PLAT alanı - PLAT domain

PLAT / LH2 alanı
PDB 1lpa EBI.jpg
Lipaz-procolipase kompleksinin yapısı.[1]
Tanımlayıcılar
SembolPLAT
PfamPF01477
InterProIPR001024
AKILLISM00308
PROSITEPDOC50095
SCOP21 lpa / Dürbün / SUPFAM
OPM üst ailesi221
OPM proteini3swz
CDDcd00113

Moleküler biyolojide PLAT alanı bir protein alanı çeşitli zar veya lipid ilişkili proteinlerde bulunur. PLAT (Polikistin-1, Lipoksijenaz, Alfa Toksin ) alan adı[2] veya LH2 (Lipoksijenaz homolojisi) alanı.[3] Pankreas lipazının bilinen yapısı, bu alanın procolipaza bağlandığını gösterir. Pfam PF01114, zar birleşmesine aracılık eder.

Bu alan, çeşitli zar veya lipid ilişkili proteinlerde bulunur. Oluşturur beta sandviç ikiden oluşur β yaprak dört β-iplikçikleri her biri.[2][4][5]

Bu alanı içeren insan proteinleri

ALOX12; ALOX12B; ALOX12P2; ALOX15; ALOX15B; ALOX5; ALOXE3; LIPC;LIPG; LOXHD1; LPL; PKD1; PKD1L1; PKD1L2; PKD1L3; PKDREJ;PNLIP; PNLIPRP1; PNLIPRP2; PNLIPRP3; RAB6IP1;

Referanslar

  1. ^ van Tilbeurgh H, Egloff MP, Martinez C, Rugani N, Verger R, Cambillau C (Nisan 1993). "Lipaz-procolipase kompleksinin, X-ışını kristalografisi ile ortaya çıkan karışık miseller ile arayüzey aktivasyonu". Doğa. 362 (6423): 814–20. doi:10.1038 / 362814a0. PMID  8479519. S2CID  4305832.
  2. ^ a b Bateman A, Sandford R (1999). "PLAT alanı: PKD1 bulmacasında yeni bir parça". Curr. Biol. 9 (16): R588–90. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80380-7. PMID  10469604. S2CID  15018010.
  3. ^ Ponting CP, Hofmann K, Bork P (Ağustos 1999). "Polikistin-1'de bir latrofilin / CL-1 benzeri GPS alanı". Curr. Biol. 9 (16): R585–8. doi:10.1016 / S0960-9822 (99) 80379-0. PMID  10469603. S2CID  17252179.
  4. ^ Delrieu I, Waller CC, Mota MM, Grainger M, Langhorne J, Holder AA (2002). "Çoklu yapışkan motiflere sahip bir protein olan PSLAP, Plasmodium falciparum gametocytes ". Mol. Biochem. Parasitol. 121 (1): 11–20. doi:10.1016 / S0166-6851 (02) 00016-6. PMID  11985859.
  5. ^ Minör W, Tomchick DR, Phan P, Cymborowski M, Holman TR (2001). "Soya fasulyesi lipoksijenaz-1'in ikinci koordinasyon küre mutantlarının yapısal ve fonksiyonel karakterizasyonu". Biyokimya. 40 (25): 7509–7517. doi:10.1021 / bi002893d. PMID  11412104.
Bu makale kamu malı metinleri içermektedir Pfam ve InterPro: IPR001024