Delftia asidovoranlar - Delftia acidovorans - Wikipedia

Delftia asidovoranlar
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
Bakteri
Şube:
Proteobakteriler
Sınıf:
Betaproteobacteria
Sipariş:
Burkholderiales
Aile:
Comamonadaceae
Cins:
Delftia
Binom adı
Delftia asidovoranlar
(den Dooren de Jong 1926)
Wen et al. 1999
Tip suşu
ATCC 15668T
Eş anlamlı

Comamonas asidovoranlar (den Dooren de Jong 1926) Tamaoka et al. 1987
Pseudomonas indoloksidanlar Gri 1928
Pseudomonas desmolytica Gri ve Thornton 1928
Pseudomonas acidovorans den Dooren de Jong 1926

Delftia asidovoranlar bir Gram negatif hareketli, sporlaşmayan, çubuk şeklindeki bakteri[1] altını biyomineralize etme kabiliyeti ile bilinir[2] ve biyoremediasyon özellikleri.[3] İlk önce topraktan izole edildi Delft, Hollanda.[1] Bakteri başlangıçta şu şekilde sınıflandırılmıştır: Psedamonas asidovoranlar ve Comamonas asidovoranlar olarak yeniden sınıflandırılmadan önce Delftia asidovoranlar.[4]

Tarih

Delftia asidovoranlar başlangıçta olarak biliniyordu Comamonas asidovoranlar.[1] RRNA ilgisi nedeniyle yeniden adlandırıldı[5] ve içindeki diğer mikroplardan farklılıklar Comamonadaceae aile.[1] Bu farklılıklar filogenetik ve fenotipik verilerle kanıtlanmaktadır.[1] Yeni isim, Delftia asidovoranlar, şehir için bir referanstır Delft, ilk keşfedildiği ve kaydedildiği yer.[1]

Biyoloji ve biyokimya

Tür ve morfoloji

D. acidovorans bir safrofit,[6] Gram negatif, sporlanmayan, denitrifiye olmayan, fermentatif olmayan çubuk şekilli bakteri.[1] D. acidovorans, tek bir hücre olarak veya 0.4-0.8 M genişliğinde ve 2.5-4.1 ųM uzunluğunda çiftler halinde bulunur.[1] D. acidovorans polar veya bipolar flagella kümeleri boyunca hareketlidir.[1] Tufts bir ila beş flagella'ya sahip olabilir.[1]

Suşlar ve soyoluş

Delftia asidovoranlar parçası olarak var Betaproteobacteria içindeki soy Comamonadaceae aile. D. acidovorans SPH1, ATCC 1 15668 ve Cs 1-4 suşları yakından ilişkilidir. CCUG 247B ve CCUG 15835 suşları, Delftia asidovoranlar, daha çok benzerler Delftia tsuruhatensis. CCUG 247B ve CCUG 15835 genellikle şu şekilde gruplanır: D. tsuruhatensis ziyade D. acidovorans.[7]

Metabolizma

D. acidovorans dır-dir mezofilik ve optimum büyüme sıcaklığı 30 ° C'dir.[7] Psikrofilik koşullarda hayatta kalamaz.[1] D. acidovorans büyüme için tuz konsantrasyonu minimum olan veya hiç olmayan ortamları tercih eden bir halofil değildir.[1] D. acidovorans Cs1-4 ve SPH-1 suşları aerobik bakteri.[7]

D. acidovorans suşları Cs1-4 ve SPH-1 fenantren, piruvat, vanilat, süksinat kullanabilir, Formik asit, glukonik asit, hidroksibütirik asit, laktik asit ve propiyonik asit bir karbon kaynağı olarak.[7] D. acidovorans üreaz üretmez, katalaz ve oksidaz pozitiftir ve fruktoz ve mannitolü okside eder[5]

Biyomineralizasyon

D. acidovorans ile birlikte birkaç bakteriden biridir Cupriavidus metalliduranlar, altını metabolize edebilir.[8][2] Au3+ ribozomal olmayan ikincil metabolit delftibaktin tarafından hücre dışı olarak azaltılır. Delftibactin, bakterileri altın toksisitesinden koruyabildiği ve altın iyonlarını katı forma indirgediği için benzersiz bir metabolittir.[2] Delftibactin, deniz suyu içeren çamurlardan altını çıkarabilir ve kalsiyum karbonat ve ayrıca elektronik atıklardan altın alma yeteneğine de sahiptir.[9][10] Biyohidrometalurji teknikleri kullanarak D. acidovorans geri dönüşüm karlılığını iyileştirir ve siyanürle süzülmeye sürdürülebilir alternatiflerdir.[11] Kurşun ayrıca atılmış elektroniklerden geri kazanılabilir. D. acidovorans.[3] Delftibaktin ekspresyonunu indükleme girişimleri Escherichia coli DelH proteininin toksisitesinden dolayı başarısız oldu.[10]

Biyoremediasyon ve biyolojik üretim

D. acidovorans selenyum ve krom iyonları gibi toksik metalleri zararsız ürünlere dönüştürebilmektedir.[3] Ayrıca bozulabilir fenantren polisiklik aromatik hidrokarbonlardan (PAH'lar) bir karbon kaynağı olan. Fenantren yaygın bir çevre kirleticisidir.[7]

D. acidovorans üretmek için kullanılabilir polihidroksialkanoatlar (PHA'lar). PHA'lar, tıbbi ortamlarda kullanılan geleneksel plastik ekipmanlara uygun bir alternatiftir. Geleneksel plastik üretimi, kaynak tüketen ve kirleten, PHA üretimi ise D. acidovorans daha sürdürülebilir bir çözümdür.[12]

Hastalıktaki Rolü

Delftia asidovoranlar antibiyotik direnci gösteren ortaya çıkan fırsatçı bir patojendir.[6][13] Enfeksiyon neden olabilir bakteriyemi,[14] keratit,[15][16] Zatürre,[17] ampiyem,[18] otitis,[19] ve peritonit.[20] Bilinen enfeksiyon kaynakları arasında kirli su bulunur[19] ve kateterler.[13][14] D. acidovorans Su veya toprak kontaminasyonundan şüphelenildiğinde hastalarda nedensel bir organizma olarak düşünülmelidir.[5] D. acidovorans RO sistemleri gibi klinik ortamlardan da izole edilmiştir,[21] cerrahi vakumlar,[22] ve işletim bölmesi lavabolar.[23] Bazı suşlar tolere edebilir klorheksidin,[24] yaygın bir cerrahi dezenfektan.

Enfeksiyonlar D. acidovorans turuncu bir indol testi ile doğrulanabilir.[18] Aminoglikozitlere karşı antibiyotik direnci yaygındır. [6][13][18][17][20]

Referanslar

  1. ^ a b c d e f g h ben j k l Wen, Aimin; Fegan, Mark; Hayward, Chris; Chakraborty, Sukumar; Sinsi, Lindsay (1999). "Comamonadaceae üyeleri arasındaki filogenetik ilişkiler ve Delftia acidovorans'ın tanımı (den Dooren de Jong 1926 ve Tarnoaka ve diğerleri 1987) gen. Nov., Comb. Nov". Uluslararası Sistematik Bakteriyoloji Dergisi. 49 (2): 567–576. doi:10.1099/00207713-49-2-567. PMID  10319477 - PubMed aracılığıyla.
  2. ^ a b c Johnston, Chad W .; Wyatt, Morgan A .; Li, Xiang; Ibrahim, Ashraf; Shuster, Jeremiah; Southam, Gordon; Magarvey, Nathan A. (2013). "Altınla ilişkili bir mikroptan metaloforla altın biyomineralizasyonu". Doğa Kimyasal Biyoloji. 9 (4): 241–243. doi:10.1038 / nchembio.1179. ISSN  1552-4469. PMID  23377039.
  3. ^ a b c Ubalde, Martha C .; Braña, Victoria; Sueiro, Fabiana; Morel, Maria A .; Martínez-Rosales, Cecilia; Marquez, Carolina; Castro-Sowinski, Susana (2012). "Delftia sp. Çok Yönlülüğü Biyoremediasyon ve Biyofertilizasyon Teknolojileri için Araçlar Olarak İzole Edilir". Güncel Mikrobiyoloji. 64 (6): 597–603. doi:10.1007 / s00284-012-0108-5. ISSN  0343-8651. PMID  22476956. S2CID  1464049.
  4. ^ Rema, Tara; Lawrence, John R .; Dynes, James J .; Hitchcock, Adam P .; Korber, Darren R. (2014-10-01). "Delftia acidovorans Biyofilmlerinde Klorheksidin Toleransının Mikroskobik ve Spektroskopik Analizleri". Antimikrobiyal Ajanlar ve Kemoterapi. 58 (10): 5673–5686. doi:10.1128 / AAC.02984-14. ISSN  0066-4804. PMC  4187954. PMID  25022584.
  5. ^ a b c Mahmood, S .; Taylor, K. E .; Overman, T. L .; McCormick, M.I. (2012-11-01). "Delftia acidovorans'ın Neden Olduğu Akut Enfektif Endokardit, İntravenöz İlaç Kullanımını Zorlaştıran Nadir Bir Patojen". Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 50 (11): 3799–3800. doi:10.1128 / JCM.00553-12. ISSN  0095-1137. PMC  3486206. PMID  22933597.
  6. ^ a b c Kawamura, Ichiro; Yagi, Tetsuya; Hatakeyama, Kazuhito; Hasegawa, Yoshinori; Ohkura, Teruko; Ohkusu, Kiyofumi; Takahashi, Yoshiyuki; Kojima, Seiji (2011). "Farklı antimikrobiyal duyarlılık profillerine sahip Delftia acidovorans'ın neden olduğu tekrarlayan vasküler kateterle ilişkili bakteremi". Enfeksiyon ve Kemoterapi Dergisi. 17 (1): 111–113. doi:10.1007 / s10156-010-0089-x. PMID  20628778.
  7. ^ a b c d e Shetty, Ameesha R .; de Gannes, Vidya; Obi, Chioma C .; Lucas, Susan; Lapidus, Alla; Cheng, Jan-Fang; Goodwin, Lynne A .; Pitluck, Samuel; Peters, Linda; Mikhailova, Natalia; Teshima, Hazuki (2015). "Fenantren parçalayan toprak bakterisi Delftia acidovorans Cs1-4'ün tam genom dizisi". Genomik Bilimlerde Standartlar. 10: 55. doi:10.1186 / s40793-015-0041-x. ISSN  1944-3277. PMC  4572682. PMID  26380642.
  8. ^ Rea, Maria Angelica; Zammit, Carla M .; Reith, Frank (2016/06/01). "Altın taneleri üzerindeki bakteriyel biyofilmler - altının jeomikrobiyal dönüşümlerinin etkileri". FEMS Mikrobiyoloji Ekolojisi. 92 (6): fiw082. doi:10.1093 / femsec / fiw082. ISSN  0168-6496. PMID  27098381.
  9. ^ Yusoff, A H M; Nading, ME; Salimi, M N (2017). "Deniz suyundan Delftia Acidovorans mikropları ile altın (Au) parçacıklarının çıkarılması". Journal of Physics: Konferans Serisi. 908 (1): 012045. Bibcode:2017JPhCS.908a2045Y. doi:10.1088/1742-6596/908/1/012045. ISSN  1742-6588.
  10. ^ a b "Altın Geri Dönüşümü. Altını Elektronik Atıklardan Geri Dönüştürmek İçin Delfibactin Kullanımı". iGEM.
  11. ^ Kaksonen, Anna H .; Boxall, Naomi J .; Gumulya, Yosephine; Khaleque, Himel N .; Morris, Christina; Bohu, Tsing; Cheng, Ka Yu; Usher, Kayley M .; Lakaniemi, Aino-Maija (2018/09/01). "Biyohidrometalurji ve mikrobiyal karakterizasyonda son gelişmeler". Hidrometalurji. 180: 7–25. doi:10.1016 / j.hidromet.2018.06.018. ISSN  0304-386X.
  12. ^ Romanelli, Maria Giovanna; Povolo, Silvana; Favaro, Lorenzo; Fontana, Federico; Basaglia, Marina; Casella, Sergio (2014). "Mezbaha atıklarından polihidroksialkanoatlar üretmek için mühendislik Delftia acidovorans DSM39". Uluslararası Biyolojik Makromolekül Dergisi. 71: 21–27. doi:10.1016 / j.ijbiomac.2014.03.049. PMID  24704165.
  13. ^ a b c Chotikanatis, Kobkul; Bäcker, Martin; Rosas-Garcia, Gabriela; Hammerschlag Margaret R. (2011). "Bir Hemodiyaliz Hastasında Delftia acidovorans'ın Neden Olduğu Tekrarlayan İntravasküler Kateterle İlişkili Bakteriyemi". Klinik Mikrobiyoloji Dergisi. 49 (9): 3418–3421. doi:10.1128 / JCM.00625-11. ISSN  0095-1137. PMC  3165601. PMID  21775546.
  14. ^ a b Lang, K. J .; Chinzowu, T .; Cann, K.J. (2012). "Hatla İlişkili Sepsiste Olağandışı Sebep Olan Bir Organizma Olarak Delftia acidovorans". Hint Mikrobiyoloji Dergisi. 52 (1): 102–103. doi:10.1007 / s12088-011-0221-3. ISSN  0046-8991. PMC  3298582. PMID  23450157.
  15. ^ Lee, Sang Mok; Kim, Mee Kum; Lee, Jae Lim; Wee, Ryang kazandı; Lee, Jin Hak (2008). "Bağışıklığı Bozulmuş Korneada Gecikmiş Başlangıç ​​ve Tedavi Yanıtı Olan Comamonas Acidovorans Keratit Deneyimi". Kore Oftalmoloji Dergisi. 22 (1): 49–52. doi:10.3341 / kjo.2008.22.1.49. ISSN  1011-8942. PMC  2629953. PMID  18323706.
  16. ^ Langman, ME; Dighiero, PL; Gicquel, JJ (2007-10-02). "Comamonas: hidrojel kontakt lens kullanıcılarında pek yaygın olmayan bir ajan". Acta Ophthalmologica Scandinavica. 85: 0. doi:10.1111 / j.1600-0420.2007.01062_3296.x.
  17. ^ a b Yıldız, Hanifi; Sünnetçioğlu, Aysel; Ekin, Selami; Baran, İrfan; Özgökçe, Mesut; Aşker, Selvi; Üney, İbrahim; Akyüz, Sümeyye (2020-02-10). Turgut, Engin (ed.). "Delftia Acidovorans pnömonisi ve akciğer boşlukları oluşumu". Kolombiya Medica. 50 (3): 215–221. doi:10.25100 / cm.v50i3.4025. PMC  7141147. PMID  32284666.
  18. ^ a b c Khan, Sadia; Sistla, Sujatha; Dhodapkar, Rahul; Parija, Subhash Chandra (2012). "Bağışıklık sistemi yeterli olan ampiyem hastasında ölümcül Delftia acidovorans enfeksiyonu". Asya Pasifik Tropikal Biyotıp Dergisi. 2 (11): 923–924. doi:10.1016 / S2221-1691 (12) 60254-8. PMC  3609244. PMID  23569872.
  19. ^ a b Reina, Jordi; Llompart, Isabel; Alomar Pedro (Mart 1991). "Comamonas acidovorans'ın neden olduğu akut süpüratif otitis". Klinik Mikrobiyoloji Bülteni. 13 (5): 38–39. doi:10.1016 / 0196-4399 (91) 90006-H.
  20. ^ a b Artan, Ayşe Serra; Gürsu, Meltem; Elçioğlu, Ömer Celal; Kazancıoğlu, Rumeyza (2020). "Periton Diyalizi Gören Bir Hastada Delftia Acidovorans Peritoniti". Türk Nefroloji Dergisi. 29 (4): 326–328. doi:10.5152 / turkjnephrol.2020.4204.
  21. ^ Yassin, Mohamed H .; Abramovitz, Blaise; Hariri, Rahman; McKibben, Leeanna; Pinevich, A.J. (2020). "Taşınabilir ters ozmoz makinelerinde Delftia acidovorans sözde salgını: Güvenli ve uygun maliyetli hemodiyaliz sağlamak için müdahaleler". Amerikan Enfeksiyon Kontrolü Dergisi. 48 (3): 304–308. doi:10.1016 / j.ajic.2019.11.027. ISSN  0196-6553. PMID  31952870.
  22. ^ Miño de Kaspar, Herminia; Grasbon, Thomas; Kampik, Anselm (2000). "Otomatik cerrahi ekipman, postoperatif endoftalmiyi önlemek için vakum kontrol manifoldunun rutin dezenfeksiyonunu gerektirir11Yazarların hiçbir üründe mülkiyet hakkı yoktur". Oftalmoloji. 107 (4): 685–690. doi:10.1016 / s0161-6420 (99) 00178-5. ISSN  0161-6420. PMID  10768329.
  23. ^ Ta, C .; Wong, G .; Cole, W .; Medvedev, G. (2020-09-01). "Ovma lavabosu kontaminasyonu ve ameliyathane personeline bulaşma". Yeni Mikroplar ve Yeni Enfeksiyonlar. 37: 100754. doi:10.1016 / j.nmni.2020.100754. ISSN  2052-2975. PMC  7502367. PMID  32995014.
  24. ^ Rema, Tara; Lawrence, John R .; Dynes, James J .; Hitchcock, Adam P .; Korber, Darren R. (2014). "Delftia acidovorans Biyofilmlerinde Klorheksidin Toleransının Mikroskobik ve Spektroskopik Analizleri". Antimikrobiyal Ajanlar ve Kemoterapi. 58 (10): 5673–5686. doi:10.1128 / AAC.02984-14. ISSN  0066-4804. PMC  4187954. PMID  25022584.

Dış bağlantılar