Polimorfik toksinler - Polymorphic toxins

Polimorfik toksinler (PT'ler), birincil olarak bakteriler arasındaki rekabete dahil olan, ancak ökaryotik hücrelere enjekte edildiğinde patogeneze de dahil olan çok alanlı proteinlerdir.[1][2] Tüm büyük bakteri türlerinde bulunurlar.[3]

Bakteriler, çok çeşitli karmaşık topluluklarda yaşar. biyofilmler ve insanla ilişkili mikrobiyotlar. Bu toplulukların dinamikleri ve yapısı, toksik efektörlerin salgılanması yoluyla bakteriler arası rekabetten büyük ölçüde etkilenir. Bakteriler, komşularını temasa bağlı bir öldürme yoluyla (efektörler dahil) zehirleyerek rakiplerini yenmek için birkaç sistem geliştirmişlerdir. tip V ve VI salgısı sistemler) veya çözünür toksinlerin salınması (dahil kolikinler ) çevrede.

Tanım

Polimorfik toksinler bakteriyeldir ekzotoksinler ortak özellikleri paylaşan alan adı mimari.

Her bir PT ailesi, çeşitli diğer PT ailelerinde bulunabilen çeşitli C-terminal (CT) toksik alanlarla ilişkili korunmuş bir N-terminal bölgesi ile tanımlanır. Toksik alanların birkaç PT ailesi arasında paylaşılması, bu toksin kategorisinin ayırt edici özelliğidir. Bir in silico çalışmasıyla 150'den fazla farklı toksik etki alanından oluşan bir havuz tahmin edilmiştir. PT'ler arasında en sık bulunan toksik aktiviteler şunlardır: RNazlar, DNazlar, peptidazlar ve protein değiştirici aktiviteler.[3]

PT'ler, yeterli bağışıklık proteinine sahip olmayan bakteriyel rakiplerin öldürülmesine veya büyümesinin engellenmesine katılır. Aslında, PT sistemlerinde, koruyucu bir bağışıklık proteinini kodlayan bir gen, her zaman toksin geninin hemen aşağı akışında bulunur. Bağışıklık proteini, toksin üreten hücreyi hem oto-zehirlenmeden hem de diğer türler tarafından üretilen toksinden korumak için sitoplazmada mevcuttur.[4]

Polimorfik toksin aileleri

En çok çalışılan YT aileleri aşağıdakileri kapsar: kolikinler toksik efektörleri tip V salgı sistemleri, bazı toksik efektörler tip VI salgı sistemleri ve MafB toksinleri.

Referanslar

  1. ^ Hayes, C. S; Koskiniemi, S; Ruhe, Z. C; Poole, S. J; Düşük, D.A (2014). "Temasa Bağlı Büyüme Engelleme Sistemlerinin Mekanizmaları ve Biyolojik Rolleri". Tıpta Cold Spring Harbor Perspektifleri. 4 (2): a010025. doi:10.1101 / cshperspect.a010025. PMC  3904093. PMID  24492845.
  2. ^ Jamet, Anne; Nassif Xavier (2015). "Toksin Alanındaki Yeni Oyuncular: Bakterilerde Polimorfik Toksin Sistemleri". mBio. 6 (3): e00285–15. doi:10.1128 / mBio.00285-15. PMC  4436062. PMID  25944858.
  3. ^ a b Zhang, Dapeng; De Souza, Robson F; Anantharaman, Vivek; Iyer, Lakshminarayan M; Aravind, L (2012). "Polimorfik toksin sistemleri: Karşılaştırmalı genomik kullanarak kaçakçılık modlarının, işlemenin, etki mekanizmalarının, bağışıklık ve ekolojinin kapsamlı karakterizasyonu". Biyoloji Doğrudan. 7: 18. doi:10.1186/1745-6150-7-18. PMC  3482391. PMID  22731697.
  4. ^ Zhang, Dapeng; Iyer, Lakshminarayan M; Aravind, L (2011). "Bakteriyel nükleik asit indirgeyen toksinler için yeni bir bağışıklık sistemi ve çeşitli ökaryotik ve DNA viral sistemlerinde toplanması". Nükleik Asit Araştırması. 39 (11): 4532–52. doi:10.1093 / nar / gkr036. PMC  3113570. PMID  21306995.
  5. ^ Willett, Julia L.E; Ruhe, Zachary C; Goulding, Celia W; Düşük, David A; Hayes, Christopher S (2015). "Temasa Bağlı Büyüme Engelleme (CDI) ve CdiB / CdiA İki Ortak Salgı Proteinleri". Moleküler Biyoloji Dergisi. 427 (23): 3754–65. doi:10.1016 / j.jmb.2015.09.010. PMC  4658273. PMID  26388411.
  6. ^ Koskiniemi, S; Lamoureux, J. G; Nikolakakis, K. C; t'Kint De Roodenbeke, C; Kaplan, M.D .; Düşük, D. A; Hayes, C.S (2013). "Çeşitli bakterilerden alınan Rh proteinleri, hücreler arası rekabete aracılık eder". Ulusal Bilimler Akademisi Bildiriler Kitabı. 110 (17): 7032–7. doi:10.1073 / pnas.1300627110. PMC  3637788. PMID  23572593.
  7. ^ Brooks, Teresa M; Unterweger, Daniel; Bachmann, Verena; Kostiuk, Benjamin; Pukatzki Stefan (2013). "Lytic Aktivitesi Vibrio cholerae Tip VI Salgılama Toksini VgrG-3, Antitoksin TsaB Tarafından İnhibe Edilir ". Biyolojik Kimya Dergisi. 288 (11): 7618–25. doi:10.1074 / jbc.M112.436725. PMC  3597803. PMID  23341465.
  8. ^ Ma, Jiale; Pan, Zihao; Huang, Jinhu; Güneş, Min; Lu, Chengping; Yao, Huochun (2017). "Çeşitli genişletilmiş toksin alanlarıyla birleştirilmiş Hcp proteinleri, tip VI salgı sistemlerinde yeni bir antibakteriyel efektör modelini temsil eder". Virülans. 8 (7): 1189–1202. doi:10.1080/21505594.2017.1279374. PMC  5711352. PMID  28060574.
  9. ^ Jamet, Anne; Jousset, Agnès B; Euphrasie, Daniel; Mukorako, Paulette; Boucharlat, Alix; Ducousso, Alexia; Charbit, Alain; Nassif Xavier (2015). "Patojenik Neisseria Türlerinde Yeni Bir Toksin Ailesi". PLoS Patojenleri. 11 (1): e1004592. doi:10.1371 / journal.ppat.1004592. PMC  4287609. PMID  25569427.

Ayrıca bakınız