RAPGEF1 - RAPGEF1

RAPGEF1
Tanımlayıcılar
Takma adlar	RAPGEF1, C3G, GRF2, Rap guanin nükleotid değişim faktörü 1
Harici kimlikler	OMIM: 600303 MGI: 104580 HomoloGene: 50501 GeneCard'lar: RAPGEF1
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 9 (insan)
Son	131,740,074 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 2 (fare)
Son	29,740,978 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• SH3 etki alanı bağlama; • GO: 0001948 protein bağlama; • Rap guanil-nükleotid değişim faktörü aktivitesi; • guanil-nükleotid değişim faktörü aktivitesi;
Hücresel bileşen	• sitozol; • endozom; • erken endozom; • fagositik vezikül zarı; • sitoplazmanın perinükleer bölgesi; • sitoplazma; • makromoleküler kompleks;
Biyolojik süreç	• endotel bariyerinin kurulması; • protein kinaz B sinyalinin negatif düzenlenmesi; • sinir büyüme faktörü uyarısına hücresel yanıt; • hücre bağlantı düzeneğinin düzenlenmesi; • MAPKK aktivitesinin aktivasyonu; • transmembran reseptör proteini tirozin kinaz sinyal yolu; • küçük GTPaz aracılı sinyal iletimi; • Rap protein sinyal iletimi; • nöral öncü hücre proliferasyonunun negatif düzenlenmesi; • sinir büyüme faktörü sinyal yolu; • sinir sistemi gelişimi; • Ras protein sinyal iletiminin negatif düzenlenmesi; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 GTPase aktivitesinin pozitif düzenlemesi; • kan damarı gelişimi; • ERK1 ve ERK2 kademesinin negatif regülasyonu; • trombosit kaynaklı büyüme faktörü reseptörü sinyal yolu; • kanonik Wnt sinyal yolunun negatif regülasyonu; • cAMP'ye hücresel yanıt; • sinyal iletimi; • nöron projeksiyon gelişiminin pozitif düzenlenmesi; • JNK kaskadının düzenlenmesi; • ERK1 ve ERK2 kademesinin pozitif düzenlenmesi; • fagositozla ilgili Fc-gama reseptör sinyal yolunun pozitif düzenlenmesi; • hücre-hücre yapışması; • sitokin aracılı sinyal yolu; • Ras protein sinyal iletiminin pozitif düzenlenmesi; • GO: 0032861, GO: 0032862, GO: 0032856 GTPase etkinliğinin etkinleştirilmesi;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	2889
	107746
	ENSG00000107263
	ENSMUSG00000039844
	Q13905
	n / a
NM_001304275; NM_005312; NM_198679; NM_001377935; NM_001377936;
	NM_001377937; NM_001377938
	NM_001039086; NM_001039087; NM_054050; NM_001362702
NP_001291204; NP_005303; NP_941372; NP_001364864; NP_001364865;
	NP_001364866; NP_001364867
	n / a
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Rap guanin nükleotid değişim faktörü 1 bir protein insanlarda kodlanır RAPGEF1 gen.^[5]^[6]

Fonksiyon

Bu gen tarafından kodlanan protein, Ras proteini için bir insan guanin nükleotidi salan proteindir. Adaptör tipi Src homoloji (SH) 2 içeren moleküllere aittir. Src homoloji 2 alanları, çok çeşitli fonksiyonel olarak farklı proteinlerde bulunan küresel protein modülleridir. Sinyallerin hücre yüzeyinden çekirdeğe iletilmesinde rol oynayan birçok proteinin aktivitesini ve lokalizasyonunu kontrol eden bağlanma olaylarına aracılık ederler. Bu proteinlerin mRNA'ları insan yetişkin ve fetal dokularında her yerde eksprese edilir. Bu genin çeşitli alternatif olarak eklenmiş transkript varyantları tarif edilmiştir, ancak bazı varyantların tam uzunluktaki doğası belirlenmemiştir.^[7]

Etkileşimler

RAPGEF1'in gösterdiği etkileşim ile:

BCAR1,^[8]
CRK,^[6]
CRKL^[9]^[10]^[11]^[12]^[13]^[14]^[15]
Grb2,^[6]^[9] ve
HCK.^[16]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000107263 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000039844 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Takai S, Tanaka M, Sugimura H, Yamada K, Naito Y, Kino I, Matsuda M (Kasım 1994). "Ras ailesi için bir guanin nükleotidi salan proteini kodlayan insan C3G geninin floresan yerinde hibridizasyon ile 9q34.3'e haritalanması". İnsan Genetiği. 94 (5): 549–50. doi:10.1007 / bf00211024. PMID 7959692. S2CID 34197232.
^ ^a ^b ^c Tanaka S, Morishita T, Hashimoto Y, Hattori S, Nakamura S, Shibuya M, Matuoka K, Takenawa T, Kurata T, Nagashima K (Nisan 1994). "Her yerde eksprese edilen guanin nükleotid salgılayan bir protein olan C3G, CRK ve GRB2 / ASH proteinlerinin Src homoloji 3 alanlarına bağlanır". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 91 (8): 3443–7. doi:10.1073 / pnas.91.8.3443. PMC 43593. PMID 7512734.
^ "Entrez Geni: RAPGEF1 Rap guanin nükleotid değişim faktörü (GEF) 1".
^ Kirsch KH, Georgescu MM, Hanafusa H (Ekim 1998). "P130'un (Cas) guanin nükleotid değişim faktörü C3G'ye doğrudan bağlanması". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (40): 25673–9. doi:10.1074 / jbc.273.40.25673. PMID 9748234.
^ ^a ^b Smit L, van der Horst G, Borst J (Nisan 1996). "Sos, Vav ve C3G, B hücresi reseptörünün neden olduğu sinyal yollarına katılır ve Shc-Grb2, Crk ve Crk-L adaptörleriyle farklı şekilde birleşir". Biyolojik Kimya Dergisi. 271 (15): 8564–9. doi:10.1074 / jbc.271.15.8564. PMID 8621483.
^ Kyono WT, de Jong R, Park RK, Liu Y, Heisterkamp N, Groffen J, Durden DL (Kasım 1998). "IgG (Fc gamma RI) için miyeloid yüksek afiniteli Fc reseptörünün sinyallemesinde Crkl'nin Cbl veya C3G, Hef-1 ve gama alt birimi immünoreseptör tirozin bazlı aktivasyon motifi ile diferansiyel etkileşimi". Journal of Immunology. 161 (10): 5555–63. PMID 9820532.
^ Grumbach IM, Mayer IA, Uddin S, Lekmine F, Majchrzak B, Yamauchi H, Fujita S, Druker B, Fish EN, Platanias LC (Şubat 2001). "CrkL adaptörünün BCR-ABL-ifade eden hücrelerde interferon alfa sinyallemesine bağlanması". İngiliz Hematoloji Dergisi. 112 (2): 327–36. doi:10.1046 / j.1365-2141.2001.02556.x. PMID 11167825. S2CID 85033851.
^ Ahmad S, Alsayed YM, Druker BJ, Platanias LC (Kasım 1997). "Tip I interferon reseptörü, CrkL adaptör proteinin tirozin fosforilasyonuna aracılık eder". Biyolojik Kimya Dergisi. 272 (48): 29991–4. doi:10.1074 / jbc.272.48.29991. PMID 9374471.
^ Chin H, Saito T, Arai A, Yamamoto K, Kamiyama R, Miyasaka N, Miura O (Ekim 1997). "Eritropoietin ve IL-3, CrkL'nin tirozin fosforilasyonunu ve bunun hematopoietik hücrelerde Shc, SHP-2 ve Cbl ile ilişkisini indükler". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 239 (2): 412–7. doi:10.1006 / bbrc.1997.7480. PMID 9344843.
^ Wu C, Lai CF, Mobley WC (Ağustos 2001). "Sinir büyüme faktörü, endozomlarda kalıcı Rap1 sinyalini etkinleştirir". Nörobilim Dergisi. 21 (15): 5406–16. doi:10.1523 / JNEUROSCI.21-15-05406.2001. PMID 11466412.
^ Sakkab D, Lewitzky M, Posern G, Schaeper U, Sachs M, Birchmeier W, Feller SM (Nisan 2000). "Hepatosit büyüme faktörü / saçılma faktörünün (HGF), büyük kenetlenme proteini Gab1 ve adaptör protein CRKL aracılığıyla küçük GTPaz Rap1'e sinyali". Biyolojik Kimya Dergisi. 275 (15): 10772–8. doi:10.1074 / jbc.275.15.10772. PMID 10753869.
^ Shivakrupa R, Radha V, Sudhakar Ch, Swarup G (Aralık 2003). "Hck tirozin kinaz ve guanin nükleotid değişim faktörü C3G arasındaki fiziksel ve fonksiyonel etkileşim, C3G katalitik alanından bağımsız olan apoptoza neden olur". Biyolojik Kimya Dergisi. 278 (52): 52188–94. doi:10.1074 / jbc.M310656200. PMID 14551197.

daha fazla okuma

Pessin JE, Okada S (Mart 1999). "İnsülin ve EGF reseptörleri, Ras ve Rap sinyal yollarını birleştirir". Endokrin Dergisi. 46 Özel Sayı: S11-6. doi:10.1507 / endocrj.46.suppl_s11. PMID 12054111.
Ehrhardt A, Ehrhardt GR, Guo X, Schrader JW (Ekim 2002). "Ras ve akrabalar - iş paylaşımı ve ağ oluşturma eski bir aileyi bir arada tutuyor". Deneysel Hematoloji. 30 (10): 1089–106. doi:10.1016 / S0301-472X (02) 00904-9. PMID 12384139.
Knudsen BS, Feller SM, Hanafusa H (Aralık 1994). "Guanin-nükleotid değişim faktörü C3G'nin prolin açısından zengin dört sekansı, Crk'nin birinci Src homoloji 3 alanına benzersiz bir özgüllükle bağlanır". Biyolojik Kimya Dergisi. 269 (52): 32781–7. PMID 7806500.
Gotoh T, Hattori S, Nakamura S, Kitayama H, Noda M, Takai Y, Kaibuchi K, Matsui H, Hatase O, Takahashi H (Aralık 1995). "Crk SH3 etki alanına bağlanan guanin nükleotid salım faktörü C3G için bir hedef olarak Rap1'in belirlenmesi". Moleküler ve Hücresel Biyoloji. 15 (12): 6746–53. doi:10.1128 / mcb.15.12.6746. PMC 230928. PMID 8524240.
Smit L, van der Horst G, Borst J (Nisan 1996). "Sos, Vav ve C3G, B hücresi reseptörünün neden olduğu sinyal yollarına katılır ve Shc-Grb2, Crk ve Crk-L adaptörleriyle farklı şekilde birleşir". Biyolojik Kimya Dergisi. 271 (15): 8564–9. doi:10.1074 / jbc.271.15.8564. PMID 8621483.
Matsuda M, Ota S, Tanimura R, Nakamura H, Matuoka K, Takenawa T, Nagashima K, Kurata T (Haziran 1996). "CRK'nın amino terminal SH3 alanı ile doğal hedef proteinleri arasındaki etkileşim". Biyolojik Kimya Dergisi. 271 (24): 14468–72. doi:10.1074 / jbc.271.24.14468. PMID 8662907.
Uemura N, Salgia R, Li JL, Pisick E, Sattler M, Griffin JD (Mart 1997). "BCR / ABL onkogeni, CRKL ve CRK adaptör proteinlerinin hücresel proteinlerle etkileşimini değiştirir". Lösemi. 11 (3): 376–85. doi:10.1038 / sj.leu.2400590. PMID 9067577.
Husson H, Mograbi B, Schmid-Antomarchi H, Fischer S, Rossi B (Mayıs 1997). "CSF-1 uyarımı, CSF-1 reseptörü, c-Cbl, PI 3-kinaz, Crk-II ve Grb2 dahil bir multiplrotein kompleksinin oluşumunu indükler". Onkojen. 14 (19): 2331–8. doi:10.1038 / sj.onc.1201074. PMID 9178909.
Chin H, Saito T, Arai A, Yamamoto K, Kamiyama R, Miyasaka N, Miura O (Ekim 1997). "Eritropoietin ve IL-3, CrkL'nin tirozin fosforilasyonunu ve bunun hematopoietik hücrelerde Shc, SHP-2 ve Cbl ile ilişkisini indükler". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 239 (2): 412–7. doi:10.1006 / bbrc.1997.7480. PMID 9344843.
Ahmad S, Alsayed YM, Druker BJ, Platanias LC (Kasım 1997). "Tip I interferon reseptörü, CrkL adaptör proteinin tirozin fosforilasyonuna aracılık eder". Biyolojik Kimya Dergisi. 272 (48): 29991–4. doi:10.1074 / jbc.272.48.29991. PMID 9374471.
Guerrero C, Fernandez-Medarde A, Rojas JM, Font de Mora J, Esteban LM, Santos E (Şubat 1998). "C3G'nin dönüşüm baskılayıcı aktivitesi, CDC25 homoloji alanından bağımsızdır". Onkojen. 16 (5): 613–24. doi:10.1038 / sj.onc.1201569. PMID 9482107.
Ohashi Y, Tachibana K, Kamiguchi K, Fujita H, Morimoto C (Mart 1998). "105-kDa Crk ile ilişkili substrat ile ilişkili bir protein olan Cas-L'nin T hücresi reseptör aracılı tirozin fosforilasyonu ve Crk ve C3G'nin ilişkisi". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (11): 6446–51. doi:10.1074 / jbc.273.11.6446. PMID 9497377.
Astier A, Manié SN, Law SF, Canty T, Haghayghi N, Druker BJ, Salgia R, Golemis EA, Freedman AS (Aralık 1997). "Cas benzeri molekül HEF1'in, insan B hücrelerinde integrin ve antijen reseptör sinyallemesini takiben CrkL ile ilişkilendirilmesi: neoplastik lenfohematopoietik hücrelerle potansiyel alaka". Lösemi ve Lenfoma. 28 (1–2): 65–72. doi:10.3109/10428199709058332. PMID 9498705.
Yokote K, Hellman U, Ekman S, Saito Y, Rönnstrand L, Saito Y, Heldin CH, Mori S (Mart 1998). "Plateletten türetilmiş büyüme faktörü alfa reseptöründe Crk proteinleri için bağlanma bölgesi olarak Tyr-762'nin belirlenmesi". Onkojen. 16 (10): 1229–39. doi:10.1038 / sj.onc.1201641. PMID 9546424.
Kirsch KH, Georgescu MM, Hanafusa H (Ekim 1998). "P130'un (Cas) guanin nükleotid değişim faktörü C3G'ye doğrudan bağlanması". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (40): 25673–9. doi:10.1074 / jbc.273.40.25673. PMID 9748234.
Ichiba T, Hashimoto Y, Nakaya M, Kuraishi Y, Tanaka S, Kurata T, Mochizuki N, Matsuda M (Mayıs 1999). "Tirosin 504'ün fosforilasyonu ile Rap1 için C3G guanin nükleotid değişim faktörünün aktivasyonu". Biyolojik Kimya Dergisi. 274 (20): 14376–81. doi:10.1074 / jbc.274.20.14376. PMID 10318861.
Nosaka Y, Arai A, Miyasaka N, Miura O (Ekim 1999). "CrkL, eritropoietin veya interlökin-3 ile uyarılan hematopoietik hücrelerde guanin nükleotid değişim faktörü C3G yoluyla Raf / ERK yolağının Ras bağımlı aktivasyonuna aracılık eder". Biyolojik Kimya Dergisi. 274 (42): 30154–62. doi:10.1074 / jbc.274.42.30154. PMID 10514505.
Uemura N, Griffin JD (Aralık 1999). "Adaptör protein Crkl, integrin ligasyonundan sonra Cbl'yi C3G'ye bağlar ve hücre göçünü artırır". Biyolojik Kimya Dergisi. 274 (53): 37525–32. doi:10.1074 / jbc.274.53.37525. PMID 10608804.

Dış bağlantılar

RAPGEF1 Bağlantıları olan bilgi Hücre Geçiş Ağ Geçidi

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000107263 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000039844 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[pmid7959692-5] Takai S, Tanaka M, Sugimura H, Yamada K, Naito Y, Kino I, Matsuda M (Kasım 1994). "Ras ailesi için bir guanin nükleotidi salan proteini kodlayan insan C3G geninin floresan yerinde hibridizasyon ile 9q34.3'e haritalanması". İnsan Genetiği. 94 (5): 549–50. doi:10.1007 / bf00211024. PMID 7959692. S2CID 34197232.

[pmid7512734-6] Tanaka S, Morishita T, Hashimoto Y, Hattori S, Nakamura S, Shibuya M, Matuoka K, Takenawa T, Kurata T, Nagashima K (Nisan 1994). "Her yerde eksprese edilen guanin nükleotid salgılayan bir protein olan C3G, CRK ve GRB2 / ASH proteinlerinin Src homoloji 3 alanlarına bağlanır". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 91 (8): 3443–7. doi:10.1073 / pnas.91.8.3443. PMC 43593. PMID 7512734.

[entrez-7] "Entrez Geni: RAPGEF1 Rap guanin nükleotid değişim faktörü (GEF) 1".

[pmid9748234-8] Kirsch KH, Georgescu MM, Hanafusa H (Ekim 1998). "P130'un (Cas) guanin nükleotid değişim faktörü C3G'ye doğrudan bağlanması". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (40): 25673–9. doi:10.1074 / jbc.273.40.25673. PMID 9748234.

[pmid8621483-9] Smit L, van der Horst G, Borst J (Nisan 1996). "Sos, Vav ve C3G, B hücresi reseptörünün neden olduğu sinyal yollarına katılır ve Shc-Grb2, Crk ve Crk-L adaptörleriyle farklı şekilde birleşir". Biyolojik Kimya Dergisi. 271 (15): 8564–9. doi:10.1074 / jbc.271.15.8564. PMID 8621483.

[pmid9820532-10] Kyono WT, de Jong R, Park RK, Liu Y, Heisterkamp N, Groffen J, Durden DL (Kasım 1998). "IgG (Fc gamma RI) için miyeloid yüksek afiniteli Fc reseptörünün sinyallemesinde Crkl'nin Cbl veya C3G, Hef-1 ve gama alt birimi immünoreseptör tirozin bazlı aktivasyon motifi ile diferansiyel etkileşimi". Journal of Immunology. 161 (10): 5555–63. PMID 9820532.

[pmid11167825-11] Grumbach IM, Mayer IA, Uddin S, Lekmine F, Majchrzak B, Yamauchi H, Fujita S, Druker B, Fish EN, Platanias LC (Şubat 2001). "CrkL adaptörünün BCR-ABL-ifade eden hücrelerde interferon alfa sinyallemesine bağlanması". İngiliz Hematoloji Dergisi. 112 (2): 327–36. doi:10.1046 / j.1365-2141.2001.02556.x. PMID 11167825. S2CID 85033851.

[pmid9374471-12] Ahmad S, Alsayed YM, Druker BJ, Platanias LC (Kasım 1997). "Tip I interferon reseptörü, CrkL adaptör proteinin tirozin fosforilasyonuna aracılık eder". Biyolojik Kimya Dergisi. 272 (48): 29991–4. doi:10.1074 / jbc.272.48.29991. PMID 9374471.

[pmid9344843-13] Chin H, Saito T, Arai A, Yamamoto K, Kamiyama R, Miyasaka N, Miura O (Ekim 1997). "Eritropoietin ve IL-3, CrkL'nin tirozin fosforilasyonunu ve bunun hematopoietik hücrelerde Shc, SHP-2 ve Cbl ile ilişkisini indükler". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi. 239 (2): 412–7. doi:10.1006 / bbrc.1997.7480. PMID 9344843.

[pmid11466412-14] Wu C, Lai CF, Mobley WC (Ağustos 2001). "Sinir büyüme faktörü, endozomlarda kalıcı Rap1 sinyalini etkinleştirir". Nörobilim Dergisi. 21 (15): 5406–16. doi:10.1523 / JNEUROSCI.21-15-05406.2001. PMID 11466412.

[pmid10753869-15] Sakkab D, Lewitzky M, Posern G, Schaeper U, Sachs M, Birchmeier W, Feller SM (Nisan 2000). "Hepatosit büyüme faktörü / saçılma faktörünün (HGF), büyük kenetlenme proteini Gab1 ve adaptör protein CRKL aracılığıyla küçük GTPaz Rap1'e sinyali". Biyolojik Kimya Dergisi. 275 (15): 10772–8. doi:10.1074 / jbc.275.15.10772. PMID 10753869.

[pmid14551197-16] Shivakrupa R, Radha V, Sudhakar Ch, Swarup G (Aralık 2003). "Hck tirozin kinaz ve guanin nükleotid değişim faktörü C3G arasındaki fiziksel ve fonksiyonel etkileşim, C3G katalitik alanından bağımsız olan apoptoza neden olur". Biyolojik Kimya Dergisi. 278 (52): 52188–94. doi:10.1074 / jbc.M310656200. PMID 14551197.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]