Hepatit B virüsü PRE 1151–1410 - Hepatitis B virus PRE 1151–1410

Hepatit B virüsü PRE 1151–1410
RF02816.svg
Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma Hepatit B virüsü PRE 1151–1410
Tanımlayıcılar
RfamRF02816
Diğer veri
Alan (lar)Virüsler
GİTGO terimi GO ile başlamalıdır:,GO terimi GO ile başlamalıdır:
YANİİşletim Sistemi: 0005836
PDB yapılarPDBe

Hepatit B virüsü PRE 1151–1410 (HBV transkripsiyon sonrası düzenleyici eleman, nükleotidler 1151-1410), 500 baz çifti uzunluğunda HBV PRE'nin bir parçasıdır ve Hepatit B virüs (HBV) RNA dışa aktarma elemanı.[1][2][3] Bununla birlikte, işlev tartışmalıdır ve PRE içinde yeni düzenleyici unsurlar öngörülmüştür.[4] PRE 1151-1410, intronsuz transkriptlerin nükleer dışa aktarımını artırır ve ekleme mekanizmasını tam uzunluktaki PRE ile karşılaştırılabilir bir dereceye kadar bastırır. Bu nedenle, çekirdek HBV PRE öğesi olduğu önerildi.[4] PRE1151–1410, bilinen 3 düzenleyici öğe içerir: ÖN SL-alfa (nükleotidler 1292–1321),[5] insan La protein bağlanma bölgesi (nükleotid 1275–1291),[6] SRE-1 (nükleotidler 1252–1348).[7]

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Panjaworayan N, Roessner SK, Firth AE, Brown CM (Aralık 2007). "HBVRegDB: Hepatit B virüsü dizilerinde düzenleyici öğelerin ek açıklaması, karşılaştırması, tespiti ve görselleştirilmesi". Viroloji Dergisi. 4: 136. doi:10.1186 / 1743-422X-4-136. PMC  2235840. PMID  18086305.
  2. ^ Huang J, Liang TJ (Aralık 1993). "HBV gen ürünlerinin ekspresyonu için gerekli olan Rev yanıt öğesi benzeri özelliklere sahip yeni bir hepatit B virüsü (HBV) genetik öğesi". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 13 (12): 7476–7486. doi:10.1128 / mcb.13.12.7476. PMC  364819. PMID  8246965.
  3. ^ Huang ZM, Yen TS (Mayıs 1994). "Sitoplazmada yüzey gen transkriptlerinin birikmesini kolaylaştıran Hepatit B virüsü RNA öğesi". Journal of Virology. 68 (5): 3193–3199. doi:10.1128 / JVI.68.5.3193-3199.1994. PMC  236810. PMID  8151782.
  4. ^ a b Visootsat A, Payungporn S, T-Thienprasert NP (Aralık 2015). "Hepatit B virüsü post-transkripsiyonel düzenleyici eleman içindeki korunmuş bir RNA yapısal elemanı, intronsuz transkriptlerin nükleer dışa aktarımını arttırır ve ekleme mekanizmasını bastırır". Moleküler Biyoloji Raporları. 42 (12): 1603–1614. doi:10.1007 / s11033-015-3928-0. PMID  26514143.
  5. ^ Panjaworayan N, Payungporn S, Poovorawan Y, Brown CM (Eylül 2010). "Hepatit B virüsü transkripsiyon sonrası düzenleyici öğe içinde etkili bir siRNA hedef bölgesinin ve işlevsel düzenleyici öğelerin belirlenmesi". Viroloji Dergisi. 7: 216. doi:10.1186 / 1743-422X-7-216. PMC  2945954. PMID  20822550.
  6. ^ Ehlers I, Horke S, Reumann K, Rang A, Grosse F, Will H, Heise T (Ekim 2004). "İnsan La ve hepatit B virüsü RNA'sı arasındaki etkileşimin fonksiyonel karakterizasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 279 (42): 43437–43447. doi:10.1074 / jbc.M402227200. PMID  15302879.
  7. ^ Heise T, Sommer G, Reumann K, Meyer I, Will H, Schaal H (2006). "Hepatit B virüsü PRE bir bağlayıcı düzenleyici öğe içerir". Nükleik Asit Araştırması. 34 (1): 353–363. doi:10.1093 / nar / gkj440. PMC  1331995. PMID  16410615.