DR1 (gen) - DR1 (gene)

DR1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1JFI
Tanımlayıcılar
Takma adlar	DR1, NC2, NC2-BETA, NC2B, transkripsiyon 1 aşağı regülatörü, NCB2
Harici kimlikler	OMIM: 601482 MGI: 1100515 HomoloGene: 38809 GeneCard'lar: DR1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 1 (insan)
Son	93,369,493 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 5 (fare)
Son	108,280,526 bp
RNA ifadesi Desen
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• TBP sınıfı protein bağlanması; • DNA bağlanması; • transkripsiyon faktör bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama; • GO: 0001106 transkripsiyon corepressor aktivitesi; • protein heterodimerizasyon aktivitesi; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü; • GO: 0001105 transkripsiyon koaktivatör aktivitesi; • GO: 0000983 RNA polimeraz II genel transkripsiyon başlatma faktörü aktivitesi;
Hücresel bileşen	• Ada2 / Gcn5 / Ada3 transkripsiyon aktivatör kompleksi; • hücre çekirdeği; • negatif kofaktör 2 kompleksi;
Biyolojik süreç	• transkripsiyonun düzenlenmesi, DNA şablonlu; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun negatif düzenlenmesi; • histon H3 asetilasyonu; • transkripsiyon, DNA şablonlu; • kromatin yeniden modelleme; • RNA polimeraz II transkripsiyonel ön başlatma kompleks montajının düzenlenmesi; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi; • RNA polimeraz II transkripsiyonel ön başlatma karmaşık montajı; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyon;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	1810
	13486
	ENSG00000117505
	ENSMUSG00000029265
	Q01658
	Q91WV0
	NM_001938
	NM_026106
	NP_001929
	NP_080382
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Protein Dr1 bir protein insanlarda kodlanır DR1 gen.^[5]^[6]^[7]

Fonksiyon

Bu gen, hem bazal hem de aktive edilmiş transkripsiyon seviyelerini baskılayan TBP- (TATA kutusu bağlayıcı protein) ilişkili bir fosfoproteini kodlar. Kodlanan protein, in vivo olarak fosforile edilir ve bu fosforilasyon, TBP ile etkileşimini etkiler. Bu protein, amino terminalinde bir histon katlama motifi, bir TBP bağlama alanı ve bir glutamin ve alaninden zengin bölge içerir. DR1 baskılayıcı komplekslerinin TBP-promoter komplekslerine bağlanması, değiştirilmiş bir DNA konformasyonunun, yüksek sıralı komplekslerin oluşumu ile birlikte, ön başlatma kompleksinin birleşmesini inhibe ettiği ve RNA polimeraz II transkripsiyon oranını kontrol ettiği bir mekanizma oluşturabilir.^[7]

Etkileşimler

DR1 (gen) gösterildi etkileşim ile DRAP1.^[8]^[9]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000117505 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000029265 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Inostroza JA, Mermelstein FH, Ha I, Lane WS, Reinberg D (Eylül 1992). "Dr1, TATA bağlayıcı proteinle ilişkili bir fosfoprotein ve sınıf II gen transkripsiyonunun inhibitörü". Hücre. 70 (3): 477–89. doi:10.1016/0092-8674(92)90172-9. PMID 1339312.
^ Purrello M, Di Pietro C, Rapisarda A, Viola A, Corsaro C, Motta S, Grzeschik KH, Sichel G (1996). "Dr1'i kodlayan insan geninin genomik lokalizasyonu, sınıf II ve sınıf III genlerinin transkripsiyonunun negatif bir modülatörü". Sitogenetik ve Hücre Genetiği. 75 (2–3): 186–9. doi:10.1159/000134479. PMID 9040789.
^ ^a ^b "Entrez Geni: DR1 transkripsiyon 1 aşağı regülatörü, TBP bağlayıcı (negatif kofaktör 2)".
^ Yeung K, Kim S, Reinberg D (Ocak 1997). "Bir insan Dr1-DRAP1 baskılayıcı kompleksinin fonksiyonel diseksiyonu". Mol. Hücre. Biol. 17 (1): 36–45. doi:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.
^ Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K, Landsman D, Levitt P, Tempst P, Reinberg D (Nisan 1996). "Dr1 aracılı transkripsiyon baskısı için bir corepressor gereksinimi". Genes Dev. 10 (8): 1033–48. doi:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.

daha fazla okuma

Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo kapaklama: ökaryotik mRNA'ların kapak yapısını oligoribonükleotidlerle değiştirmek için basit bir yöntem". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Goppelt A, Stelzer G, Lottspeich F, Meisterernst M (1996). "NC2'nin heterodimerik histon kat bölgeleri aracılığıyla TBP-promoter komplekslerine spesifik bağlanması yoluyla sınıf II gen transkripsiyonunun bastırılması için bir mekanizma". EMBO J. 15 (12): 3105–16. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00673.x. PMC 450253. PMID 8670811.
Kashanchi F, Khleif SN, Duvall JF, Sadaie MR, Radonovich MF, Cho M, Martin MA, Chen SY, Weinmann R, Brady JN (1996). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 Tat'ın benzersiz bir TFIID bölgesi ile etkileşimi, negatif kofaktör Dr1'i inhibe eder ve TFIID-TFIIA kompleksini stabilize eder". J. Virol. 70 (8): 5503–10. doi:10.1128 / JVI.70.8.5503-5510.1996. PMC 190508. PMID 8764062.
Cowell IG, Hurst HC (1996). "Transkripsiyonel baskılayıcı E4BP4 ile TBP bağlayıcı protein Dr1 arasındaki protein-protein etkileşimi". Nükleik Asitler Res. 24 (18): 3607–13. doi:10.1093 / nar / 24.18.3607. PMC 146135. PMID 8836190.
Rozet JM, Gerber S, Perrault I, Camuzat A, Calvas P, Viegas-Pequignot E, Molina-Gomes D, Le Paslier D, Chumakov I, Munnich A, Kaplan J (1996). "Bir TATA bağlayıcı protein ilişkili fosfoprotein geni olan DR1'in 1p22.1 kromozomuna yapısı ve fiziksel haritalaması ve bunun Stargardt hastalığında (STGD) dışlanması". Genomik. 36 (3): 554–6. doi:10.1006 / geno.1996.0508. PMID 8884286.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). "Tam uzunlukta zenginleştirilmiş ve 5'-uçta zenginleştirilmiş bir cDNA kitaplığının yapımı ve karakterizasyonu". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Kamada K, Shu F, Chen H, Malik S, Stelzer G, Roeder RG, Meisterernst M, Burley SK (2001). "TBP-DNA transkripsiyon kompleksini tanıyan negatif kofaktör 2'nin kristal yapısı". Hücre. 106 (1): 71–81. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00417-2. PMID 11461703.
Gilfillan S, Stelzer G, Piaia E, Hofmann MG, Meisterernst M (2005). "NC2.TATA bağlayıcı proteinin TATA yokluğunda DNA'ya verimli bağlanması". J. Biol. Kimya. 280 (7): 6222–30. doi:10.1074 / jbc.M406343200. PMID 15574413.
Lewis BA, Sims RJ, Lane WS, Reinberg D (2005). "Çekirdek promoter elemanlarının fonksiyonel karakterizasyonu: DPE'ye özgü transkripsiyon, protein kinaz CK2 ve PC4 koaktivatörünü gerektirir". Mol. Hücre. 18 (4): 471–81. doi:10.1016 / j.molcel.2005.04.005. PMID 15893730.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Çevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Malecová B, Gross P, Boyer-Guittaut M, Yavuz S, Oelgeschläger T (2007). "Başlatıcı çekirdek promoter elemanı, negatif kofaktör NC2 tarafından TATA'ya yönelik transkripsiyonun bastırılmasını antagonize eder". J. Biol. Kimya. 282 (34): 24767–76. doi:10.1074 / jbc.M702776200. PMID 17584739.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 1 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000117505 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000029265 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid1339312-5] Inostroza JA, Mermelstein FH, Ha I, Lane WS, Reinberg D (Eylül 1992). "Dr1, TATA bağlayıcı proteinle ilişkili bir fosfoprotein ve sınıf II gen transkripsiyonunun inhibitörü". Hücre. 70 (3): 477–89. doi:10.1016/0092-8674(92)90172-9. PMID 1339312.

[pmid9040789-6] Purrello M, Di Pietro C, Rapisarda A, Viola A, Corsaro C, Motta S, Grzeschik KH, Sichel G (1996). "Dr1'i kodlayan insan geninin genomik lokalizasyonu, sınıf II ve sınıf III genlerinin transkripsiyonunun negatif bir modülatörü". Sitogenetik ve Hücre Genetiği. 75 (2–3): 186–9. doi:10.1159/000134479. PMID 9040789.

[entrez-7] "Entrez Geni: DR1 transkripsiyon 1 aşağı regülatörü, TBP bağlayıcı (negatif kofaktör 2)".

[pmid8972183-8] Yeung K, Kim S, Reinberg D (Ocak 1997). "Bir insan Dr1-DRAP1 baskılayıcı kompleksinin fonksiyonel diseksiyonu". Mol. Hücre. Biol. 17 (1): 36–45. doi:10.1128 / MCB.17.1.36. PMC 231727. PMID 8972183.

[pmid8608938-9] Mermelstein F, Yeung K, Cao J, Inostroza JA, Erdjument-Bromage H, Eagelson K, Landsman D, Levitt P, Tempst P, Reinberg D (Nisan 1996). "Dr1 aracılı transkripsiyon baskısı için bir corepressor gereksinimi". Genes Dev. 10 (8): 1033–48. doi:10.1101 / gad.10.8.1033. PMID 8608938.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]