PIN alanı - PIN domain - Wikipedia

PIN alanı
PDB 1o4w EBI.jpg
1.90 Angstrom çözünürlükte Archaeoglobus fulgidus'tan PIN (PilT N-terminal) alanının (AF0591) kristal yapısı. 1o4h
Tanımlayıcılar
SembolTOPLU İĞNE
PfamPF01850
InterProIPR002716
AKILLICBS
SCOP23dbo / Dürbün / SUPFAM
CDDcd09852

Moleküler biyolojide PIN alanı bir protein alanı bu yaklaşık 130 amino asit uzunluğundadır. PIN alanları şu şekilde çalışır: nükleaz parçalanan enzimler tek sarmallı RNA sıraya veya yapıya bağlı bir şekilde.[1][2]

PIN alanları, neredeyse değişmeyen dört asidik kalıntı içerir.[2] Kristal yapılar, bu kalıntıları varsayımsal aktif site. Ökaryotlarda PIN alanları, ilgili proteinlerde bulunur. saçma aracılı mRNA bozunması gibi proteinlerde SMG5 ve SMG6 ve 18S'nin işlenmesinde ribozomal RNA. Prokaryotlarda bulunan PIN alanı proteinlerinin çoğu, toksin-antitoksin operonları.[2] Bu lokuslar, serbest yaşayan prokaryotların beslenme stresi ile başa çıkmasına yardımcı olan bir kontrol mekanizması sağlar.[3]

Referanslar

  1. ^ Arcus VL, McKenzie JL, Robson J, Cook GM (Ocak 2011). "PIN alanı ribonükleazları ve prokaryotik VapBC toksin-antitoksin dizisi". Protein Mühendisliği, Tasarımı ve Seçimi. 24 (1–2): 33–40. doi:10.1093 / protein / gzq081. PMID  21036780.
  2. ^ a b c Matelska D, Steczkiewicz K, Ginalski K (Temmuz 2017). "PIN alanı benzeri üst ailenin kapsamlı sınıflandırması". Nükleik Asit Araştırması. 45 (12): 6995–7020. doi:10.1093 / nar / gkx494. PMC  5499597. PMID  28575517.
  3. ^ Gerdes K, Christensen SK, Løbner-Olesen A (Mayıs 2005). "Prokaryotik toksin-antitoksin stres tepkisi lokusları". Doğa Yorumları. Mikrobiyoloji. 3 (5): 371–82. doi:10.1038 / nrmicro1147. PMID  15864262. S2CID  13417307.