KIAA1958 - KIAA1958 - Wikipedia

KIAA1958
Tanımlayıcılar
Takma adlarKIAA1958
Harici kimliklerOMIM: 617390 HomoloGene: 136743 GeneCard'lar: KIAA1958
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 9 (insan)
Chr.Kromozom 9 (insan)[1]
Kromozom 9 (insan)
KIAA1958 için genomik konum
KIAA1958 için genomik konum
Grup9q32Başlat112,486,847 bp[1]
Son112,669,397 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001287036
NM_001287038
NM_133465

yok

RefSeq (protein)

NP_001273965
NP_001273967
NP_597722

yok

Konum (UCSC)Chr 9: 112.49 - 112.67 Mbyok
PubMed arama[2]yok
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle

Protein KIAA1958 bir protein insanlarda KIAA1958 tarafından kodlandığı gen.[3] Ortologlar KIAA1958'in evrime kadar geriye gitmesi akorlar homolojide daha yakın olmasına rağmen primatlar diğer ortologlardan daha fazla. KIAA1958'in bilinmeyen paraloglar.

Gen

KIAA1958 uzun kolunda bulunur kromozom 9 (9.q32), 115249248'den 115427597'ye artı sarmal üzerindeki insanlarda.[4] MRNA'sı 2683 bp'ye sahiptir.[3] Gen, kromozom 9'da şu komşulara sahiptir:

KIAA1958 gen komşuları

HSDL2: Hidroksisteroid dehidrojenaz benzeri protein 2, nükleotid bağlayıcı oksidoredüktaz aktivite ve sterol bağlayıcı.[5]

C9orf147: Kromozom 9 açık okuma çerçevesi 147'nin bilinmeyen bir işlevi var.[6]

C9orf80: Kromozom 9 açık okuma çerçevesi 80, MRN kompleksinin aşağı akışını desteklemek için işlev gören bir multiprotein kompleksi olan SOSS kompleksinin bir bileşenidir. DNA onarımı ve G2 /M kontrol noktası. SOSS kompleksi, DNA lezyonlarında tek sarmallı DNA ile birleşir ve hücreseldeki çeşitli uç noktaları etkiler. DNA hasarı dahil yanıt hücre döngüsü kontrol noktası aktivasyon, rekombinasyonel onarım ve genomik stabilitenin korunması.[7]

SNX30: nexin-30 sıralama, fosfatidilinositol bağlayıcı.[8]

İfade

KIAA1958, en yüksek miktarlarda ifade edilir. gırtlak EST tarafından önerildiği gibi.[9] En yüksek ifade Gelişim evresi ... Blastosist ve sağlık durumu için en çok şurada bulunur: rahim tümörleri.[9]NCBI GEO Profilinden Veriler[10] KIAA1958 ekspresyonunun insan vücudundaki birçok doku tipini içerdiğini gösterir. EMBL-EBI kullanılarak, KIAA1958'in yalancı ayaklı RNA'nın göçü sırasında metastatik kanser hücreler.[11] KIAA1958, prostat kanseri hücrelerinin büyümesi ve yaşayabilirliği için kritik olduğu bildirilen transkripsiyon faktörleri olan Stat5 / ab ve stat 3'te de aşırı eksprese edilmiştir.[11] ve ikisi de Embriyonik kök hücre ve pluripotent kök hücre.[11]

Protein

KIAA1958 tahmini fosforile siteler

KIAA1958, 716'dan oluşur amino asitler ve 6.375 izo-elektrik noktası ile 79212 Da ağırlığındadır.[12] KIAA1958 proteini hakkında çok fazla şey bilinmemekle birlikte, KIAA1958'in yapısı ve işlevi ile ilgili tahminler için süper bilgisayarlar kullanılarak bilimsel tahminler yapılmıştır. KIAA1958 geçiyor çeviri sonrası değişiklikler. En ilginç değişiklik fosforilasyon. Diğer proteinlerle karşılaştırıldığında, KIAA1958, post-translasyonel modifikasyon sırasında önemli ölçüde önemli miktarda fosforile serine sahiptir. 36 serinin fosforile olduğu tahmin edilmektedir.

Yapısı

PELE on SDSC Biology WorkBench, KIAA1958 proteininin ikincil yapısını tahmin edebilen bir süper bilgisayardır.[13] Bu araca göre, proteinin ikincil yapısı, neredeyse eşit miktarda alfa sarmalları ve beta yapraklarının bir kombinasyonudur ve protein içinde neredeyse eşit olarak yayılır.

Etkileşimler

KIAA1958'in şu anda başka herhangi bir proteinle etkileşime girdiğine dair bilinen bir kanıt yoktur.[14]

Homoloji

Cins ve TürlerYaygın isimErişim numarasıSeq. UzunlukSeq. KimlikSeq. Benzerlik
Pan troglodytesŞempanzeXM_5283917945 bp99%99%
Mus musculusFareBAC38268719 bir97%98%
Callithrix jacchus Ortak marmosetXM_0027432042346bp97%82%
Pongo abeliiSumatra OrangutanXM_0028201121120bp96%4%
Sus scrofaYaban domuzuXM_0031220702502 bp93%81%
Ailuropoda melanoleucaDev PandaXM_0029259382151 bp85%91%
Nomascus leucogenysBeyaz yanaklı gibbonXM_003263945950 bp93%5%
Oryctolagus cuniculusAvrupa tavşanıXM_0027079902223 bp93%43%
Loxodonta africana Afrika çalı filiXM_0034075212388 bp93%80%
Cricetulus griseus Çin hamsteriXM_0035055082534 bp92%42%
Equus caballusAtXM_0019163022536 bp91%93%
Bos taurusİnekXM_876102.52480 bp91%81%
Rattus norvegicusSıçanXM_0027265321364 bp91%36%
Cavia porcellusGine domuzuXM_0034637912217 bp91%43%
Monodelphis domesticaOpossumXM_0013759762217 bp78%41%
Branchiostoma floridaeLanceletXP_002611438719 bir29%48%
Amphimedon queenslandicaSüngerXP_003390994388 bir25%48%
Acyrthosiphon pisumBezelye yaprak bitiXP_0019437201197 aa24%43%
Oikopleura dioicaAkordeCBY34656629 a22%43%
Ciona intestinalisVazo tunikXP_0021259641004 aa23%43%
Xenopus (silurana) tropicalisBatı Pençeli kurbağaAAI61073679 bir23%43%
Halocynthia roretziDeniz ananasBAB40645980 a23%45%

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000165185 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  3. ^ a b "Homo sapiens KIAA1958 (KIAA1958), mRNA". NCBI. Alındı 20 Nisan 2012.
  4. ^ "Homo sapiens geni KIAA1958, KIAA1958'i kodlar". AceView. Alındı 19 Nisan 2012.
  5. ^ "Q6YN16 (HSDL2_HUMAN) İncelendi, UniProtKB / Swiss-Prot". UniProt. Alındı 1 Mayıs 2012.
  6. ^ "Homo sapiens geni C9orf147, kodlama kromozom 9 açık okuma çerçevesi 147". AceView. Alındı 1 Mayıs 2012.
  7. ^ "Q9NRY2 (SOSSC_HUMAN) İncelendi, UniProtKB / Swiss-Prot". Alındı 1 Mayıs 2012.
  8. ^ "Q5VWJ9 (SNX30_HUMAN) İncelendi, UniProtKB / Swiss-Prot". Alındı 1 Mayıs 2012.
  9. ^ a b "Unigene EST profili". Unigene. Alındı 8 Mayıs 2012.
  10. ^ "Coğrafi Profiller". NCBI. Alındı 28 Nisan 2012.
  11. ^ a b c "Gen İfade Profilleri". Embl-Ebi. Alındı 8 Mayıs 2012.
  12. ^ "Biyoloji WorkBench". SDSC. Alındı 3 Mayıs 2012.
  13. ^ "Biyoloji Tezgahı". SDSC Biyoloji WorkBench. Alındı 28 Nisan 2012.
  14. ^ "Protein Etkileşimleri". Dize. Alındı 7 Mayıs 2012.

daha fazla okuma