PABPC1 - PABPC1 - Wikipedia

PABPC1
Protein PABPC1 PDB 1cvj.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarPABPC1, PAB1, PABP, PABP1, PABPC2, PABPL1, poli (A) bağlayıcı protein sitoplazmik 1
Harici kimliklerOMIM: 604679 MGI: 1349722 HomoloGene: 37638 GeneCard'lar: PABPC1
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 8 (insan)
Chr.Kromozom 8 (insan)[1]
Kromozom 8 (insan)
PABPC1 için genomik konum
PABPC1 için genomik konum
Grup8q22.3Başlat100,685,816 bp[1]
Son100,722,809 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_002568

NM_008774

RefSeq (protein)

NP_002559

NP_032800

Konum (UCSC)Chr 8: 100.69 - 100.72 MbTarih 15: 36.6 - 36.61 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Poliadenilat bağlayıcı protein 1 bir protein insanlarda PABPC1 gen.[5] PABP1 proteini, mRNA'yı bağlar ve çekirdekten dışarı taşıma, bozunma, translasyon ve stabilite gibi çeşitli işlevleri kolaylaştırır. Biri çekirdekte (PABPN1), diğeri sitoplazmada (PABPC1) bulunan iki ayrı PABP1 proteini vardır. PABP1'in konumu, bu proteinin rolünü ve RNA ile olan işlevini etkiler.[6]

Fonksiyon

Ökaryotik mRNA'nın 3 'poli (A) kuyruğuna komplekslenmiş bulunan poli (A) -bağlayıcı protein (PAB veya PABP), poli (A) kısaltma ve translasyonun başlaması için gereklidir. İnsanlarda, PABP'ler küçük bir nükleer izoform ve diğer bir korunmuş gen ailesinden oluşur. poli (A) -bağlayıcı proteinler. [OMIM tarafından sağlanır][7]

PABPC1 genellikle sitoplazma içinde yayılır ve stres granülleri, işleme gövdeleri ve yüksek translasyonel aktivite yerleri gibi yüksek mRNA konsantrasyonu olan yerlerde yoğunlaşır. PABPC1 aynı zamanda anlamsız aracılı mRNA bozulması (NMD) ile de ilişkilidir. PABPC1, poli (A) kuyruğuna bağlanır ve mRNA'ların daireselleşmesini stabilize eden eIF4G ile etkileşime girer. Bu yapı, NMD yoluyla mRNA bozulmasının önlenmesi için gereklidir.[8]

Çekirdekte PABP1, stabiliteyi, dışa aktarımı, nakliyeyi ve bozunmayı kolaylaştırmak için pre-mRNA'ların poli (A) kuyruklarına bağlanır. PABP1 bağlanması, nükleer aracılı bozunma için de gereklidir. PABPC1, dört RNA tanıma motifi (RRM'ler) içerir. İlk ikisi, RRM1 ve RRM2, hem a-importin hem de işlenmiş mRNA'nın poli (A) kuyruğunu bağlar. Bu özellik, mRNA'nın çekirdeğe geri dönmesini engeller.[6]

Etkileşimler

PABPC1'in gösterdiği etkileşim ile:

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000070756 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000022283 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ Grange T, de Sa CM, Oddos J, Pictet R (Haziran 1987). "İnsan mRNA poliadenilat bağlayıcı protein: bir nükleik asit bağlanma motifinin evrimsel korunması". Nükleik Asit Araştırması. 15 (12): 4771–87. doi:10.1093 / nar / 15.12.4771. PMC  305917. PMID  2885805.
  6. ^ a b Grey NK, Hrabálková L, Scanlon JP, Smith RW (Aralık 2015). "Poli (A) -bağlayıcı proteinler ve mRNA lokalizasyonu: tünekleri kim yönetiyor?". Biyokimya Topluluğu İşlemleri. 43 (6): 1277–84. doi:10.1042 / BST20150171. PMID  26614673.
  7. ^ "Entrez Geni: PABPC1 poli (A) bağlayıcı protein, sitoplazmik 1".
  8. ^ Fatscher T, Boehm V, Weiche B, Gehring NH (Ekim 2014). "Sitoplazmik poli (A) -bağlayıcı proteinin ökaryotik başlatma faktörü 4G ile etkileşimi, saçma sapan mRNA bozunmasını bastırır". RNA. 20 (10): 1579–92. doi:10.1261 / rna.044933.114. PMC  4174440. PMID  25147240.
  9. ^ Koloteva-Levine N, Pinchasi D, Pereman I, Zur A, Brandeis M, Elroy-Stein O (Mayıs 2004). "Anafaz teşvik edici kompleks / siklosomun Apc5 alt birimi, poli (A) bağlayıcı protein ile etkileşime girer ve dahili ribozom giriş bölgesi aracılı çeviriyi baskılar". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 24 (9): 3577–87. doi:10.1128 / mcb.24.9.3577-3587.2004. PMC  387753. PMID  15082755.
  10. ^ Funakoshi Y, Doi Y, Hosoda N, Uchida N, Osawa M, Shimada I, Tsujimoto M, Suzuki T, Katada T, Hoshino S (Aralık 2007). "MRNA deadenilasyon mekanizması: çeviri sonlandırma faktörü eRF3 ve mRNA deadenilazlar arasındaki moleküler etkileşim için kanıt". Genler ve Gelişim. 21 (23): 3135–48. doi:10.1101 / gad.1597707. PMC  2081979. PMID  18056425.
  11. ^ a b Imataka H, ​​Gradi A, Sonenberg N (Aralık 1998). "İnsan eIF4G'nin yeni tanımlanan bir N-terminal amino asit dizisi, poli (A) -bağlayıcı proteini bağlar ve poli (A) -bağımlı çeviride işlev görür". EMBO Dergisi. 17 (24): 7480–9. doi:10.1093 / emboj / 17.24.7480. PMC  1171091. PMID  9857202.
  12. ^ Hoshino S, Imai M, Kobayashi T, Uchida N, Katada T (Haziran 1999). "Çeviri sonlandırma sinyalini mRNA'nın 3'-Poli (A) kuyruğuna taşıyan ökaryotik polipeptit zincir salma faktörü (eRF3 / GSPT). Erf3 / GSPT'nin poliadenilat bağlayıcı protein ile doğrudan ilişkisi". Biyolojik Kimya Dergisi. 274 (24): 16677–80. doi:10.1074 / jbc.274.24.16677. PMID  10358005.
  13. ^ Roy G, De Crescenzo G, Khaleghpour K, Kahvejian A, O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (Haziran 2002). "Paip1, iki bağımsız bağlanma motifi aracılığıyla poli (A) bağlayıcı protein ile etkileşir". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 22 (11): 3769–82. doi:10.1128 / mcb.22.11.3769-3782.2002. PMC  133836. PMID  11997512.
  14. ^ Craig AW, Haghighat A, Yu AT, Sonenberg N (Nisan 1998). "Poliadenilat bağlayıcı proteinin eIF4G homolog PAIP ile etkileşimi translasyonu artırır". Doğa. 392 (6675): 520–3. doi:10.1038/33198. PMID  9548260. S2CID  10891925.
  15. ^ Khaleghpour K, Kahvejian A, De Crescenzo G, Roy G, Svitkin YV, Imataka H, ​​O'Connor-McCourt M, Sonenberg N (Ağustos 2001). "Translasyonel baskılayıcı Paip2'nin poli (A) bağlayıcı protein ile ikili etkileşimleri". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 21 (15): 5200–13. doi:10.1128 / MCB.21.15.5200-5213.2001. PMC  87244. PMID  11438674.

daha fazla okuma