NACA (gen) - NACA (gene)

NACA
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3LKX, 3MCB, 3MCE
Tanımlayıcılar
Takma adlar	NACA, NACA1, skNAC, HSD48, NAC-alfa, yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks alfa alt birimi, yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks alt birim alfa
Harici kimlikler	OMIM: 601234 MGI: 106095 HomoloGene: 136025 GeneCard'lar: NACA
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 12 (insan)
Son	56,731,628 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 10 (fare)
Son	128,048,637 bp
RNA ifadesi Desen
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• DNA bağlanması; • GO: 0001105 transkripsiyon koaktivatör aktivitesi; • GO: 0001948 protein bağlama;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • hücre çekirdeği; • yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks; • hücre dışı eksozom;
Biyolojik süreç	• transkripsiyon, DNA şablonlu; • transkripsiyonun düzenlenmesi, DNA şablonlu; • protein taşınması; • kalp gelişiminde rol alan RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi; • iskelet kası lifi gelişiminin düzenlenmesi; • kardiyak ventrikül gelişimi; • kalp trabekül morfogenezi; • kalp morfogenezinde yer alan hücre proliferasyonunun pozitif düzenlenmesi; • GO: 0022415 viral süreç; • iskelet kası dokusu yenilenmesi; • kalp gelişiminde rol oynayan RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun negatif düzenlenmesi; • protein biyosentezi; • iskelet kası büyümesinin pozitif düzenlenmesi; • çizgili kas hücresi apoptotik sürecinin negatif düzenlenmesi; • Ulaşım;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	4666
	17938
	ENSG00000196531
	ENSMUSG00000061315
	Q13765
	P70670; Q60817
NM_001113201; NM_001113202; NM_001113203; NM_005594; NM_001320193;
	NM_001320194; NM_001365896
	NM_001113199; NM_001282976; NM_013608
NP_001106672; NP_001106673; NP_001106674; NP_001307122; NP_001307123;
	NP_005585; NP_001106672; NP_001106673; NP_001106674; NP_001307122; NP_001307123; NP_005585
	NP_001106670; NP_001269905; NP_038636; NP_001269905.1; NP_038636.2
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks alfa polipeptit, Ayrıca şöyle bilinir NACA, bir protein insanlarda kodlanan NACA gen.^[5]^[6]^[7]

Fonksiyon

NACA, kısa süre önce sentezlenen (yani yeni oluşan) önler ribozom ile uygun olmayan etkileşimlerden kaynaklanan ilişkili polipeptitler sitozolik proteinler. NACA, ribozomlardan çıkan yeni oluşan polipeptit alanlarını, bir sinyal peptidi tamamen açıkta. NACA'nın yeni oluşan polipeptidler taşıyan ribozomlardan tükenmesi, sinyal tanıma parçacığı (SRP) sinyal peptitleri içerip içermediğine bakılmaksızın polipeptitlere çapraz bağlanır. NACA yokluğunda, sinyal peptidlerinden yoksun proteinler yanlış olabilir.yeri değiştirilmiş içine endoplazmik retikulum.^[6]^[8]

NACA proteini, kemikte ifade edilir. gelişme ve bir transkripsiyon görevi görür ortak aktifleştirici asidik aktivatörlerle birlikte.^[7]

Etkileşimler

NACA'nın gösterdiği etkileşim ile BTF3, FADD,^[9] C-haz,^[10] ve 3 üye taksilin aile.^[11]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000196531 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000061315 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Entrez Geni: NACA yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks alfa polipeptidi".
^ ^a ^b Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (Ağustos 1994). "Sinyal dizisine özgü sıralama ve yer değiştirme için gereken bir protein kompleksi". Doğa. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994Natur.370..434W. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.
^ ^a ^b Yotov WV, St-Arnaud R (Şubat 1996). "Alfa-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) transkripsiyonel koaktivatör için insan geninin Kromozom 12q23-24.1'e eşlenmesi". Anne. Genetik şifre. 7 (2): 163–4. doi:10.1007 / BF03035343. PMID 8835540. S2CID 33088429. Arşivlenen orijinal 2000-09-16'da.
^ Rospert S, Dubaquié Y, Gautschi M (Ekim 2002). "Yeni oluşan polipeptitle ilişkili kompleks". Hücre. Mol. Hayat Bilimi. 59 (10): 1632–9. doi:10.1007 / PL00012490. PMID 12475173. S2CID 8874233.^{[kalıcı ölü bağlantı ]}
^ Stilo R, Liguoro D, di Jeso B, Leonardi A, Vito P (Nisan 2003). "Yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleksin alfa zinciri, FADD fonksiyonuna bağlanır ve bunu düzenler". Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1034–41. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID 12684039.
^ Moreau A, Yotov WV, Glorieux FH, St-Arnaud R (Mart 1998). "Yeni oluşan polipeptitle ilişkili kompleksin alfa zincirinin kemiğe özgü ifadesi, c-Jun aracılı transkripsiyonu güçlendiren bir ortak etkinleştirici". Mol. Hücre. Biol. 18 (3): 1312–21. doi:10.1128 / MCB.18.3.1312. PMC 108844. PMID 9488446.
^ Yoshida K, Nogami S, Satoh S, Tanaka-Nakadate S, Hiraishi H, Terano A, Shirataki H (Mayıs 2005). "Taksilin ailesinin, transkripsiyonel ve translasyonel süreçlerde yer alan yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks ile etkileşimi". Gen Hücreleri. 10 (5): 465–76. doi:10.1111 / j.1365-2443.2005.00848.x. PMID 15836775. S2CID 19426810.

daha fazla okuma

Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (1994). "Sinyal dizisine özgü sıralama ve yer değiştirme için gereken bir protein kompleksi". Doğa. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994Natur.370..434W. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo kapaklama: ökaryotik mRNA'ların kapak yapısını oligoribonükleotidlerle değiştirmek için basit bir yöntem". Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Yotov WV, St-Arnaud R (1996). "Alfa-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) transkripsiyonel koaktivatör için insan geninin Kromozom 12q23-24.1'e eşlenmesi". Anne. Genetik şifre. 7 (2): 163–4. doi:10.1007 / BF03035343. PMID 8835540. S2CID 33088429.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, vd. (1997). "Tam uzunlukta zenginleştirilmiş ve 5'-uçta zenginleştirilmiş bir cDNA kitaplığının yapımı ve karakterizasyonu". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Yotov WV, Moreau A, St-Arnaud R (1998). "Yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleksin alfa zinciri, bir transkripsiyonel koaktivatör olarak işlev görür". Mol. Hücre. Biol. 18 (3): 1303–11. doi:10.1128 / MCB.18.3.1303. PMC 108843. PMID 9488445.
Moreau A, Yotov WV, Glorieux FH, St-Arnaud R (1998). "Yeni oluşan polipeptitle ilişkili kompleksin alfa zincirinin kemiğe özgü ifadesi, c-Jun aracılı transkripsiyonu güçlendiren bir ortak etkinleştirici". Mol. Hücre. Biol. 18 (3): 1312–21. doi:10.1128 / MCB.18.3.1312. PMC 108844. PMID 9488446.
Munz B, Wiedmann M, Lochmüller H, Werner S (1999). "Yaralanma ile düzenlenmiş yeni genlerin klonlanması. Kas onarımında kasa özgü protein skNAC'ın önemli rolü için çıkarımlar". J. Biol. Kimya. 274 (19): 13305–10. doi:10.1074 / jbc.274.19.13305. PMID 10224091.
Beatrix B, Sakai H, Wiedmann M (2001). "Yeni oluşan polipeptitle ilişkili kompleksin alfa ve beta alt birimi farklı işlevlere sahiptir". J. Biol. Kimya. 275 (48): 37838–45. doi:10.1074 / jbc.M006368200. PMID 10982809.
Zhang QH, Ye M, Wu XY ve diğerleri. (2001). "CD34 + hematopoietik kök / progenitör hücrelerde ifade edilen önceden tanımlanmamış 300 gen için açık okuma çerçeveleriyle cDNA'ların klonlanması ve fonksiyonel analizi". Genom Res. 10 (10): 1546–60. doi:10.1101 / gr.140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Sims RJ, Weihe EK, Zhu L ve diğerleri. (2002). "Kardiyojenez için gerekli bir baskılayıcı protein olan m-Bop, kalbe ve kaslara özgü bir transkripsiyon faktörü olan skNAC ile etkileşime girer". J. Biol. Kimya. 277 (29): 26524–9. doi:10.1074 / jbc.M204121200. PMID 12011100.
Kim SH, Shim KS, Lubec G (2002). "İnsan beyni yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks alfa alt birimi, Alzheimer hastalığı ve Down sendromlu hastalarda azalmıştır". J. Investig. Orta. 50 (4): 293–301. doi:10.2310/6650.2002.33287. PMID 12109594.
Behrends U, Jandl T, Golbeck A, vd. (2002). "Bir pediyatrik nöroblastoma kütüphanesinin otolog antikor taramasıyla tanımlanan HUD, HUC, NNP-1 ve alfa-internexin genlerinin yeni ürünleri". Int. J. Kanser. 100 (6): 669–77. doi:10.1002 / ijc.10550. PMID 12209604. S2CID 35369661.
Mossabeb R, Seiberler S, Mittermann I, vd. (2002). "Alfa-yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleksin yeni bir izoformunun IgE tanımlı otoantijen olarak karakterizasyonu". J. Invest. Dermatol. 119 (4): 820–9. doi:10.1046 / j.1523-1747.2002.00518.x. PMID 12406326.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, vd. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin üretimi ve ilk analizi". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Stilo R, Liguoro D, di Jeso B, vd. (2003). "Yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleksin alfa zinciri, FADD fonksiyonuna bağlanır ve bunu düzenler". Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1034–41. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID 12684039.
Papachristou DJ, Batistatou A, Sykiotis GP, ve diğerleri. (2003). "JNK-AP-1 sinyal iletim yolunun aktivasyonu, insan osteosarkomlarının patogenezi ve ilerlemesi ile ilişkilidir". Kemik. 32 (4): 364–71. doi:10.1016 / S8756-3282 (03) 00026-7. PMID 12689679.
Hämmerle K, Shayan P, Niemeyer CM, Flotho C (2003). "SMART polimeraz zincir reaksiyonu ve" sanal Kuzey "hibridizasyonu kullanılarak juvenil miyelomonositik lösemide alfa-NAC ve ANX2'nin ekspresyon analizi. Cancer Genet. Cytogenet. 142 (2): 149–52. doi:10.1016 / S0165-4608 (02) 00841-5. PMID 12699894.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, vd. (2004). "21.243 tam uzunlukta insan cDNA'sının eksiksiz dizilemesi ve karakterizasyonu". Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Al-Shanti N, Steward CG, Garland RJ, Rowbottom AW (2004). "Bir insan CD8 (+) T hücresinde ex vivo genişleme modelinde antisens oligonükleotidler kullanılarak alfa yeni polipeptit ile ilişkili kompleks fonksiyonların araştırılması". İmmünoloji. 112 (3): 397–403. doi:10.1111 / j.1365-2567.2004.01893.x. PMC 1782496. PMID 15196207.
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, ve diğerleri. (2005). "Gelişmekte olan fare beyninin fosfoproteomik analizi". Mol. Hücre. Proteomik. 3 (11): 1093–101. doi:10.1074 / mcp.M400085-MCP200. PMID 15345747.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 12 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000196531 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000061315 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-5] "Entrez Geni: NACA yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks alfa polipeptidi".

[pmid8047162-6] Wiedmann B, Sakai H, Davis TA, Wiedmann M (Ağustos 1994). "Sinyal dizisine özgü sıralama ve yer değiştirme için gereken bir protein kompleksi". Doğa. 370 (6489): 434–40. Bibcode:1994Natur.370..434W. doi:10.1038 / 370434a0. PMID 8047162. S2CID 4353902.

[pmid8835540-7] Yotov WV, St-Arnaud R (Şubat 1996). "Alfa-NAC / 1.9.2 (NACA / 1.9.2) transkripsiyonel koaktivatör için insan geninin Kromozom 12q23-24.1'e eşlenmesi". Anne. Genetik şifre. 7 (2): 163–4. doi:10.1007 / BF03035343. PMID 8835540. S2CID 33088429. Arşivlenen orijinal 2000-09-16'da.

[pmid12475173-8] Rospert S, Dubaquié Y, Gautschi M (Ekim 2002). "Yeni oluşan polipeptitle ilişkili kompleks". Hücre. Mol. Hayat Bilimi. 59 (10): 1632–9. doi:10.1007 / PL00012490. PMID 12475173. S2CID 8874233.^{[kalıcı ölü bağlantı ]}

[pmid12684039-9] Stilo R, Liguoro D, di Jeso B, Leonardi A, Vito P (Nisan 2003). "Yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleksin alfa zinciri, FADD fonksiyonuna bağlanır ve bunu düzenler". Biochem. Biophys. Res. Commun. 303 (4): 1034–41. doi:10.1016 / S0006-291X (03) 00487-X. PMID 12684039.

[pmid9488446-10] Moreau A, Yotov WV, Glorieux FH, St-Arnaud R (Mart 1998). "Yeni oluşan polipeptitle ilişkili kompleksin alfa zincirinin kemiğe özgü ifadesi, c-Jun aracılı transkripsiyonu güçlendiren bir ortak etkinleştirici". Mol. Hücre. Biol. 18 (3): 1312–21. doi:10.1128 / MCB.18.3.1312. PMC 108844. PMID 9488446.

[pmid15836775-11] Yoshida K, Nogami S, Satoh S, Tanaka-Nakadate S, Hiraishi H, Terano A, Shirataki H (Mayıs 2005). "Taksilin ailesinin, transkripsiyonel ve translasyonel süreçlerde yer alan yeni oluşan polipeptit ile ilişkili kompleks ile etkileşimi". Gen Hücreleri. 10 (5): 465–76. doi:10.1111 / j.1365-2443.2005.00848.x. PMID 15836775. S2CID 19426810.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]