HLA-DRB5 - HLA-DRB5

HLA-DRB5
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1FV1, 1Ç15, 1HQR, 1ZGL
Tanımlayıcılar
Takma adlar	HLA-DRB5, HLA-DRB, majör histo-uyumluluk kompleksi, sınıf II, DR beta 5
Harici kimlikler	OMIM: 604776 MGI: 95901 HomoloGene: 101524 GeneCard'lar: HLA-DRB5
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 6 (insan)
Son	32,530,287 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 17 (fare)
Son	34,316,674 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• peptid antijen bağlanması;
Hücresel bileşen	• zarın ayrılmaz bileşeni; • endositik vezikül zarı; • klatrin kaplı endositik vezikül zarı; • endozom; • Golgi cihazı; • trans-Golgi ağ zarı; • endoplazmik retikulum zarı; • zar; • geç endozom zarı; • Golgi zarı; • hücre zarı; • taşıma vezikül zarı; • MHC sınıf II protein kompleksi; • lizozomal membran; • endoplazmik retikulum; • ER'den Golgi'ye taşıma vezikül membranı; • lizozom; • endoplazmik retikulum membranının lümenal tarafının ayrılmaz bileşeni; • endozom zarı; • hücre dışı eksozom;
Biyolojik süreç	• antijen işleme ve sunumu; • MHC sınıf II aracılığıyla eksojen peptit antijeninin antijen işleme ve sunumu; • interferon-gamma-aracılı sinyal yolu; • bağışıklık sistemi süreci; • T hücre kostimülasyonu; • MHC sınıf II aracılığıyla peptit veya polisakkarit antijeninin antijen işleme ve sunumu; • bağışıklık tepkisi; • T hücresi reseptör sinyal yolu; • adaptif bağışıklık tepkisi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	3127
	14969
	ENSG00000198502
	ENSMUSG00000060586
	Q30154
P04231; P04230; P18468; P18469; O78196;
	yok
	NM_002125
	NM_010382
	NP_002116
	NP_034512
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

HLA sınıf II histo-uyumluluk antijeni, DRB5 beta zinciri bir protein insanlarda kodlanır HLA-DRB5 gen.^[5]

Fonksiyon

protein Bu gen tarafından kodlanan HLA sınıf II beta zinciri Paraloglar. Sınıf II molekülü, her ikisi de membrana sabitlenmiş bir alfa (DRA) ve bir beta zincirinden (DRB) oluşan bir heterodimerdir. Merkezi bir rol oynar. bağışıklık sistemi hücre dışı proteinlerden türetilen peptitleri sunarak. Sınıf II moleküller olarak ifade edilir antijen sunan hücreler (APC: B lenfositleri, dendritik hücreler, makrofajlar).^[5]

Gen yapısı ve polimorfizmler

Beta zinciri yaklaşık 26-28 kDa'dır. 6 ile kodlanmıştır Eksonlar, ekson bir lider peptidi kodlar, eksonlar 2 ve 3 iki hücre dışı etki alanları ekson 4, zar ötesi etki alanı ve ekson 5 kodlar sitoplazmik kuyruk. DR molekülü içinde beta zinciri tüm polimorfizmler peptit bağlanma spesifikliklerinin belirlenmesi. Yüzlerce DRB1 aleller tanımlanmıştır ve bu polimorfizmler için tiplendirme rutin olarak kemik iliği ve böbrek nakli için yapılır.^[5]

Gen ifadesi

DRB1 paraloglarından beş kat daha yüksek bir seviyede ifade edilir DRB3, DRB4 ve DRB5. DRB1 tüm bireylerde mevcuttur. DRB1'in alelik varyantları, DRB3, DRB4 ve DRB5 genlerinin hiçbiriyle veya biriyle bağlantılıdır. DRB5'in varlığı DRB1'in allelik varyantları ile bağlantılıdır, aksi takdirde ihmal edilir. 4 ilişkili sözde gen vardır: DRB2, DRB6, DRB7, DRB8 ve DRB9.^[5]

Ayrıca bakınız

HLA-DR

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000198502 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000060586 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b ^c ^d "Entrez Geni: HLA-DRB5 majör doku uyumluluk kompleksi, sınıf II, DR beta 5".

daha fazla okuma

Lau M, Terasaki PI, Park MS (1995). "Uluslararası Hücre Değişimi, 1994". Klinik Nakiller: 467–88. PMID 7547576.
Dong RP, Kimura A, Sasazuki T (1992). "Üç yeni DRw14-DRB1 alelinin sekans analizi". İmmünogenetik. 36 (2): 130–3. doi:10.1007 / BF00215291. PMID 1612646. S2CID 32928324.
Piatier-Tonneau D, Gastinel LN, Amblard F, vd. (1991). "CD4'ün HLA sınıf II antijenleri ve HIV gp120 ile etkileşimi". İmmünogenetik. 34 (2): 121–8. doi:10.1007 / BF00211424. PMID 1869305. S2CID 10116507.
Nong Y, Kandil O, Tobin EH, vd. (1991). "HIV çekirdek proteini p24, insan monosit benzeri hücre hattı THP1'de interferon-gama ile indüklenen HLA-DR ve sitokrom b ağır zincir mRNA seviyelerinde artışı inhibe eder". Hücre. Immunol. 132 (1): 10–6. doi:10.1016 / 0008-8749 (91) 90002-S. PMID 1905983.
Rosenstein Y, Burakoff SJ, Herrmann SH (1990). "HIV-gp120, CD4 sınıfı II MHC aracılı yapışmayı bloke edebilir". J. Immunol. 144 (2): 526–31. PMID 1967269.
Callahan KM, Fort MM, Obah EA, vd. (1990). "HIV-1 gp120'deki genetik değişkenlik, HLA molekülleri ve T hücre reseptörü ile etkileşimleri etkiler". J. Immunol. 144 (9): 3341–6. PMID 1970352.
Petersdorf EW, Griffith RL, Erlich HA, vd. (1990). "Farklı DRw6 haplotiplerinde ifade edilen iki HLA-DRB1 geni için benzersiz diziler". İmmünogenetik. 32 (2): 96–103. doi:10.1007 / BF00210446. PMID 1975801. S2CID 28007432.
Bowman MR, MacFerrin KD, Schreiber SL, Burakoff SJ (1991). "İnsan immün yetmezlik virüsü zarf glikoproteini gp120 ve sınıf II majör histo-uyumluluk kompleks molekülleri ile etkileşime dahil olan CD4'ün V1 bölgesindeki kalıntıların belirlenmesi ve yapısal analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 87 (22): 9052–6. doi:10.1073 / pnas.87.22.9052. PMC 55099. PMID 1978941.
Gyllensten UB, Sundvall M, Erlich HA (1991). "Allelik çeşitlilik primatların DRB1 lokusundaki intraekson sekans değişimi ile üretilir". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 88 (9): 3686–90. Bibcode:1991PNAS ... 88.3686G. doi:10.1073 / pnas.88.9.3686. PMC 51517. PMID 2023919.
Lee KW, Johnson AH, Hurley CK (1990). "İki farklı evrim yolu DRw13 haplotiplerine yol açtı". J. Immunol. 145 (9): 3119–25. PMID 2212675.
Gorski J (1989). "HLA-DR beta zinciri polimorfizmi. İkinci alan polimorfizmi, alellerin evrimsel ilişkisini yansıtır ve genel serolojik epitopları açıklayabilir". J. Immunol. 143 (1): 329–33. PMID 2471740.
Clayton LK, Sieh M, Dindar DA, Reinherz EL (1989). "Sınıf II MHC'ye karşı HIV-1 gp120 bağlanmasını etkileyen insan CD4 kalıntılarının belirlenmesi". Doğa. 339 (6225): 548–51. Bibcode:1989Natur.339..548C. doi:10.1038 / 339548a0. PMID 2543930. S2CID 4246781.
Hurley CK, Gregersen PK, Gorski J, vd. (1989). "DR3 (w18), DQw4 haplotipi, birçok sınıf II lokusundaki DR3 (w17), DQw2 haplotiplerinden farklıdır". Hum. Immunol. 25 (1): 37–50. doi:10.1016/0198-8859(89)90068-2. PMID 2565895.
Diamond DC, Sleckman BP, Gregory T, ve diğerleri. (1988). "HIV zarf proteini, gp120 tarafından CD4 + T hücre fonksiyonunun inhibisyonu". J. Immunol. 141 (11): 3715–7. PMID 2846691.
Freeman SM, Saunders TL, Madden M ve diğerleri. (1987). "Diyabetik ve normal bireylerden DR beta 1 alellerinin karşılaştırılması". Hum. Immunol. 19 (1): 1–6. doi:10.1016/0198-8859(87)90033-4. PMID 2884201.
Lee BS, Pas NA, McMichael AJ, McDevitt HO (1987). "HLA-DR2 alt tipleri, DR beta alellerinin ek bir süpertipik ailesini oluşturur". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 84 (13): 4591–5. Bibcode:1987PNAS ... 84.4591L. doi:10.1073 / pnas.84.13.4591. PMC 305136. PMID 2885840.
Owerbach D, Zengin C, Taneja K (1986). "HLA-DR 3/4 insüline bağımlı diyabetik bir hastadan izole edilmiş üç HLA-DR beta geninin karakterizasyonu". İmmünogenetik. 24 (1): 41–6. doi:10.1007 / BF00372296. PMID 3015788. S2CID 19599710.
Wu S, Saunders TL, Bach FH (1987). "İki DR beta lokusu arasındaki karşılıklı intergenik değişim tarafından üretilen insan Ia antijenlerinin polimorfizmi". Doğa. 324 (6098): 676–9. doi:10.1038 / 324676a0. PMID 3099214. S2CID 4365990.
Liu CP, Bach FH, Wu SK (1988). "Nadir bir DR2 / LD-5a / DQw3 HLA sınıf II haplotipinin moleküler çalışmaları. Polimorfik HLA sınıf II genlerinin oluşturulmasında çoklu genetik mekanizmalar". J. Immunol. 140 (10): 3631–9. PMID 3129499.
Steimle V, Hinkkanen A, Schlesier M, Epplen JT (1988). "DRw11 haplotipinden yeni bir HLA-DR beta I dizisi". İmmünogenetik. 28 (3): 208–10. doi:10.1007 / BF00375861. PMID 3137159. S2CID 2712069.

Bu protein ile ilgili makale bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000198502 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000060586 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[Entrez_Gene_3127-5] "Entrez Geni: HLA-DRB5 majör doku uyumluluk kompleksi, sınıf II, DR beta 5".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Başlıca doku uyumluluk kompleksi sınıflar
MHC sınıf I	HLA-A HLA-B HLA-C HLA-E HLA-F HLA-G
MHC sınıf II	HLA-DM α β HLA-DO α β HLA-DP α1 β1 HLA-DQ α1 α2 β1 β2 β3 HLA-DR α β1 β3 β4 β5
Diğer	Insan lökosit antijeni Küçük doku uygunluk antijeni Kan nakli Tutuklama Calgranulin İnsan kan grubu sistemleri Hücre yapışma molekülleri Farklılaşma kümesi