MALAT1 ile ilişkili küçük sitoplazmik RNA - MALAT1-associated small cytoplasmic RNA

MALAT1 ile ilişkili küçük sitoplazmik RNA
	Tahmin edilen ikincil yapı ve dizi koruma mascRNA-menRNA'nın
Tanımlayıcılar
Sembol	mascRNA-menRNA
Rfam	RF01684
Diğer veri
RNA tip	Gen
Alan (lar)	Ökaryota
GİT	GO: 2000147
YANİ	İşletim Sistemi: 0001263
PDB yapılar	PDBe

MALAT1 ile ilişkili küçük sitoplazmik RNA, Ayrıca şöyle bilinir mascRNA, bir kodlamayan RNA bulundu sitozol. Bu, kabaca 53-61 nükleotit uzunluğunda küçük bir RNA'dır ve adı verilen çok daha uzun bir ncRNA'dan işlenir. MALAT1 adlı bir enzim tarafından RNaz P.^[1] Bu RNA, birçok farklı insan dokusunda ifade edilir, evrim tarafından yüksek oranda korunur ve dikkate değer bir benzerliği paylaşır. tRNA aynı zamanda RNase P tarafından da üretilir, ancak bu RNA HeLa hücrelerinde aminoasile edilmemiştir. Birincil transkript, MALAT1 (metastaz ile ilişkili akciğer adenokarsinom transkripti 1), birkaç kötü huylu kanserler.^[2]Başka bir küçük RNA homolog menRNA adı verilen mascRNA, MEN beta adı verilen başka bir uzun ncRNA'dan işlenir.^[3]

MALAT1, alternatif ekleme. MALAT1 ile etkileşime girer SR proteinleri, bunların dağılımını etkileyerek nükleer benek alanları.^[4]

Ayrıca bakınız

Referanslar

^ Wilusz JE, Freier SM, Spector DL (2008). "Uzun nükleer tutulan kodlamayan RNA'nın 3 uçlu işlenmesi tRNA benzeri bir sitoplazmik RNA verir". Hücre. 135 (5): 919–932. doi:10.1016 / j.cell.2008.10.012. PMC 2722846. PMID 19041754.
^ Ji P, Diederichs S, Wang W, Böing S, Metzger R, Schneider PM, Tidow N, Brandt B, Buerger H, Bulk E, Thomas M, Berdel WE, Serve H, Müller-Tidow C (2003). "Yeni bir kodlamayan RNA olan MALAT-1 ve timosin beta4, erken evre küçük hücreli olmayan akciğer kanserinde metastazı ve hayatta kalmayı öngörür". Onkojen. 22 (39): 8031–8041. doi:10.1038 / sj.onc.1206928. PMID 12970751.
^ Sunwoo H, Dinger ME, Wilusz JE, Amaral PP, Mattick JS, Spector DL (2009). "MEN epsilon / beta nükleer tutuculu kodlamayan RNA'lar kas farklılaşması üzerine yukarı regüle edilir ve paraspeckle'ların temel bileşenleridir". Genom Res. 19 (3): 347–359. doi:10.1101 / gr.087775.108. PMC 2661813. PMID 19106332.
^ Tripathi V, Ellis JD, Shen Z, Song DY, Pan Q, Watt AT, Freier SM, Bennett CF, Sharma A, Bubulya PA, Blencowe BJ, Prasanth SG, Prasanth KV (2010). "Nükleer Tutulan Kodlamayan RNA MALAT1, SR Ekleme Faktörü Fosforilasyonunu Modüle ederek Alternatif Eklemeyi Düzenliyor". Mol Hücresi. 39 (6): 925–938. doi:10.1016 / j.molcel.2010.08.011. PMC 4158944. PMID 20797886.

daha fazla okuma

Bernard D, Prasanth KV, Tripathi V, Colasse S, Nakamura T, Xuan Z, Zhang MQ, Sedel F, Jourdren L, Coulpier F, Triller A, Spector DL, Bessis A (2010). "Uzun, nükleer tutulan kodlamayan bir RNA, gen ekspresyonunu modüle ederek sinaptogenezi düzenler". EMBO J. 29 (18): 3082–3093. doi:10.1038 / emboj.2010.199. PMC 2944070. PMID 20729808.
Tano K, Mizuno R, Okada T, Rakwal R, Shibato J, Masuo Y, Ijiri K, Akimitsu N (2010). "MALAT-1, motilite ile ilgili genlerin ekspresyonunu etkileyerek akciğer adenokarsinom hücrelerinin hücre hareketliliğini arttırır". FEBS Lett. 584 (22): 4575–4580. doi:10.1016 / j.febslet.2010.10.008. PMID 20937273.

Dış bağlantılar

Bu moleküler veya hücre Biyolojisi makale bir Taslak. Wikipedia'ya şu yollarla yardımcı olabilirsiniz: genişletmek.

[pmid19041754-1] Wilusz JE, Freier SM, Spector DL (2008). "Uzun nükleer tutulan kodlamayan RNA'nın 3 uçlu işlenmesi tRNA benzeri bir sitoplazmik RNA verir". Hücre. 135 (5): 919–932. doi:10.1016 / j.cell.2008.10.012. PMC 2722846. PMID 19041754.

[pmid12970751-2] Ji P, Diederichs S, Wang W, Böing S, Metzger R, Schneider PM, Tidow N, Brandt B, Buerger H, Bulk E, Thomas M, Berdel WE, Serve H, Müller-Tidow C (2003). "Yeni bir kodlamayan RNA olan MALAT-1 ve timosin beta4, erken evre küçük hücreli olmayan akciğer kanserinde metastazı ve hayatta kalmayı öngörür". Onkojen. 22 (39): 8031–8041. doi:10.1038 / sj.onc.1206928. PMID 12970751.

[pmid19106332-3] Sunwoo H, Dinger ME, Wilusz JE, Amaral PP, Mattick JS, Spector DL (2009). "MEN epsilon / beta nükleer tutuculu kodlamayan RNA'lar kas farklılaşması üzerine yukarı regüle edilir ve paraspeckle'ların temel bileşenleridir". Genom Res. 19 (3): 347–359. doi:10.1101 / gr.087775.108. PMC 2661813. PMID 19106332.

[pmid20797886-4] Tripathi V, Ellis JD, Shen Z, Song DY, Pan Q, Watt AT, Freier SM, Bennett CF, Sharma A, Bubulya PA, Blencowe BJ, Prasanth SG, Prasanth KV (2010). "Nükleer Tutulan Kodlamayan RNA MALAT1, SR Ekleme Faktörü Fosforilasyonunu Modüle ederek Alternatif Eklemeyi Düzenliyor". Mol Hücresi. 39 (6): 925–938. doi:10.1016 / j.molcel.2010.08.011. PMC 4158944. PMID 20797886.

[1]

[2]

[3]

[4]