MLH3 - MLH3

MLH3
Tanımlayıcılar
Takma adlar	MLH3, HNPCC7, mutL homolog 3
Harici kimlikler	OMIM: 604395 MGI: 1353455 HomoloGene: 91153 GeneCard'lar: MLH3
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 14 (insan)
Son	75,051,532 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 12 (fare)
Son	85,270,599 bp
RNA ifadesi Desen
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• uyumsuz DNA bağlanması; • kromatin bağlama; • sentromerik DNA bağlanması; • tek sarmallı DNA bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama; • uydu DNA bağlanması; • ATP bağlama; • ATPase etkinliği;
Hücresel bileşen	• kiazma; • erkek germ hücre çekirdeği; • yoğunlaştırılmış nükleer kromozom; • uyumsuz onarım kompleksi; • sinaptonemal kompleks; • hücre çekirdeği; • yoğun kromozom; • MutLalpha kompleksi;
Biyolojik süreç	• protein lokalizasyonu; • karşılıklı mayotik rekombinasyon; • erkek mayotik çekirdek bölümü; • DNA hasar uyarısına hücresel yanıt; • sinaptonemal karmaşık montaj; • DNA onarımı; • dişi mayoz ben; • yanlış eşleşme tamiri;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	27030
	217716
	ENSG00000119684
	ENSMUSG00000021245
	Q9UHC1
	n / a
	NM_001040108; NM_014381
	NM_145446; NM_175337; NM_001304475
	NP_001035197; NP_055196
	n / a
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

DNA uyuşmazlığı onarım proteini Mlh3 bir protein insanlarda kodlanır MLH3 gen.^[5]^[6]

Fonksiyon

Bu gen, MutL-homolog (MLH) DNA uyuşmazlığı onarım (MMR) genleri ailesinin bir üyesidir. MLH genleri, DNA replikasyonu sırasında ve mayotik rekombinasyondan sonra genomik bütünlüğün korunmasında rol oynar. Bu gen tarafından kodlanan protein, diğer aile üyeleri ile bir heterodimer olarak işlev görür. Bu gendeki somatik mutasyonlar, mikro uydu dengesizliği sergileyen tümörlerde sıklıkla meydana gelir ve germ hattı mutasyonları, kalıtsal polipozis dışı kolorektal kanser tip 7 (HNPCC7) ile ilişkilendirilmiştir. Çeşitli alternatif olarak eklenmiş transkript varyantları tanımlanmıştır, ancak sadece iki transkript varyantının tam uzunlukta doğası belirlenmiştir.^[6] İnsan MLH3 ortologları, fare ve tomurcuklanan maya gibi diğer organizmalarda da incelenmiştir. Saccharomyces cerevisiae.

Mayoz

MLH3 proteini, DNA uyuşmazlığı onarımındaki rolüne ek olarak, mayotik geçişte de rol oynar.^[7] MLH3 bir heterodimer ile MLH1 fare için gerekli gibi görünen oositler metafaz II ile ilerlemek mayoz.^[8]

Çift sarmallı bir kırılma veya boşlukla başlatılan ve ardından rekombinasyonel onarım sürecini başlatmak için homolog bir kromozom ve sarmal istilası ile eşleştirilen güncel bir mayotik rekombinasyon modeli. Boşluğun onarımı, kuşatma bölgelerinin çaprazlanmasına (CO) veya geçmemesine (NCO) yol açabilir. Yukarıda sağda gösterilen Çift Holliday Bağlantı (DHJ) modeli ile CO rekombinasyonunun meydana geldiği düşünülmektedir. NCO rekombinantlarının, yukarıda solda gösterilen Sentez Bağımlı İplik Tavlama (SDSA) modeliyle oluştuğu düşünülmektedir. Çoğu rekombinasyon olayının SDSA tipi olduğu görülmektedir.

MLH1-MLH3 heterodimerleri, geçişleri destekler.^[7] Rekombinasyon mayoz sırasında, eşlik eden diyagramda gösterildiği gibi, genellikle bir DNA çift sarmallı kırılma (DSB) ile başlatılır. Rekombinasyon sırasında, DNA'nın kırığın 5 'uçlarındaki bölümleri, adı verilen bir işlemle kesilir. rezeksiyon. İçinde kıyı istilası Bunu izleyen adım, kırık DNA molekülünün sarkan 3 'ucu daha sonra bir DNA'nın DNA'sını "işgal eder". homolog kromozom bu kırılmamış bir yer değiştirme döngüsü (D-döngüsü) oluşturur. İp istilasından sonra, diğer olaylar dizisi, bir çapraz geçişe (CO) veya çapraz olmayan (NCO) rekombinanta yol açan iki ana yoldan birini takip edebilir (bkz. Genetik rekombinasyon. Bir CO'ya giden yol, bir çift Holliday kavşağı (DHJ) orta. CO rekombinasyonunun tamamlanması için Holliday bağlantılarının çözülmesi gerekir.

Tomurcuklanan mayada Saccharomyces cerevisiae farede olduğu gibi, MLH3 bir heterodimer oluşturur MLH1. Meiotic CO, MLH1-MLH3 heterodimer eylemleri yoluyla Holliday bağlantılarının çözülmesini gerektirir. MLH1-MLH3 heterodimer, bir endonükleaz tek iplikli kırılmalar yapan aşırı sargılı çift sarmallı DNA.^[9]^[10] MLH1-MLH3, özellikle Holliday bağlantılarına bağlanır ve Holliday bağlantılarını işlemek için daha büyük bir kompleksin parçası olarak hareket edebilir. mayoz.^[9] MLH1-MLH3 heterodimer (MutL gamma) ile birlikte Exo1 ve Sgs1 (ortoloğu Bloom sendromu helikaz ) tomurcuklanan mayalarda ve memelilerde geçişlerin çoğunu üreten bir ortak molekül çözüm yolu tanımlayın.^[11]

Etkileşimler

MLH3 gösterildi etkileşim ile MSH4.^[12]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000119684 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000021245 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Lipkin SM, Wang V, Jacoby R, Banerjee-Basu S, Baxevanis AD, Lynch HT, Elliott RM, Collins FS (Ocak 2000). "MLH3: memeli mikro uydu kararsızlığı ile ilişkili bir DNA uyuşmazlığı onarım geni". Doğa Genetiği. 24 (1): 27–35. doi:10.1038/71643. PMID 10615123.
^ ^a ^b "Entrez Geni: MLH3 mutL homolog 3 (E. coli)".
^ ^a ^b Sonntag Brown M, Lim E, Chen C, Nishant KT, Alani E (2013). "Mlh3 mutasyonlarının genetik analizi, ekmek mayasında mayoz bölünme sırasında çapraz geçişi teşvik eden faktörler arasındaki etkileşimleri ortaya koymaktadır". G3: Genler, Genomlar, Genetik. 3 (1): 9–22. doi:10.1534 / g3.112.004622. PMC 3538346. PMID 23316435.
^ Kan R, Sun X, Kolas NK, Avdievich E, Kneitz B, Edelmann W, Cohen PE (2008). "DNA uyuşmazlığı onarım yolunun genlerinde mutasyonlar taşıyan dişi farelerde miyotik ilerlemenin karşılaştırmalı analizi". Biol. Reprod. 78 (3): 462–71. doi:10.1095 / biolreprod.107.065771. PMID 18057311.
^ ^a ^b Ranjha L, Anand R, Cejka P (2014). "Saccharomyces cerevisiae Mlh1-Mlh3 heterodimer, Holliday bağlantılarına tercihen bağlanan bir endonükleazdır". J. Biol. Kimya. 289 (9): 5674–86. doi:10.1074 / jbc.M113.533810. PMC 3937642. PMID 24443562.
^ Rogacheva MV, Manhart CM, Chen C, Guarne A, Surtees J, Alani E (2014). "Bir mayotik geçiş ve DNA uyuşmazlığı onarım faktörü olan Mlh1-Mlh3, Msh2-Msh3 ile uyarılan bir endonükleazdır". J. Biol. Kimya. 289 (9): 5664–73. doi:10.1074 / jbc.M113.534644. PMC 3937641. PMID 24403070.
^ Zakharyevich K, Tang S, Ma Y, Hunter N (2012). "Mayozda eklem molekülü çözünürlük yollarının tasvir edilmesi, çapraz geçişe özgü bir çözülmeyi tanımlar". Hücre. 149 (2): 334–47. doi:10.1016 / j.cell.2012.03.023. PMC 3377385. PMID 22500800.
^ Santucci-Darmanin S, Neyton S, Lespinasse F, Saunières A, Gaudray P, Paquis-Flucklinger V (Temmuz 2002). "DNA uyuşmazlığı onarım MLH3 proteini, mayotik hücrelerde MSH4 ile etkileşime girerek, memeli mayotik rekombinasyonunda bu MutL homologunun rolünü destekler". İnsan Moleküler Genetiği. 11 (15): 1697–706. CiteSeerX 10.1.1.586.4478. doi:10.1093 / hmg / 11.15.1697. PMID 12095912.

daha fazla okuma

Sherrington R, Rogaev EI, Liang Y, Rogaeva EA, Levesque G, Ikeda M, Chi H, Lin C, Li G, Holman K, Tsuda T, Mar L, Foncin JF, Bruni AC, Montesi MP, Sorbi S, Rainero I , Pinessi L, Nee L, Chumakov I, Polen D, Brookes A, Sanseau P, Polinsky RJ, Wasco W, Da Silva HA, Haines JL, Perkicak-Vance MA, Tanzi RE, Roses AD, Fraser PE, Rommens JM, St George-Hyslop PH (Haziran 1995). "Erken başlangıçlı ailesel Alzheimer hastalığında yanlış mutasyonlar taşıyan bir genin klonlanması". Doğa. 375 (6534): 754–60. doi:10.1038 / 375754a0. PMID 7596406.
Kondo E, Horii A, Fukushige S (Nisan 2001). "İnsandaki üç MutL heterodimerinin etkileşen alanları: hMLH1, hMLH3, hPMS1 ve hPMS2 içindeki 36 homolog amino asit kalıntısı ile etkileşir". Nükleik Asit Araştırması. 29 (8): 1695–702. doi:10.1093 / nar / 29.8.1695. PMC 31313. PMID 11292842.
Lipkin SM, Wang V, Stoler DL, Anderson GR, Kirsch I, Hadley D, Lynch HT, Collins FS (Mayıs 2001). "DNA uyuşmazlığı onarım geni MLH3'te germ hattı ve somatik mutasyon analizleri: Kolorektal kanserlerdeki somatik mutasyon için kanıt". İnsan Mutasyonu. 17 (5): 389–96. doi:10.1002 / humu.1114. PMID 11317354.
Wu Y, Berends MJ, Sijmons RH, Mensink RG, Verlind E, Kooi KA, van der Sluis T, Kempinga C, van dDer Zee AG, Hollema H, Buys CH, Kleibeuker JH, Hofstra RM (Ekim 2001). "Kalıtsal polipozis dışı kolorektal kanserde MLH3'ün rolü". Doğa Genetiği. 29 (2): 137–8. doi:10.1038 / ng1001-137. PMID 11586295.
Santucci-Darmanin S, Neyton S, Lespinasse F, Saunières A, Gaudray P, Paquis-Flucklinger V (Temmuz 2002). "DNA uyuşmazlığı onarım MLH3 proteini, mayotik hücrelerde MSH4 ile etkileşime girerek, memeli mayotik rekombinasyonunda bu MutL homologunun rolünü destekler". İnsan Moleküler Genetiği. 11 (15): 1697–706. CiteSeerX 10.1.1.586.4478. doi:10.1093 / hmg / 11.15.1697. PMID 12095912.
Hienonen T, Laiho P, Salovaara R, Mecklin JP, Järvinen H, Sistonen P, Peltomäki P, Lehtonen R, Nupponen NN, Launonen V, Karhu A, Aaltonen LA (Ağustos 2003). "MLH3'ün kolorektal kanser yatkınlığında rol oynadığına dair çok az kanıt". Uluslararası Kanser Dergisi. 106 (2): 292–6. doi:10.1002 / ijc.11218. PMID 12800209.
Lenzi ML, Smith J, Snowden T, Kim M, Fishel R, Poulos BK, Cohen PE (Ocak 2005). "İnsan oositlerinde mayoz i sırasında kiazma oluşumuna yol açan moleküler olaylarda aşırı heterojenlik". Amerikan İnsan Genetiği Dergisi. 76 (1): 112–27. doi:10.1086/427268. PMC 1196414. PMID 15558497.
Cannavo E, Marra G, Sabates-Bellver J, Menigatti M, Lipkin SM, Fischer F, Cejka P, Jiricny J (Aralık 2005). "MutL homolog hMLH3'ün insan hücrelerinde ifadesi ve DNA uyuşmazlığı onarımındaki rolü". Kanser araştırması. 65 (23): 10759–66. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-05-2528. PMID 16322221.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (Ocak 2006 ). "Transkripsiyonel modülasyonun çeşitlendirilmesi: insan genlerinin varsayılan alternatif promotörlerinin büyük ölçekli tanımlanması ve karakterizasyonu". Genom Araştırması. 16 (1): 55–65. doi:10.1101 / gr.4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Taylor NP, Powell MA, Gibb RK, Rader JS, Huettner PC, Thibodeau SN, Mutch DG, Goodfellow PJ (Ağu 2006). "Endometriyal kanserde MLH3 mutasyonu". Kanser araştırması. 66 (15): 7502–8. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-0248. PMID 16885347.
Liu HX, Li Y, Jiang XD, Yin HN, Zhang L, Wang Y, Yang J (Eylül 2006). "Ailevi özofagus kanserinde uyumsuzluk onarım geni Mlh3'ün mutasyon taraması". Dünya Gastroenteroloji Dergisi. 12 (33): 5281–6. doi:10.3748 / wjg.v12.i33.5281. PMC 4088192. PMID 16981255.
Korhonen MK, Raevaara TE, Lohi H, Nyström M (Şubat 2007). "HMLH3'ün koşullu nükleer lokalizasyonu, uyumsuzluk onarımında küçük bir aktivite olduğunu gösterir ve HNPCC'de düşük riskli bir gen olarak rolünü destekler". Onkoloji Raporları. 17 (2): 351–4. doi:10.3892 / veya.17.2.351. PMID 17203173.
Erdeniz N, Nguyen M, Deschênes SM, Liskay RM (Ekim 2007). "Varsayılan bir MutLalpha endonükleaz motifini etkileyen mutasyonlar, birden fazla uyumsuzluk onarım fonksiyonunu etkiler". DNA Onarımı. 6 (10): 1463–70. doi:10.1016 / j.dnarep.2007.04.013. PMC 2366940. PMID 17567544.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000119684 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000021245 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid10615123-5] Lipkin SM, Wang V, Jacoby R, Banerjee-Basu S, Baxevanis AD, Lynch HT, Elliott RM, Collins FS (Ocak 2000). "MLH3: memeli mikro uydu kararsızlığı ile ilişkili bir DNA uyuşmazlığı onarım geni". Doğa Genetiği. 24 (1): 27–35. doi:10.1038/71643. PMID 10615123.

[entrez-6] "Entrez Geni: MLH3 mutL homolog 3 (E. coli)".

[Brown-7] Sonntag Brown M, Lim E, Chen C, Nishant KT, Alani E (2013). "Mlh3 mutasyonlarının genetik analizi, ekmek mayasında mayoz bölünme sırasında çapraz geçişi teşvik eden faktörler arasındaki etkileşimleri ortaya koymaktadır". G3: Genler, Genomlar, Genetik. 3 (1): 9–22. doi:10.1534 / g3.112.004622. PMC 3538346. PMID 23316435.

[pmid18057311-8] Kan R, Sun X, Kolas NK, Avdievich E, Kneitz B, Edelmann W, Cohen PE (2008). "DNA uyuşmazlığı onarım yolunun genlerinde mutasyonlar taşıyan dişi farelerde miyotik ilerlemenin karşılaştırmalı analizi". Biol. Reprod. 78 (3): 462–71. doi:10.1095 / biolreprod.107.065771. PMID 18057311.

[Ranjha-9] Ranjha L, Anand R, Cejka P (2014). "Saccharomyces cerevisiae Mlh1-Mlh3 heterodimer, Holliday bağlantılarına tercihen bağlanan bir endonükleazdır". J. Biol. Kimya. 289 (9): 5674–86. doi:10.1074 / jbc.M113.533810. PMC 3937642. PMID 24443562.

[pmid24403070-10] Rogacheva MV, Manhart CM, Chen C, Guarne A, Surtees J, Alani E (2014). "Bir mayotik geçiş ve DNA uyuşmazlığı onarım faktörü olan Mlh1-Mlh3, Msh2-Msh3 ile uyarılan bir endonükleazdır". J. Biol. Kimya. 289 (9): 5664–73. doi:10.1074 / jbc.M113.534644. PMC 3937641. PMID 24403070.

[pmid22500800-11] Zakharyevich K, Tang S, Ma Y, Hunter N (2012). "Mayozda eklem molekülü çözünürlük yollarının tasvir edilmesi, çapraz geçişe özgü bir çözülmeyi tanımlar". Hücre. 149 (2): 334–47. doi:10.1016 / j.cell.2012.03.023. PMC 3377385. PMID 22500800.

[pmid12095912-12] Santucci-Darmanin S, Neyton S, Lespinasse F, Saunières A, Gaudray P, Paquis-Flucklinger V (Temmuz 2002). "DNA uyuşmazlığı onarım MLH3 proteini, mayotik hücrelerde MSH4 ile etkileşime girerek, memeli mayotik rekombinasyonunda bu MutL homologunun rolünü destekler". İnsan Moleküler Genetiği. 11 (15): 1697–706. CiteSeerX 10.1.1.586.4478. doi:10.1093 / hmg / 11.15.1697. PMID 12095912.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]