HIST1H3A - HIST1H3A

H3C1
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4LLB, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4 SAAT, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3KMT, 4YM6, 4A7J, 3UEE, 2KWK, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4LKA, 5CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3AZH, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2KWJ, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4YM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3SOU, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2B2U, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Tanımlayıcılar
Takma adlar	H3C1, H3 / A, H3FA, histon kümesi 1, H3a, histon kümesi 1 H3 aile üyesi a, HIST1H3A, H3 kümelenmiş histon 1, H3C4, H3C7, H3C12, H3C2, H3C8, H3C10, H3C3, H3C6, H3C11
Harici kimlikler	OMIM: 602810 MGI: 2448322 HomoloGene: 134332 GeneCard'lar: H3C1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 6 (insan)
Son	26,020,900 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• DNA bağlanması; • histon bağlama; • GO: 0001948 protein bağlama; • protein heterodimerizasyon aktivitesi; • kaderin bağlama; • nükleozomal DNA bağlanması;
Hücresel bileşen	• nükleer nükleozom; • zar; • nükleoplazma; • kromozom; • hücre dışı bölge; • nükleer kromozom; • hücre dışı eksozom; • nükleer kromozom, telomerik bölge; • nükleozom; • hücre çekirdeği; • makromoleküler kompleks;
Biyolojik süreç	• telomer organizasyonu; • hücresel protein metabolik süreci; • gen ifadesinin pozitif düzenlenmesi, epigenetik; • protein heterotetramerizasyonu; • kan pıhtılaşması; • DNA replikasyonuna bağımlı nükleozom topluluğu; • gen susturmanın düzenlenmesi; • rDNA'da kromatin susturma; • gen ifadesinin negatif düzenlenmesi, epigenetik; • kromatin organizasyonu; • miRNA ile gen susturmanın düzenlenmesi; • nükleozom montajı; • interlökin-7 aracılı sinyal yolu; • megakaryosit farklılaşmasının düzenlenmesi; • hematopoietik kök hücre farklılaşmasının düzenlenmesi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	8350
	319149
	ENSG00000275714
	n / a
	P68431
	P84228
	NM_003529
	NM_178204
	NP_066298; NP_003520; NP_003525; NP_003527
NP_835511; NP_835510; NP_783584; NP_038576; NP_473386;
	NP_835734; NP_835512; NP_835587
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Histon H3.1 bir protein insanlarda kodlanır HIST1H3A gen.^[4]^[5]^[6]

Histonlar, ökaryotlardaki kromozomal fiberin nükleozom yapısından sorumlu olan temel nükleer proteinlerdir. Bu yapı, bir nükleozomun etrafına sarılmış yaklaşık 146 bp DNA'dan, dört çekirdek histonun (H2A, H2B, H3 ve H4) her birinin çiftlerinden oluşan bir oktamerden oluşur. Kromatin lifi, yüksek dereceli kromatin yapıları oluşturmak için nükleozomlar arasındaki DNA ile bir bağlayıcı histonun (H1) etkileşimi yoluyla daha da sıkıştırılır. Bu gen intronsuzdur ve histon H3 ailesinin bir üyesini kodlar. Bu genden gelen transkriptlerde polyA kuyrukları yoktur; bunun yerine, palindromik bir sonlandırma öğesi içerirler. Bu gen, kromozom 6p22-p21.3 üzerindeki büyük histon gen kümesinde bulunur.^[6]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000275714 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Albig W, Kioschis P, Poustka A, Meergans K, Doenecke D (Nisan 1997). "İnsan histon geni organizasyonu: büyük bir küme içinde düzensiz düzenleme". Genomik. 40 (2): 314–22. doi:10.1006 / geno.1996.4592. PMID 9119399.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (Ekim 2002). "İnsan ve fare replikasyonuna bağlı histon genleri". Genomik. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^a ^b "Entrez Geni: HIST1H3A histon kümesi 1, H3a".

daha fazla okuma

Albig W, Kardalinou E, Drabent B, vd. (1991). "İki insan H1 histon geninin, çekirdek histon genlerinin kümeleri içinde izolasyonu ve karakterizasyonu". Genomik. 10 (4): 940–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-F. PMID 1916825.
Albig W, Doenecke D (1998). "D6S105 lokusunda insan histon geni kümesi". Hum. Genet. 101 (3): 284–94. doi:10.1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). "Entegre kromatin ile ilişkili insan immün yetmezlik virüsü tip 1 promotörünün transkripsiyonel aktivasyonu". Mol. Hücre. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10.1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Ahn J, Gruen JR (1999). "İnsan 6p21.3 üzerindeki histon kümelerinin genomik organizasyonu". Anne. Genetik şifre. 10 (7): 768–70. doi:10.1007 / s003359901089. PMID 10384058. S2CID 28275496.
Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, vd. (2000). "Bölgeye özgü histon H3 metiltransferazlarla kromatin yapısının düzenlenmesi". Doğa. 406 (6796): 593–9. Bibcode:2000Natur.406..593R. doi:10.1038/35020506. PMID 10949293. S2CID 205008015.
Hsu JY, Sun ZW, Li X, vd. (2000). "Histon H3'ün mitotik fosforilasyonu, tomurcuklanan maya ve nematodlarda Ipl1 / aurora kinaz ve Glc7 / PP1 fosfataz tarafından yönetilir". Hücre. 102 (3): 279–91. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 00034-9. PMID 10975519. S2CID 16057773.
Deng L, de la Fuente C, Fu P, vd. (2001). "CBP / P300 ile HIV-1 Tat'ın asetilasyonu, entegre HIV-1 genomunun transkripsiyonunu arttırır ve çekirdek histonlara bağlanmayı arttırır". Viroloji. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Lachner M, O'Carroll D, Rea S, vd. (2001). "Histon H3 lizin 9'un metilasyonu, HP1 proteinleri için bir bağlanma sahası yaratır". Doğa. 410 (6824): 116–20. Bibcode:2001Natur.410..116L. doi:10.1038/35065132. PMID 11242053. S2CID 4331863.
Deng L, Wang D, de la Fuente C, vd. (2001). "P300 HAT aktivitesinin, kromatin DNA üzerinde HIV-1 Tat tarafından arttırılması". Viroloji. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Yang L, Xia L, Wu DY, vd. (2002). "ESET'in moleküler klonlaması, ERG transkripsiyon faktörü ile etkileşime giren yeni bir histon H3'e özgü metiltransferaz". Onkojen. 21 (1): 148–52. doi:10.1038 / sj.onc.1204998. PMID 11791185.
Nielsen PR, Nietlispach D, Mott HR, vd. (2002). "HP1 kromomainin yapısı, lizin 9'da metillenmiş histon H3'e bağlanmıştır". Doğa. 416 (6876): 103–7. Bibcode:2002Natur.416..103N. doi:10.1038 / nature722. PMID 11882902. S2CID 4423019.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Koessler H, Doenecke D, Albig W (2003). "İnsan tümör hücre çizgilerinde replikasyona bağlı histon h3 alt tip genlerinin anormal ekspresyon modeli". DNA Hücresi Biol. 22 (4): 233–41. doi:10.1089/104454903321908629. PMID 12823900.
Coleman MA, Miller KA, Beernink PT, vd. (2004). "Protein mikro dizileri kullanarak kromatin ile ilgili protein etkileşimlerinin belirlenmesi". Proteomik. 3 (11): 2101–7. doi:10.1002 / pmic.200300593. PMID 14595808. S2CID 23471253.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). "Histon asetilasyonu ve LTR promoterinde faktör alımı yoluyla HIV-1 gen ekspresyonunun düzenlenmesi". EMBO J. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Citterio E, Papait R, Nicassio F, vd. (2004). "Np95, ubikitin ligaz aktivitesi ile donatılmış bir histon bağlayıcı proteindir". Mol. Hücre. Biol. 24 (6): 2526–35. doi:10.1128 / MCB.24.6.2526-2535.2004. PMC 355858. PMID 14993289.

Bu protein ile ilgili makale bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000275714 - Topluluk, Mayıs 2017

[2] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[3] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid9119399-4] Albig W, Kioschis P, Poustka A, Meergans K, Doenecke D (Nisan 1997). "İnsan histon geni organizasyonu: büyük bir küme içinde düzensiz düzenleme". Genomik. 40 (2): 314–22. doi:10.1006 / geno.1996.4592. PMID 9119399.

[pmid12408966-5] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (Ekim 2002). "İnsan ve fare replikasyonuna bağlı histon genleri". Genomik. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-6] "Entrez Geni: HIST1H3A histon kümesi 1, H3a".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]