Lorena S. Beese - Lorena S. Beese

Lorena Beese James B. Duke Biyokimya Profesörüdür. Duke Üniversitesi. Biyofizik alanında doktora derecesini Brandeis Üniversitesi ve doktora sonrası çalışmasını Yale Üniversitesi'nde Dr. Thomas A. Steitz ile yaptı. 2009 yılında Dr. Beese seçilmiştir. Ulusal Bilimler Akademisi.^[1]

Beese'in araştırma ilgi alanları, DNA replikasyonunun yapısal biyokimyası ve insan DNA uyuşmazlığı onarımı ve bunun karsinojenez ile bağlantısını içerir. Ayrıca, antikanser terapötiklerinin yapı temelli keşfi için hedefler olarak protein prenilasyon enzimleriyle ve bu tür terapötiklerin patojenik mantar ve sıtmayı tedavi etmek için yeniden amaçlanmasıyla ilgilenmektedir.^[2]

Kariyer

Beese 2008'de araştırmasını yayınladı. Candida albicans geranilgeraniltransferaz-1 (GGTase-1) protein yapısı.^[3] Candida albicans genellikle insan mikrobiyotasında bulunan fırsatçı bir patojendir. Bağışıklığı zayıflamış bireyde, Candida albicans mantar önleyici tedavilere direnç gösteren enfeksiyonlarla sonuçlanır.^[4] Bir GGTases-1 yapısının araştırılması ve keşfi Candida albicans patojenin hayatta kalmasındaki proteinin önemini anlamaları için bilim insanlarına daha fazla bilgi sağlar ve hastalığın tedavisi için hedeflenme potansiyelini önerir.^[3]

2011'de Duke Üniversitesi'ndeyken Beese, meslektaşı Eugene Wu ile birlikte, yanlış baz eşleşmesinin tanınması ve düzeltilmesi sırasında gözlemlenen DNA Polimerazının yapısal adaptasyonunu araştırdı. Bulguları, DNA replikasyonu sırasında polimerazın karakteristik "açık" ve "kapalı" durumları arasında bir ara durumu içeriyordu. Bu aracı, "Aralık" onayı olarak adlandırıldı. Beese, büyüyen DNA'ya yanlış bir nükleotid sokmanın DNA polimerazın helikazında bir bükülmeye neden olduğunu buldu. Bu bulgu, polimerazların yanlış baz eşleşmesini tespit edebildiği bir mekanizma önermektedir.^[5]

Beese, hExo1'in DNA hasarını belirlediği uyumsuzluk onarım mekanizmasının belirlenmesinde ayrılmaz bir role sahipti. DNA'nın bütünlüğünü korumak için İnsan ekzonükleaz 1 (hExo1) gibi enzimler DNA'daki hasarları onarır. Beese, araştırması sayesinde, hExo1 enziminin DNA'yı uyumsuz eşleşme bölgesi yakınında bağladığını ve eksonükleaz ve endonükleaz aktivitesi yoluyla enzimin yanlış baz çiftlerinin tanımlanmasına ve değiştirilmesine yardımcı olabileceğini buldu.^[6]

Beese'in araştırma ilgi alanları şunları içerir:

• Sinyal iletimi
• Yapı bazlı ilaç tasarımı
• DNA kopyalama
• DNA uyuşmazlığı onarımı
• Enzimleri çalışırken gözlemlemek

Seçilmiş işler

• Orans, J. McSweeney; Iyer, R.R .; Hast, M.A .; Hellinga, H.W .; Modrich, P .; Beese, L.S. (2011). "İnsan ekzonükleaz 1 DNA komplekslerinin yapısı, nükleaz ailesi için birleşik bir mekanizma önermektedir". Hücre. 145 (2): 212–223. doi:10.1016 / j.cell.2011.03.005. PMC  3093132. PMID  21496642.
• Wu, E.Y .; Beese, L.S. (2011). "Uyumsuz bir nükleotide bağlanmış yüksek sadakatli bir DNA polimerazın yapısı, nükleotid seçim mekanizmasında aralıklı bir ara konformasyonu ortaya çıkarır". J Biol Kimya. 286 (22): 19758–67. doi:10.1074 / jbc.M110.191130. PMC  3103354. PMID  21454515.
• Hast, M.A .; Fletcher, S .; Cummings, C.G .; Pusateri, E.E .; Blaskovich, M.A .; Rivas, K .; Gelb, M.H .; Van Voorhis, C.V .; Sebti, S.M .; Hamilton, A.D .; Beese, L.S. (2009). "Sıtma önleyici ve antikanser etilendiamin inhibitörlerinin protein farnesiltransferaza bağlanması ve seçiciliği için yapısal temel". Kimya ve Biyoloji. 16 (2): 181–192. doi:10.1016 / j.chembiol.2009.01.014. PMC  2671474. PMID  19246009.
• Hast, M.A .; Beese, L.S. (2008). "İnsan patojeni Candida albicans'tan bir lipid substratı ile komplekslenmiş protein geranilgeraniltransferaz-I'in yapısı". J Biol Kimya. 283 (46): 31933–40. doi:10.1074 / jbc.M805330200. PMC  2581548. PMID  18713740.
• Warren, JJ; Pohlhaus, TJ; Changela, A; Iyer, RR; Modrich, PL; Beese, LS (2007). "İnsan MutSalpha DNA lezyon tanıma kompleksinin yapısı". Mol Hücresi. 26 (4): 579–92. doi:10.1016 / j.molcel.2007.04.018. PMID  17531815.
• Warren, J.J .; Forsberg, L.J .; Beese, L.S. (2006). "O6-metil-guanin lezyonlarının mutajenitesinin yapısal temeli". Proc. Natl. Acad. Sci. Amerika Birleşik Devletleri. 103 (52): 19701–6. Bibcode:2006PNAS..10319701W. doi:10.1073 / pnas.0609580103. PMC  1750904. PMID  17179038.
• Terry, K.L .; Casey, P.J .; Beese, L.S. (2006). "Protein farnesiltransferazın bir geranilgeraniltransferaza dönüştürülmesi". Biyokimya. 45 (32): 9746–55. doi:10.1021 / bi060295e. PMID  16893176.
• Lane, K.T .; Beese, L.S. (2006). "Tematik inceleme serisi: lipid translasyon sonrası modifikasyonlar. Protein farnesiltransferaz ve geranilgeraniltransferaz tip I'in yapısal biyolojisi." Lipid Araştırma Dergisi. 47 (4): 681–699. doi:10.1194 / jlr.r600002-jlr200. PMID  16477080.
• Beese, L. ve Harvard Üniversitesi. (2005). Protein preniltransferazların yapısı ve mekanizması: Bir kanser terapötik hedefinin analizi.
• Beese, L. ve Harvard Üniversitesi. (2005). Bir DNA polimerazın yapıları ve mekanizmaları: Nature'ın kopyalayıcısı ve yazım denetleyicisi çalışırken.
• Johnson, S.J .; Beese, L.S. (2004). "Bir DNA polimerazda gözlemlenen uyumsuz replikasyon hatalarının yapıları". Hücre. 116 (6): 803–816. doi:10.1016 / s0092-8674 (04) 00252-1. PMID  15035983.
• Hsu, G.W .; Ober, M .; Carell, T .; Beese, L.S. (2004). "Oksidatif olarak hasar görmüş DNA'nın yüksek doğrulukta bir DNA polimeraz tarafından hataya açık replikasyonu". Doğa. 431 (7005): 217–21. Bibcode:2004Natur.431..217H. doi:10.1038 / nature02908. PMID  15322558.
• Johnson, S.J .; Taylor, J.S .; Beese, L.S. (2003). "Bir polimeraz kristalinde gözlemlenen işlemsel DNA sentezi, çerçeve kayması mutasyonlarının önlenmesi için bir mekanizma önermektedir". Proc. Natl. Acad. Sci. Amerika Birleşik Devletleri. 100 (7): 3895–3900. Bibcode:2003PNAS..100.3895J. doi:10.1073 / pnas.0630532100. PMC  153019. PMID  12649320.
• Taylor, J.S .; Reid, T.S .; Terry, K.L .; Casey, P.J .; Beese, L.S. (2003). "Memeli proteini geranilgeraniltransferaz tip-1'in yapısı". EMBO J. 22 (22): 5963–5974. doi:10.1093 / emboj / cdg571. PMC  275430. PMID  14609943.
• Uzun, SB; Casey, P .; Beese, LS (2002). "Protein farnesiltransferazın atomik çözünürlükte reaksiyon yolu". Doğa. 419 (6907): 645–50. Bibcode:2002Natur.419..645L. doi:10.1038 / nature00986. PMID  12374986.
• Uzun, SB; Hancock, PJ; Kral, AM; Hellinga, HW; Beese, LS (2001). "İnsan proteini farnesiltransferazın kristal yapısı, CaaX tetrapeptidleri ve bunların mimetikleri tarafından inhibisyonun temelini ortaya koymaktadır". Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (23): 12948–53. Bibcode:2001PNAS ... 9812948L. doi:10.1073 / pnas.241407898. PMC  60805. PMID  11687658.
• Kiefer, J. R .; Mao, C .; Braman, J. C .; Beese, L. S. (1998). "Katalitik olarak aktif bir Bacillus DNA polimeraz kristalinde DNA replikasyonunun görselleştirilmesi [yorumlara bakınız]". Doğa. 391 (6664): 304–7. doi:10.1038/34693. PMID  9440698.

Referanslar