Geranilgeraniltransferaz tip 1 - Geranylgeranyltransferase type 1
| protein geranilgeraniltransferaz tip I | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||||
| EC numarası | 2.5.1.59 | ||||||||
| CAS numarası | 135371-29-8 | ||||||||
| Veritabanları | |||||||||
| IntEnz | IntEnz görünümü | ||||||||
| BRENDA | BRENDA girişi | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme görünümü | ||||||||
| KEGG | KEGG girişi | ||||||||
| MetaCyc | metabolik yol | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB yapılar | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| Gen ontolojisi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
| GGTase 1 α-alt birimi (farnesiltransferaz, CAAX kutusu ) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||
| Sembol | FNTA | ||||||
| NCBI geni | 2339 | ||||||
| HGNC | 3782 | ||||||
| OMIM | 134635 | ||||||
| PDB | 1S64 | ||||||
| RefSeq | NM_002027 | ||||||
| UniProt | P49354 | ||||||
| Diğer veri | |||||||
| EC numarası | 2.5.1.59 | ||||||
| Yer yer | Chr. 8 s11.21 | ||||||
| |||||||
| GGTase 1 β-alt birimi (protein geranilgeranil-transferaz tip I, β alt birimi) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Tanımlayıcılar | |||||||
| Sembol | PGGT1B | ||||||
| NCBI geni | 5229 | ||||||
| HGNC | 8895 | ||||||
| OMIM | 602031 | ||||||
| PDB | 1S64 | ||||||
| RefSeq | NM_005023 | ||||||
| UniProt | P53609 | ||||||
| Diğer veri | |||||||
| EC numarası | 2.5.1.59 | ||||||
| Yer yer | Chr. 5 q23.1 | ||||||
| |||||||
Geranilgeraniltransferaz tip 1 ya da sadece geranilgeraniltransferaz üçünden biri enzimler içinde preniltransferaz grubu. Spesifik terimlerle, Geranilgeraniltransferaz (GGTase 1), bir CaaX motifi taşıyan proteinlere geranilgeranil grubu olarak adlandırılan 20 karbonlu bir izoprenoidi ekler: bir proteinin karboksil terminalinde bir dört amino asit dizisi. Geranilgeraniltransferaz inhibitörleri, kanser önleyici ajanlar olarak araştırılmaktadır.[1]
Fonksiyon
Geranilgeraniltransferaz dahil olmak üzere preniltransferazlar, çeviri sonrası değişiklik hedef proteinin karboksil terminaline prenil grubu adı verilen bir izoprenoid lipidi ekleyerek proteinler. Bu süreç denir prenilasyon prenil grubunun hidrofobik doğası nedeniyle prenile proteinlerin membranla ilişkili hale gelmesine neden olur. Çoğu prenile protein hücresel sinyalleşmeye dahil olur, burada membran birleşmesi işlev için kritiktir.[1]
Yapısı
Geranilgeraniltransferaz iki alt birimler tarafından kodlanan α ve β FNTA ve PGGT1B sırasıyla genler. Her iki alt birim de öncelikle şunlardan oluşur: alfa sarmalları. Geranilgeraniltransferaz, aktif bölgenin dudağındaki β alt biriminde bir çinko katyonu koordine eder. Geranilgeraniltransferaz için hidrofobik bir bağlanma cebi vardır. geranilgeranil difosfat lipit donör molekülü. Tüm Geranilgeraniltransferaz substratları, dördüncü ila son kalıntıları olarak değişmez bir şekilde bir sisteine sahiptir. Çinko tarafından koordine edilen bu sistein, SN2 difosfatın yerini alan geranilgeranil difosfat üzerine tip saldırı.[2][3]
Ayrıca bakınız
- Farnesiltransferaz
- Prenilasyon
- Rab geranilgeraniltransferaz - Geranilgeraniltransferaz tip 2
Referanslar
- ^ a b Lane KT, Beese LS (Nisan 2006). "Tematik inceleme serisi: lipid translasyon sonrası modifikasyonlar. Protein farnesiltransferaz ve geranilgeraniltransferaz tip I'in yapısal biyolojisi". J. Lipid Res. 47 (4): 681–99. doi:10.1194 / jlr.R600002-JLR200. PMID 16477080.
- ^ Reid TS, Terry KL, Casey PJ, Beese LS (Ekim 2004). "Substratlarla kompleks haline getirilmiş CaaX preniltransferazların kristalografik analizi, protein substrat seçiciliği kurallarını tanımlar". J. Mol. Biol. 343 (2): 417–33. doi:10.1016 / j.jmb.2004.08.056. PMID 15451670.
- ^ Long SB, Casey PJ, Beese LS (Ekim 2002). "Protein farnesiltransferazın atomik çözünürlükte reaksiyon yolu". Doğa. 419 (6907): 645–50. doi:10.1038 / nature00986. PMID 12374986. S2CID 4412580.
daha fazla okuma
- Eastman RT, Buckner FS, Yokoyama K, Gelb MH, Van Voorhis WC (Şubat 2006). "Tematik inceleme serisi: lipid translasyon sonrası modifikasyonlar. Protein farnesilasyonunu bloke ederek parazitik hastalıklarla mücadele". J. Lipid Res. 47 (2): 233–40. doi:10.1194 / jlr.R500016-JLR200. PMID 16339110.
- El Oualid F, Cohen LH, van der Marel GA, Overhand M (2006). "Protein inhibitörleri: geranilgeranil transferazlar". Curr. Med. Kimya. 13 (20): 2385–427. doi:10.2174/092986706777935078. PMID 16918362.