peptit antibiyotikleri". J Clin Invest. 76 (4): 1427–1435. doi:10.1172 / JCI112120. PMC 424093. PMID 2997278.

daha fazla okuma

Szyk A, Wu Z, Tucker K, vd. (2006). "İnsan α-defensinleri HNP4, HD5 ve HD6'nın kristal yapıları". Protein Bilimi. 15 (12): 2749–60. doi:10.1110 / ps.062336606. PMC 2242434. PMID 17088326.
Ebegümeci EB, Harris A, Salzman N, vd. (1996). "İnsan enterik defensinleri. Gen yapısı ve gelişimsel ifade". J. Biol. Kimya. 271 (8): 4038–45. doi:10.1074 / jbc.271.8.4038. PMID 8626737.
Bevins CL, Jones DE, Dutra A, vd. (1996). "İnsan enterik defensin genleri: kromozomal harita konumu ve olası evrimsel ilişkiler için bir model". Genomik. 31 (1): 95–106. doi:10.1006 / geno.1996.0014. PMID 8808285.
Gabay JE, Scott RW, Campanelli D, vd. (1989). "İnsan polimorfonükleer lökositlerinin antibiyotik proteinleri". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 86 (14): 5610–4. doi:10.1073 / pnas.86.14.5610. PMC 297672. PMID 2501794.
Davila S, Froeling FE, Tan A, vd. (2010). "Hepatit B aşısına yapılan bir konakçı yanıt çalışmasında yeni genetik bağlantılar tespit edildi". Genler İmmün. 11 (3): 232–8. doi:10.1038 / gen.2010.1. PMID 20237496.
Kim E, Lee JE, Namkung JH, vd. (2009). "Tek nükleotid polimorfizmleri ve DEFB1 genindeki haplotip, bir Kore popülasyonunda atopik dermatit ile ilişkilidir". J. Dermatol. Sci. 54 (1): 25–30. doi:10.1016 / j.jdermsci.2008.12.005. PMID 19135873.
Milanese M, Segat L, Arraes LC, vd. (2009). "Brezilyalı çocuklarda defensin genlerinin ve HIV enfeksiyonunun kopya numarası varyasyonu". J. Acquir. Bağışıklık Eksikliği. Syndr. 50 (3): 331–3. doi:10.1097 / QAI.0b013e3181945f39. PMID 19194307. S2CID 33161105.
Palfree RG, Sadro LC, Solomon S (1993). "İnsan kortikostatin HP-4 öncüsünü kodlayan gen, yakın zamanda 86 bazlı bir çoğaltma içerir ve kromozom 8 üzerinde bulunur". Mol. Endokrinol. 7 (2): 199–205. doi:10.1210 / me.7.2.199. PMID 8469233.
Furci L, Sironi F, Tolazzi M, vd. (2007). "Alfa-defensinler, HIV-1 enfeksiyonunun erken aşamalarını bloke eder: gp120'nin CD4'e bağlanmasına müdahale". Kan. 109 (7): 2928–35. doi:10.1182 / kan-2006-05-024489. PMID 17132727.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2002). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Wilde CG, Griffith JE, Marra MN, vd. (1989). "Defensin ailesinin yeni bir üyesi olan insan nötrofil peptid 4'ün saflaştırılması ve karakterizasyonu". J. Biol. Kimya. 264 (19): 11200–3. PMID 2500436.
Singh A, Bateman A, Zhu QZ, ve diğerleri. (1988). "Anti-ACTH aktivitesine sahip yeni bir insan granülosit peptidinin yapısı". Biochem. Biophys. Res. Commun. 155 (1): 524–9. doi:10.1016 / S0006-291X (88) 81118-5. PMID 2843187.
Konishi K, Gibson KF, Lindell KO, ve diğerleri. (2009). "İdiyopatik Pulmoner Fibrozisin Akut Alevlenmelerinin Gen Ekspresyon Profilleri". Am. J. Respir. Kritik. Bakım Med. 180 (2): 167–75. doi:10.1164 / rccm.200810-1596OC. PMC 2714820. PMID 19363140.
Emonts M, Vermont CL, Houwing-Duistermaat JJ, ve diğerleri. (2009). "Üç popülasyonda meningokokal hastalıkta PARP, IL1B, IL4, IL10, C1INH, DEFB1 ve DEFA4'teki polimorfizmler". Şok (Augusta, Ga.). 34 (1): 17–22. doi:10.1097 / SHK.0b013e3181ce2c7d. PMID 20016407. S2CID 21743951.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 8 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000285318 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000164821, ENSG00000285318 - Topluluk, Mayıs 2017

[2] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-3] "Entrez Geni: DEFA4; defensin, alfa 4, kortikostatin (Homo sapiens)".

[pmid15317502-4] Wu Z, Ericksen B, Tucker K, vd. (2004). "İnsan alfa-defensinleri 4-6 sentezi ve karakterizasyonu". J Pept Res. 64 (3): 118–25. doi:10.1111 / j.1399-3011.2004.00179.x. PMID 15317502.

[pmid15616305-5] Ericksen B, Wu Z, Lu W, Lehrer RI (2005). "Altı İnsan α-Defensininin Antibakteriyel Aktivitesi ve Özgünlüğü". Antimicrob. Ajanlar Kemoterapi. 49 (1): 269–75. doi:10.1128 / AAC.49.1.269-275.2005. PMC 538877. PMID 15616305.

[pmid15620707-6] Wu Z, Cocchi F, Gentles D, vd. (3 Ocak 2005). "İnsan nötrofil alfa-defensin 4, in vitro HIV-1 enfeksiyonunu inhibe eder". FEBS Lett. 579 (1): 162–6. doi:10.1016 / j.febslet.2004.11.062. PMID 15620707. S2CID 84062495.

[pmid2997278-7] T Ganz; M E Selsted; D Szklarek; et al. (1985). "Defensinler. İnsan nötrofillerinin doğal peptit antibiyotikleri". J Clin Invest. 76 (4): 1427–1435. doi:10.1172 / JCI112120. PMC 424093. PMID 2997278.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]