Nükleolin - Nucleolin

NCL
Protein NCL PDB 2fc8.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarNCL, C23, nükleolin, Nsr1
Harici kimliklerOMIM: 164035 MGI: 97286 HomoloGene: 136488 GeneCard'lar: NCL
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 2 (insan)
Chr.Kromozom 2 (insan)[1]
Kromozom 2 (insan)
Genomic location for NCL
Genomic location for NCL
Grup2q37.1Başlat231,453,531 bp[1]
Son231,483,641 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE NCL 200610 s at fs.png
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez

4691

17975

Topluluk

ENSG00000115053

ENSMUSG00000026234

UniProt

P19338

P09405

RefSeq (mRNA)

NM_005381

NM_010880

RefSeq (protein)

NP_005372

NP_035010

Konum (UCSC)Chr 2: 231.45 - 231.48 MbChr 1: 86.34 - 86.36 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Nükleolin bir protein insanlarda kodlanır NCL gen.[5][6]

Gen

İnsan NCL geni, kromozom 2 ve 14'ten oluşur Eksonlar 13 ile intronlar ve yaklaşık 11 kb genişliğindedir. NCL geninin intron 11'i bir küçük nükleolar RNA, U20 olarak adlandırılır.[7]

Fonksiyon

Nükleolin, büyüyen ökaryotik hücrelerin ana nükleolar proteinidir. İntranükleolar kromatin ve pre-ribozomal partiküller ile ilişkili bulunmuştur. Histon H1'e bağlanarak kromatin dekondensasyonunu indükler. Pre-rRNA transkripsiyonunda ve ribozom birleşmesinde rol oynadığı düşünülmektedir. Transkripsiyonel uzama sürecinde rol oynayabilir. RNA oligonükleotitlerini 5'-UUAGGG-3 'tekrarları ile telomerik tek sarmallı DNA 5'-TTAGGG-3' tekrarlarından daha sıkı bir şekilde bağlar.

Nükleolin ayrıca Tavuk Ovalbümin Yukarı Akım Destekleyici Transkripsiyon Faktörü II ile bir transkripsiyonel koaktivatör olarak hareket edebilir (KUPA-TFII ).[8]

Klinik önemi

Midkine ve pleiotropin düşük afiniteli bir reseptör olarak hücre yüzeyi nükleolinine bağlanır. Bu bağlanma, HIV enfeksiyonunu engelleyebilir.[9][10]

Hücre yüzeyindeki nükleolin, hücrenin Solunum sinsityal virüsü (RSV) füzyon proteini.[11] Nükleolin - RSV füzyon proteini etkileşimine müdahalenin, hücre kültürlerinde ve hayvan modellerinde RSV enfeksiyonuna karşı terapötik olduğu gösterilmiştir.[12][13][14][15]

Etkileşimler

Nükleolinin gösterdiği etkileşim ile:

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000115053 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000026234 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Srivastava M, McBride OW, Fleming PJ, Pollard HB, Burns AL (Eylül 1990). "İnsan nükleolin geninin genomik organizasyonu ve kromozomal lokalizasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 265 (25): 14922–31. PMID  2394707.
  6. ^ Erard MS, Belenguer P, Caizergues-Ferrer M, Pantaloni A, Amalric F (Ağustos 1988). "Bir ana nükleolar protein olan nükleolin, histon H1'e bağlanarak kromatin dekondensasyonunu indükler". Avrupa Biyokimya Dergisi / FEBS. 175 (3): 525–30. doi:10.1111 / j.1432-1033.1988.tb14224.x. PMID  3409881.
  7. ^ "Entrez Geni: NCL nükleolin".
  8. ^ Litchfield LM, Riggs KA, Hockenberry AM, Oliver LD, Barnhart KG, Cai J, Pierce WM, Ivanova MM, Bates PJ, Appana SN, Datta S, Kulesza P, McBryan J, Young LS, Klinge CM (Mayıs 2012). "Meme kanseri hücrelerinde retinoik asit reseptörü β transkripsiyonunun bir COUP-TFII koaktivatörü olarak nükleolinin tanımlanması ve karakterizasyonu". PLOS ONE. 7 (5): e38278. Bibcode:2012PLoSO ... 738278L. doi:10.1371 / journal.pone.0038278. PMC  3365040. PMID  22693611.
  9. ^ EA, Krust B, Nisole S, Svab J, Briand JP, Hovanessian AG (Ekim 2002) dedi. "Anti-HIV sitokin midkine, hücre yüzeyinde eksprese edilen nükleolini düşük afiniteli bir reseptör olarak bağlar". Biyolojik Kimya Dergisi. 277 (40): 37492–502. doi:10.1074 / jbc.M201194200. PMID  12147681. S2CID  41621217.
  10. ^ EA, Courty J, Svab J, Delbé J, Krust B, Hovanessian AG (Eylül 2005) dedi. "Pleiotropin, hücre yüzeyinde ifade edilen nükleolini bağlayarak HIV enfeksiyonunu inhibe eder". FEBS Dergisi. 272 (18): 4646–59. doi:10.1111 / j.1742-4658.2005.04870.x. PMID  16156786. S2CID  21153881.
  11. ^ Tayyari F, Marchant D, Moraes TJ, Duan W, Mastrangelo P, Hegele RG (Eylül 2011). "İnsan solunum sinsitiyal virüsü için bir hücresel reseptör olarak nükleolinin tanımlanması". Doğa Tıbbı. 17 (9): 1132–5. doi:10.1038 / nm.2444. PMID  21841784. S2CID  205388029.
  12. ^ Bilawchuk LM, Griffiths CD, Jensen LD, Elawar F, Marchant DJ (Ağu 2017). "Solunum Sinsitiyal Virüsünün Nükleolin Reseptör Bloke Etmesine ve Antikor Nötrleşmesine Duyarlılıkları Virüs Saflaştırma Yöntemine Bağlıdır". Virüsler. 9 (8): 207. doi:10.3390 / v9080207. PMC  5580464. PMID  28771197.
  13. ^ Mastrangelo P, Hegele RG (Kasım 2012). "RSV füzyon reseptörü: herkesin beklediği gibi değil". Mikroplar ve Enfeksiyon / Institut Pasteur. 14 (13): 1205–10. doi:10.1016 / j.micinf.2012.07.015. PMID  22884716.
  14. ^ Mastrangelo P, Hegele RG (Mart 2013). "RSV füzyonu: yeni bir model için zaman". Virüsler. 5 (3): 873–85. doi:10.3390 / v5030873. PMC  3705301. PMID  23518574.
  15. ^ Shakeri A, Mastrangelo P, Griffin JK, Moraes TJ, Hegele RG (Kasım 2014). "Farede ve viral tropizmde solunum sinsityal virüs reseptörü ekspresyonu". Histoloji ve Histopatoloji. 30 (30): 401–411. doi:10.14670 / HH-30.401. PMID  25374027.
  16. ^ Li D, Dobrowolska G, Krebs EG (Haziran 1996). "Kazein kinaz 2'nin nükleolin ile fiziksel ilişkisi". Biyolojik Kimya Dergisi. 271 (26): 15662–8. doi:10.1074 / jbc.271.26.15662. PMID  8663258. S2CID  10750338.
  17. ^ Dubois T, Zemlickova E, Howell S, Aitken A (Şubat 2003). "Centaurin-alfa 1, in vitro ve in vivo nükleolin ile birleşir". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 301 (2): 502–8. doi:10.1016 / s0006-291x (02) 03010-3. PMID  12565890.
  18. ^ Tominaga K, Srikantan S, Lee EK, Subaran SS, Martindale JL, Abdelmohsen K, Gorospe M (Ekim 2011). "HuR ve miR-494 tarafından nükleolin ekspresyonunun rekabetçi düzenlemesi". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 31 (20): 4219–31. doi:10.1128 / MCB.05955-11. PMC  3187287. PMID  21859890.
  19. ^ Li YP, Busch RK, Valdez BC, Busch H (Nisan 1996). "C23, varsayılan bir nükleolar lokalizasyon-sinyal bağlama proteini olan B23 ile etkileşime girer". Avrupa Biyokimya Dergisi / FEBS. 237 (1): 153–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0153n.x. PMID  8620867.
  20. ^ Daniely Y, Dimitrova DD, Borowiec JA (Ağu 2002). "P53-nükleolin kompleksi oluşumunun aracılık ettiği strese bağlı nükleolin mobilizasyonu". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 22 (16): 6014–22. doi:10.1128 / mcb.22.16.6014-6022.2002. PMC  133981. PMID  12138209.
  21. ^ Morimoto H, Okamura H, Haneji T (Eylül 2002). "İnsan osteoblastik hücrelerinde protein fosfataz 1 deltanın nükleolin ile etkileşimi". Histokimya ve Sitokimya Dergisi. 50 (9): 1187–93. doi:10.1177/002215540205000905. PMID  12185196. S2CID  24950287.
  22. ^ Sakaguchi M, Miyazaki M, Takaishi M, Sakaguchi Y, Makino E, Kataoka N, Yamada H, Namba M, Huh NH (Kasım 2003). "S100C / A11, insan epidermal keratinositlerinin Ca (2 +) ile indüklenen büyüme inhibisyonunun önemli bir aracısıdır". Hücre Biyolojisi Dergisi. 163 (4): 825–35. doi:10.1083 / jcb.200304017. PMC  2173690. PMID  14623863.
  23. ^ Fouraux MA, Bouvet P, Verkaart S, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (Temmuz 2002). "Nükleolin, insan Ro ribonükleoprotein komplekslerinin bir alt kümesi ile birleşir". Moleküler Biyoloji Dergisi. 320 (3): 475–88. doi:10.1016 / s0022-2836 (02) 00518-1. PMID  12096904.
  24. ^ Haluska P, Saleem A, Edwards TK, Rubin EH (Nisan 1998). "İnsan topoizomeraz I'in N-terminali ile SV40 büyük T antijeni arasındaki etkileşim". Nükleik Asit Araştırması. 26 (7): 1841–7. doi:10.1093 / nar / 26.7.1841. PMC  147454. PMID  9512561.
  25. ^ Bharti AK, Olson MO, Kufe DW, Rubin EH (Ocak 1996). "İnsan topoizomeraz I'de bir nükleolin bağlanma bölgesinin belirlenmesi". Biyolojik Kimya Dergisi. 271 (4): 1993–7. doi:10.1074 / jbc.271.4.1993. PMID  8567649. S2CID  25059254.
  26. ^ Khurts S, Masutomi K, Delgermaa L, Arai K, Oishi N, Mizuno H, Hayashi N, Hahn WC, Murakami S (Aralık 2004). "Nükleolin, telomeraz ile etkileşime girer". Biyolojik Kimya Dergisi. 279 (49): 51508–15. doi:10.1074 / jbc.M407643200. PMID  15371412. S2CID  41394148.

daha fazla okuma