NDUFA4 - NDUFA4 - Wikipedia

NDUFA4
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarNDUFA4, CI-9k, CI-MLRQ, MLRQ, mitokondriyal kompleks ilişkili, COXFA4, NDUFA4 mitokondriyal kompleks ilişkili
Harici kimliklerOMIM: 603833 MGI: 107686 HomoloGene: 37629 GeneCard'lar: NDUFA4
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 7 (insan)
Chr.Kromozom 7 (insan)[1]
Kromozom 7 (insan)
NDUFA4 için genomik konum
NDUFA4 için genomik konum
Grup7p21.3Başlat10,931,943 bp[1]
Son10,940,153 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002489

NM_010886

RefSeq (protein)

NP_002480

NP_035016

Konum (UCSC)Tarih 7: 10.93 - 10.94 Mbyok
PubMed arama[2][3]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

NDUFA4, mitokondriyal kompleks ilişkili bir protein insanlarda kodlanır NDUFA4 gen.[4] NDUFA3 ​​proteini, bir alt birimdir NADH dehidrojenaz (ubiquinone) içinde bulunan mitokondriyal iç zar ve beş kompleksin en büyüğüdür elektron taşıma zinciri.[5] NDUFA4 genindeki mutasyonlar, Leigh sendromu.[4]

Yapısı

NDUFA4 geni şunun p kolunda bulunur. kromozom 7 21.3 konumunda, toplam 8.234 baz çifti uzunluğunda.[4] NDUFA4 geni, 81'den oluşan 9.4 kDa protein üretir. amino asitler.[6][7]

NDUFA4 geleneksel olarak enzimin bir alt birimi olarak tanımlanmıştır NADH dehidrojenaz (ubiquinone) (Kompleks I), solunum komplekslerinin en büyüğü. Yapısı Karmaşık I L şeklindedir ve uzun, hidrofobik zar ötesi alan ve bir hidrofilik bilinen tüm redoks merkezlerini ve NADH bağlanma bölgesini içeren çevresel kol için alan.[5] Not edilmiştir ki N terminali hidrofobik alan bir katlanma potansiyeline sahiptir. alfa sarmalı içini kapsayan mitokondri zar Birlikte C terminali Hidrofilik alan, Kompleks I'in küresel alt birimleri ile etkileşime girer. korunmuş iki alanlı yapı, bu özelliğin protein işlevi için kritik olduğunu ve hidrofobik alanın NADH için bir çapa görevi gördüğünü öne sürmektedir: ubikinon oksidoredüktaz iç mitokondriyal membranda kompleks.[4]

Daha yeni araştırmalar göstermiştir ki hiçbir tedirginlik Karmaşık I NDUFA4'ün silinmesi üzerine meydana gelir ve bu kompleksteki rolü sorgulanır. NDUFA4'ün bir rol oynadığı kanıtlanmıştır. Karmaşık IV işlev ve biyogenez, ancak bazı yazarlar NDUFA4 geninin yeniden adlandırılmasını ve her ikisinin yapısının Karmaşık I ve Karmaşık IV yeniden değerlendirilecek.[8]

Fonksiyon

İnsan NDUFA1 geni bir alt birimini kodlar Karmaşık I of Solunum zinciri elektronları aktaran NADH -e ubikinon. Mitokondriyal solunum zincirinin Memeli kompleksi I 45 farklı alt birimden oluşur; bu gen tarafından kodlanan protein kompleks I 9kDa alt birim ailesine aittir ve NADH dehidrojenaz aktivitesine ve oksidoredüktaz aktivitesine sahiptir. Elektronları NADH'den solunum zincirine aktarır.[4] Başlangıçta, NADH Kompleks I'e bağlanır ve iki elektronu izoalloksazin halkası of flavin mononükleotid FMNH'yi oluşturmak için (FMN) protez kol2. Elektronlar bir dizi demir-kükürt (Fe-S) kümeleri protez kolda ve son olarak koenzim Q10'a (CoQ) indirgenir. ubiquinol (CoQH2). Elektron akışı, proteinin redoks durumunu değiştirerek konformasyonel bir değişiklik ve pK mitokondriyal matristen dört hidrojen iyonu pompalayan iyonize edilebilir yan zincirin kayması.[5]

Klinik önemi

NDUFA4 genindeki mutasyonlar, Leigh sendromu, tipik olarak yaşamın ilk yılında ortaya çıkan ciddi bir nörolojik bozukluk. Kesinti Karmaşık IV sitokrom c oksidaz veya COX olarak da adlandırılan, Leigh sendromunun en yaygın nedenidir. NDUFA4'ün ancak yakın zamanda bir alt birim olarak tanımlandığı göz önüne alındığında Karmaşık IV ziyade Karmaşık I Daha önce açıklanamayan COX eksiklikleri olan hastalar, genetik olarak NDUFA4 mutasyonları için test edilebilir.[4][9][10]

Etkileşimler

NDUFA4, ubikitin proteinleri de dahil olmak üzere birçok protein-protein etkileşimine sahiptir. ubikitin C ve UBL4A, Hem de CUL3 ve PARK7.[4]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000189043 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  3. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ a b c d e f g "Entrez Geni: NDUFA4, mitokondriyal kompleks ilişkili". Alındı 2015-03-24.
  5. ^ a b c Pratt, Donald Voet, Judith G. Voet, Charlotte W. (2013). "18". Biyokimyanın temelleri: moleküler düzeyde yaşam (4. baskı). Hoboken, NJ: Wiley. s. 581–620. ISBN  9780470547847.
  6. ^ Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (Ekim 2013). "Kardiyak proteom biyolojisi ve tıbbın uzmanlaşmış bir bilgi bankası tarafından entegrasyonu". Dolaşım Araştırması. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. PMC  4076475. PMID  23965338.
  7. ^ "NADH dehidrojenaz [ubikinon] 1 alfa alt kompleks alt birimi 4". Kardiyak Organellar Protein Atlas Bilgi Bankası (COPaKB).
  8. ^ Balsa E, Marco R, Perales-Clemente E, Szklarczyk R, Calvo E, Landázuri MO, Enríquez JA (Eyl 2012). "NDUFA4, memeli elektron taşıma zincirinin kompleks IV'ün bir alt birimidir". Hücre Metabolizması. 16 (3): 378–386. doi:10.1016 / j.cmet.2012.07.015. PMID  22902835.
  9. ^ "Leigh sendromu". Genetik Ana Referans. ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi. Alındı 30 Mart 2015.
  10. ^ Pitceathly RD, Rahman S, Wedatilake Y, Polke JM, Cirak S, Foley AR, Sailer A, Hurles ME, Stalker J, Hargreaves I, Woodward CE, Sweeney MG, Muntoni F, Houlden H, Taanman JW, Hanna MG (Haziran 2013 ). "NDUFA4 mutasyonları, insan nörolojik hastalığına bağlı bir sitokrom c oksidaz alt biriminin işlev bozukluğunun altında yatar". Hücre Raporları. 3 (6): 1795–805. doi:10.1016 / j.celrep.2013.05.005. PMC  3701321. PMID  23746447.

daha fazla okuma

Bu makale, Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi içinde olan kamu malı.