GGA1 - GGA1 - Wikipedia

GGA1
Protein GGA1 PDB 1j2j.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarGGA1, golgi ile ilişkili, gamma adaptin kulak içeren, ARF bağlayıcı protein 1
Harici kimliklerOMIM: 606004 MGI: 2146207 HomoloGene: 39250 GeneCard'lar: GGA1
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 22 (insan)
Chr.Kromozom 22 (insan)[1]
Kromozom 22 (insan)
GGA1 için genomik konum
GGA1 için genomik konum
Grup22q13.1Başlat37,608,725 bp[1]
Son37,633,564 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE GGA1 218114, fs.png'de

PBB GE GGA1 50277 fs.png'de

PBB GE GGA1 45572 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_145929

RefSeq (protein)

NP_001001560
NP_001166158
NP_001166159
NP_037497
NP_001350700

NP_666041

Konum (UCSC)Tarih 22: 37.61 - 37.63 MbTarih 15: 78.88 - 78.89 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

ADP-ribosilasyon faktörü bağlayıcı protein GGA1 bir protein insanlarda GGA1 gen.[5][6][7]

Bu gen, Golgi-lokalize, gamma adaptin kulak içeren, ARF-bağlayıcı (GGA) protein ailesinin bir üyesini kodlar. Bu ailenin üyeleri, proteinlerin ticaretini düzenleyen ve her yerde bulunan ceket proteinleridir. trans-Golgi ağ ve lizozom. Bu proteinler, bir amino terminal VHS alanını paylaşır ve mannoz 6-fosfat reseptörleri trans-Golgi ağında. Ayrıca, gama-adaptinlerin kulak alanına homolojiye sahip bir karboksi-terminal bölgesi içerirler. Bu gen için farklı izoformları kodlayan çok sayıda alternatif olarak eklenmiş transkript varyantları bulunmuştur.[8]

Etkileşimler

GGA1'in gösterdiği gibi etkileşim ile Sortilin 1,[9] BACE2,[10] RABEP1[11] ve ARF3.[12][13]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000100083 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000033128 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (Mayıs 2000). "Trans-Golgi ağı ile vakuol / lizozom arasındaki trafiği kolaylaştıran gamma-adaptin ve VHS alanlarına sahip bir protein ailesi". J Cell Biol. 149 (1): 67–80. doi:10.1083 / jcb.149.1.67. PMC  2175106. PMID  10747088.
  6. ^ Dell'Angelica EC, Puertollano R, Mullins C, Aguilar RC, Vargas JD, Hartnell LM, Bonifacino JS (Mayıs 2000). "GGA'lar: adaptörler ile ilgili ve Golgi kompleksi ile ilişkili bir ADP ribosilasyon faktörü bağlayıcı protein ailesi". J Cell Biol. 149 (1): 81–94. doi:10.1083 / jcb.149.1.81. PMC  2175099. PMID  10747089.
  7. ^ Xie L, Boyle D, Sanford D, Scherer PE, Pessin JE, Mora S (Mart 2006). "Hücre içi trafiği ve adiponektinin salgılanması, GGA kaplı veziküllere bağlıdır". J Biol Kimya. 281 (11): 7253–9. doi:10.1074 / jbc.M511313200. PMID  16407204.
  8. ^ "Entrez Gene: GGA1 golgi ile ilişkili, gamma adaptin kulak içeren, ARF bağlayıcı protein 1".
  9. ^ Jacobsen, Linda; Madsen Peder; Nielsen Morten S; Geraerts Wijnand P M; Gliemann Jørgen; Smit August B; Petersen Claus M (Ocak 2002). "SorLA sitoplazmik alan, GGA1 ve -2 ile etkileşime girer ve GGA bağlanması için minimum gereksinimleri tanımlar". FEBS Lett. 511 (1–3): 155–8. doi:10.1016 / S0014-5793 (01) 03299-9. ISSN  0014-5793. PMID  11821067.
  10. ^ O, Xiangyuan; Chang Wan-Pin; Koelsch Gerald; Tang Jordan (Temmuz 2002). "Memapsin 2 (beta-sekretaz) sitosolik alan, GGA1 ve GGA2'nin VHS alanlarına bağlanır: memapsin 2'nin endositoz mekanizması üzerindeki çıkarımlar". FEBS Lett. 524 (1–3): 183–7. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03052-1. ISSN  0014-5793. PMID  12135764.
  11. ^ Mattera, Rafael; Arighi Cecilia N; Lodge Robert; Zerial Marino; Bonifacino Juan S (Ocak 2003). "GGA'ların Rabaptin-5-Rabex-5 kompleksi ile ikili etkileşimi". EMBO J. 22 (1): 78–88. doi:10.1093 / emboj / cdg015. ISSN  0261-4189. PMC  140067. PMID  12505986.
  12. ^ Boman, Annette L; Salo Paul D; Hauglund Melissa J; Strand Nicole L; Rensink Shelly J; Zhdankina Olga (Eylül 2002). "ADP-ribosilasyon faktörü (ARF) etkileşimi, maya GGA protein fonksiyonu veya lokalizasyonu için yeterli değildir". Mol. Biol. Hücre. 13 (9): 3078–95. doi:10.1091 / mbc.E02-02-0078. ISSN  1059-1524. PMC  124144. PMID  12221117.
  13. ^ Boman, A L; Zhang Cj; Zhu X; Kahn RA (Nisan 2000). "Trans-Golgi yoluyla membran taşınmasını değiştirebilen bir ADP-ribosilasyon faktör efektör ailesi". Mol. Biol. Hücre. 11 (4): 1241–55. doi:10.1091 / mbc.11.4.1241. ISSN  1059-1524. PMC  14844. PMID  10749927.

daha fazla okuma