Methylobacterium extorquens - Methylobacterium extorquens

Methylobacterium extorquens
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
Bakteri
Şube:
Proteobakteriler
Sınıf:
Alfaproteobakteriler
Sipariş:
Rhizobiales
Aile:
Methylobacteriaceae
Cins:
Metilobakteri
Binom adı
Methylobacterium extorquens
(Urakami ve Komagata 1984)
Bousfield ve Green 1985
Eş anlamlı

Bacillus extorquens Bassalik 1913
Vibrio zorla alıyor (Bassalik 1913) Bhat ve Barker 1948
Pseudomonas extorquens (Bassalik 1913) Krasil'nikov 1949
Flavobacterium extorquens (Bassalik 1913) Bassalik ve ark. 1960
Protomonas gasp ediyor (eski Bassalik 1913) Urakami ve Komagata 1984
Methylobacterium chloromethanicum Kato vd. 2005
[1]
Methylobacterium dichloromethanicum Kato vd. 2005[1]

Methylobacterium extorquens bir Gram negatif bakteri. Metilobakteri genellikle pembe görünür ve pembe pigmentli fakültatif metilotroflar olarak sınıflandırılır veya PPFM'ler.[2] Vahşi tip enerji kaynağı olarak hem metan hem de çoklu karbon bileşiklerini kullandığı bilinmektedir.[2] Özellikle, M. extorquens öncelikle metanol kullandığı gözlemlenmiştir ve C1 Bileşikler enerji döngülerinde substratlar olarak.[3]

Genetik yapı

Topraktan izole edildikten sonra, M. extorquens tek bir kromozom 5.71- ölçmeMb.[4] Bakterinin kendisi 70 genler sekizden fazla bölgeler Metanol metabolizması için kullanılan kromozomun[5] Kromozomun bir bölümünde, M. extorquens AM1 iki xoxF metanolde büyümesini sağlayan genler.[6]

M. extorquens AM1 genomu, işlevi bilinmeyen 47.5 kb'lik bir geni kodlar. Bu gen, eksprese edilmeyen üç benzersiz bileşiğin yanı sıra 15.000'den fazla kalıntı uzunluğundaki polipeptidi kodlar.[7] Mikrop kullanır mxa gen[8] metanolü dehidrojenize etmenin ve onu bir enerji kaynağı olarak kullanmanın bir yolu olarak.[7]

Kimyasal kullanım

Methylobacterium extorquens öncelikle C kullanır1 ve C2 büyümek için bileşikler.[9] Birkaç karbon-karbon bağına sahip bileşiklerin kullanılması, bakterinin metanol içeren ortamlarda, örneğin stomaları metanol yayan yaprakların yüzeyinde başarılı bir şekilde büyümesini sağlar.[10] Metanolü hem karbon hem de enerji kaynağı olarak kullanma kabiliyetinin kolonizasyon sırasında avantajlı olduğu gösterilmiştir. Medicago truncatula.[11]

H4MPT'ye bağlı formaldehit oksidasyonu ilk olarak M. extroquens AM1 ve bir organizmanın metilotrofik metabolizma kullanıp kullanmadığını tanımlamak için kullanılmıştır.[7]

Diğer organizmalarla ilişkiler

İçindeki birçok bakteri Metilobakteri cins farklı yaşıyor biyotik toprak, toz ve bitki yaprakları gibi ortamlar.[12] Bu bakterilerden bazıları, simbiyotik Sabit nitrojen sağladıkları veya ürettikleri bitkilerle ilişkiler B vitamini12.[13] M. extroquens ayrıca üretir PhyR hangi bitkiler düzenlemek için kullanır stres tepkisi, bitkinin farklı koşullarda hayatta kalmasını sağlar.[14] PhyR'ye ek olarak bakteri, genel bitki ve kök büyümesi ile ilgili bir hormon üretebilir.[15]

M. extroquens sahip olduğu bulundu karşılıklı ilişki çilek ile.[16] Sonuçta, M. extroquens 1,2-propandiolü daha sonra kimyasal reaksiyonlarda kullanılan laktaldehide oksitlemek için kullanılır.[17] Çiçek açan bitkilerle tanıştırılırsa, furaneol üretim artar, çilek tadı değişir.[16]

Referanslar

  1. ^ a b LPSN lpsn.dsmz.de
  2. ^ a b Lidstrom, Mary E .; Chistoserdova, Ludmila (2002-04-01). "Pembedeki Bitkiler: Metilobakteri ile Sitokinin Üretimi". Bakteriyoloji Dergisi. 184 (7): 1818. doi:10.1128 / JB.184.7.1818.2002. ISSN  0021-9193. PMC  134909. PMID  11889085.
  3. ^ Belkhelfa, Sophia; Roche, David; Dubois, Ivan; Berger, Anne; Delmas, Valérie A .; Cattolico, Laurence; Perret, Alain; Labadie, Karine; Perdereau, Aude C .; Darii, Ekaterina; Pateau, Emilie (2019). "Methylobacterium'un Sürekli Kültür Adaptasyonu, AM1 ve TK 0001'i Çok Yüksek Metanol Konsantrasyonlarına zorlar". Mikrobiyolojide Sınırlar. 10: 1313. doi:10.3389 / fmicb.2019.01313. PMC  6595629. PMID  31281294.
  4. ^ Belkhelfa, Sophia; Labadie, Karine; Cruaud, Corinne; Aury, Jean-Marc; Roche, David; Bouzon, Madeleine; Salanoubat, Marcel; Döring, Volker (Şubat 2018). "İstemci Metilotrof Metilobakteriumun Komple Genom Dizisi Polonya'da Topraktan İzole TK 0001'i extorquens". Genom Duyuruları. 6 (8). doi:10.1128 / genomA.00018-18. PMC  5824006. PMID  29472323.
  5. ^ Dourado, Manuella Nóbrega; Aparecida Camargo Neves, Aline; Santos, Daiene Souza; Araújo, Welington Luiz (2015). "Endofitik Pembe Pigmentli Metilotrofik Methylobacterium spp'nin Biyoteknolojik ve Agronomik Potansiyeli". BioMed Research International. 2015: 909016. doi:10.1155/2015/909016. ISSN  2314-6133. PMC  4377440. PMID  25861650.
  6. ^ Dourado, Manuella Nóbrega; Aparecida Camargo Neves, Aline; Santos, Daiene Souza; Araújo, Welington Luiz (2015). "Endofitik Pembe Pigmentli Metilotrofik Methylobacterium spp'nin Biyoteknolojik ve Agronomik Potansiyeli". BioMed Research International. 2015: 909016. doi:10.1155/2015/909016. ISSN  2314-6133. PMC  4377440. PMID  25861650.
  7. ^ a b c Vuilleumier, Stéphane; Chistoserdova, Ludmila; Lee, Ming-Chun; Bringel, Françoise; Lajus, Aurélie; Zhou, Yang; Gourion, Benjamin; Barbe, Valérie; Chang, Jean; Cruveiller, Stéphane; Dossat, Carole (2009-05-18). "Methylobacterium Genom Dizileri: Doğal ve Endüstriyel Kaynaklardan C1 Bileşiklerinin Mikrobiyal Metabolizmasını Araştırmak İçin Bir Referans Şablon". PLOS ONE. 4 (5): e5584. Bibcode:2009PLoSO ... 4,5584V. doi:10.1371 / journal.pone.0005584. ISSN  1932-6203. PMC  2680597. PMID  19440302.
  8. ^ "MX1 Geni - GeneCard'lar | MX1 Proteini | MX1 Antikoru". www.genecards.org. Alındı 2020-11-02.
  9. ^ Dourado, Manuella Nóbrega; Aparecida Camargo Neves, Aline; Santos, Daiene Souza; Araújo, Welington Luiz (2015). "Endofitik Pembe Pigmentli Metilotrofik Methylobacterium spp'nin Biyoteknolojik ve Agronomik Potansiyeli". BioMed Research International. 2015: 909016. doi:10.1155/2015/909016. ISSN  2314-6133. PMC  4377440. PMID  25861650.
  10. ^ Nemecek-Marshall, M .; MacDonald, R. C .; Franzen, J. J .; Wojciechowski, C. L .; Güz, R. (1995-08-01). "Yapraklardan Metanol Emisyonu (Gaz-Fazlı Metanolün Enzimatik Tespiti ve Metanol Akılarının Stomatal İletkenlik ve Yaprak Gelişimi ile İlişkisi)". Bitki Fizyolojisi. 108 (4): 1359–1368. doi:10.1104 / s.108.4.1359. ISSN  0032-0889. PMC  157513. PMID  12228547.
  11. ^ Sy, Abdoulaye; Timmers, Antonius C. J .; Knief, Claudia; Vorholt, Julia A. (2005-11-01). "Metilotrofik Metabolizma, Rekabetçi Koşullar Altında Medicago truncatula kolonizasyonu sırasında Methylobacterium extorquens için Avantajlıdır". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 71 (11): 7245–7252. doi:10.1128 / AEM.71.11.7245-7252.2005. ISSN  0099-2240. PMC  1287603. PMID  16269765.
  12. ^ Sy, Abdoulaye; Timmers, Antonius C. J .; Knief, Claudia; Vorholt, Julia A. (Kasım 2005). "Metilotrofik Metabolizma, Rekabetçi Koşullar Altında Medicago truncatula kolonizasyonu sırasında Methylobacterium extorquens için Avantajlı. Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 71 (11): 7245. doi:10.1128 / AEM.71.11.7245-7252.2005. ISSN  7245-7252. PMC  1287603. PMID  16269765.
  13. ^ Sy, Abdoulaye; Timmers, Antonius C. J .; Knief, Claudia; Vorholt, Julia A. (Kasım 2005). "Metilotrofik Metabolizma, Rekabetçi Koşullar Altında Medicago truncatula kolonizasyonu sırasında Methylobacterium extorquens için Avantajlıdır". Uygulamalı ve Çevresel Mikrobiyoloji. 71 (11): 7245. doi:10.1128 / AEM.71.11.7245-7252.2005. ISSN  7245-7252. PMC  1287603. PMID  16269765.
  14. ^ Gourion, Benjamin; Francez-Charlot, Anne; Vorholt Julia A. (2008-02-01). "PhyR, Methylobacterium'un Genel Stres Tepkisine Dahil Edildi, AM1'i dışlıyor". Bakteriyoloji Dergisi. 190 (3): 1027–1035. doi:10.1128 / JB.01483-07. ISSN  0021-9193. PMC  2223570. PMID  18024517.
  15. ^ Dourado, Manuella Nóbrega; Aparecida Camargo Neves, Aline; Santos, Daiene Souza; Araújo, Welington Luiz (2015). "Endofitik Pembe Pigmentli Metilotrofik Methylobacterium spp'nin Biyoteknolojik ve Agronomik Potansiyeli". BioMed Research International. 2015: 909016. doi:10.1155/2015/909016. ISSN  2314-6133. PMC  4377440. PMID  25861650.
  16. ^ a b Siegmund, Barbara; Leitner, Erich (2014-01-01), Ferreira, Vicente; Lopez, Ricardo (editörler), "Bölüm 26 - Metilobakteri Uygulamasının GC-MS ve Kapsamlı GC × GC-qMS Tarafından Araştırılan Çilek Aroması Üzerindeki Etkisi", Lezzet Bilimi, San Diego: Academic Press, s. 141–145, ISBN  978-0-12-398549-1, alındı 2020-09-21
  17. ^ Nasopoulou, Constantina; Pohjanen, Johanna; Koskimäki, Janne J .; Zabetakis, Ioannis; Pirttilä, Anna Maria (2014-08-15). "Çilek (Fragaria x ananassa) ve Methylobacterium'un lokalizasyonu, in situ hibridizasyon ile çilek dokusundaki çilek aroması biyosentezinin genlerini yok eder". Bitki Fizyolojisi Dergisi. 171 (13): 1099–1105. doi:10.1016 / j.jplph.2014.03.018. ISSN  1618-1328. PMID  24973582.

Dış bağlantılar