DEFA5 - DEFA5

DEFA5
Mevcut yapılar
PDB	İnsan UniProt araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1ZMP, 2LXZ, 2MIT, 3I5W, 4E82, 4E83, 4E86, 4RBW, 4RBX, 5CUM, 5CUJ, 5CUI
Tanımlayıcılar
Takma adlar	DEFA5, DEF5, HD-5, defensin alfa 5
Harici kimlikler	OMIM: 600472 HomoloGene: 128604 GeneCard'lar: DEFA5
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 8 (insan)
Son	7,056,739 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• protein homodimerizasyon aktivitesi;
Hücresel bileşen	• Golgi lümeni; • salgı granül lümeni; • taşıma kesesi; • sitoplazmik vezikül; • hücre dışı bölge; • hücre dışı;
Biyolojik süreç	• savunma tepkisi; • bakteriye savunma tepkisi; • mantara karşı savunma tepkisi; • antimikrobiyal humoral yanıt; • antimikrobiyal peptidin aracılık ettiği antimikrobiyal humoral immün yanıt; • doğuştan bağışıklık sistemi; • membran geçirgenliğinin pozitif düzenlenmesi; • diğer organizmanın hücrelerinin öldürülmesi; • mukozada doğal bağışıklık tepkisi; • antibakteriyel humoral yanıt; • Gram negatif bakteriye karşı savunma tepkisi; • Gram pozitif bakteriye karşı savunma tepkisi; • diğer organizmada zar bozulması; • lipopolisakkaride hücresel yanıt;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	1670
	n / a
	ENSG00000164816; ENSG00000285251
	n / a
	Q01523
	n / a
	NM_021010
	n / a
	NP_066290
	n / a
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle

Defensin, alfa 5 (DEFA5) olarak da bilinir insan alfa savunması 5 (HD5) bir insandır protein tarafından kodlanan DEFA5 gen.^[3]^[4] DEFA5 ile ifade edilir Bölme hücreleri of İleum.^[5]

Savunmacılar konakçı savunmasında rol oynadığı düşünülen bir mikrop öldürücü ve sitotoksik peptid ailesidir. Nötrofil granüllerinde bol miktarda bulunurlar ve ayrıca bağırsak, solunum yolu, idrar yolu ve vajina gibi mukozal yüzeylerin epitelinde bulunurlar. Defensin ailesinin üyeleri, protein sekansı açısından oldukça benzerdir ve korunmuş bir sistein motifi ile ayırt edilir. Birkaç insan alfa savunması genler, kromozom 8 üzerinde kümelenmiş gibi görünmektedir. Bu gen tarafından kodlanan protein, defensin, alfa 5, ileumun Paneth hücrelerinin salgı granüllerinde yüksek oranda ifade edilir.^[3]

Referanslar

^ ^a ^b ^c ENSG00000285251 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000164816, ENSG00000285251 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b "Entrez Geni: DEFA5 defensin, alfa 5, Paneth hücreye özgü".
^ Jones DE, Bevins CL (Ocak 1993). "İnsan Paneth hücrelerinde Defensin-6 mRNA: insan bağırsağının konakçı savunmasında antimikrobiyal peptidler için çıkarımlar". FEBS Lett. 315 (2): 187–92. doi:10.1016/0014-5793(93)81160-2. PMID 8417977. S2CID 45099115.
^ Zhao C, Wang I, Lehrer RI (24 Kasım 1996). "İnsan salgı bezlerinde ve epitel hücrelerinde beta-defensin hBD-1'in yaygın ifadesi". FEBS Lett. 396 (2–3): 319–22. doi:10.1016/0014-5793(96)01123-4. PMID 8915011. S2CID 22367037.

daha fazla okuma

Ebegümeci EB, Harris A, Salzman N, vd. (1996). "İnsan enterik defensinleri. Gen yapısı ve gelişimsel ifade". J. Biol. Kimya. 271 (8): 4038–45. doi:10.1074 / jbc.271.8.4038. PMID 8626737.
Bevins CL, Jones DE, Dutra A, vd. (1996). "İnsan enterik defensin genleri: kromozomal harita konumu ve olası evrimsel ilişkiler için bir model". Genomik. 31 (1): 95–106. doi:10.1006 / geno.1996.0014. PMID 8808285.
Porter EM, Liu L, Oren A, vd. (1997). "Paneth hücre granüllerinde insan intestinal defensin 5'in lokalizasyonu". Infect. İmmün. 65 (6): 2389–95. doi:10.1128 / IAI.65.6.2389-2395.1997. PMC 175331. PMID 9169779.
Quayle AJ, Porter EM, Nussbaum AA, vd. (1998). "İnsan dişi üreme yolunda insan defensin-5'in gen ekspresyonu, immünolokalizasyonu ve salgılanması". Am. J. Pathol. 152 (5): 1247–58. PMC 1858596. PMID 9588893.
Ghosh D, Porter E, Shen B, vd. (2002). "Paneth hücre tripsin, insan defensin-5 için işleme enzimidir". Nat. Immunol. 3 (6): 583–90. doi:10.1038 / ni797. PMID 12021776. S2CID 22022089.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Salzman NH, Ghosh D, Huttner KM, ve diğerleri. (2003). "Bir insan bağırsak defensini ifade eden transgenik farelerde enterik salmonelloza karşı koruma". Doğa. 422 (6931): 522–6. doi:10.1038 / nature01520. PMID 12660734. S2CID 1096692.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA ve diğerleri. (2004). "NIH tam uzunlukta cDNA projesinin durumu, kalitesi ve genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)". Genom Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101 / gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Szyk A, Wu Z, Tucker K, vd. (2006). "İnsan alfa defensinleri HNP4, HD5 ve HD6'nın kristal yapıları". Protein Bilimi. 15 (12): 2749–60. doi:10.1110 / ps.062336606. PMC 2242434. PMID 17088326.
Wu Z, Ericksen B, Tucker K, vd. (2004). "İnsan alfa-defensinleri 4-6 sentezi ve karakterizasyonu". J Pept Res. 64 (3): 118–25. doi:10.1111 / j.1399-3011.2004.00179.x. PMID 15317502.
de Leeuw E, Burks SR, Li X, vd. (2007). "İnsan defensin 5'in yapıya bağlı işlevsel özellikleri". FEBS Lett. 581 (3): 515–20. doi:10.1016 / j.febslet.2006.12.036. PMC 1832120. PMID 17250830.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 8 bir Taslak. Wikipedia'ya şu şekilde yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000285251 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000164816, ENSG00000285251 - Topluluk, Mayıs 2017

[2] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-3] "Entrez Geni: DEFA5 defensin, alfa 5, Paneth hücreye özgü".

[pmid8417977-4] Jones DE, Bevins CL (Ocak 1993). "İnsan Paneth hücrelerinde Defensin-6 mRNA: insan bağırsağının konakçı savunmasında antimikrobiyal peptidler için çıkarımlar". FEBS Lett. 315 (2): 187–92. doi:10.1016/0014-5793(93)81160-2. PMID 8417977. S2CID 45099115.

[pmid8915011-5] Zhao C, Wang I, Lehrer RI (24 Kasım 1996). "İnsan salgı bezlerinde ve epitel hücrelerinde beta-defensin hBD-1'in yaygın ifadesi". FEBS Lett. 396 (2–3): 319–22. doi:10.1016/0014-5793(96)01123-4. PMID 8915011. S2CID 22367037.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]