RNase R - RNase R - Wikipedia

RNase Rveya Ribonuclease R, 3 '-> 5' eksoribonükleaz ait olan RNase II üst aile, RNA'yı 3 '- 5' yönünde hidrolize eden bir enzim grubu. RNase R'nin seçici olarak dahil olduğu gösterilmiştir. mRNA bakterilerde özellikle durmayan mRNA'ların bozulması.[1][2] RNase R, homologlar diğer birçok organizmada.

Daha büyük bir proteinin bir parçası bir alan adı bu RNase R'ye çok benzer, buna bir RNase R alanı.

Rolü trans-translasyon ve ribozomal kalite kontrolü

RNase R, çeviri doğruluğunu sağlar, doğru rRNA anormal rRNA'ların olgunlaşması ve ortadan kaldırılması ve trans-hasarlı mRNA'ları parçalamak için çeviri sistemi.[3]

İçinde Escherichia coli, RNase R, sekans spesifikliği göstermeden yapılandırılmış RNA substratlarını degrade etme karakteristik kapasitesine sahip 92 kD'lik bir proteindir. Bu nedenle, RNaz R, ribozomal, transfer, haberci ve küçük kodlamayan RNA'lar gibi bir dizi substrat üzerinde etki eder. RNaz R, tmRNA ve SmpB içeren ribonükleoprotein kompleksi ile ilişkilidir ve soğuk şok altında tmRNA'nın geliştirilmesinde rol oynar.[3]

RNase R ayrıca aşağıdakilerle de ilişkilidir: ribozomlar ve katılır rRNA veya ribozomal RNA, kalite kontrol süreçleri. RNase R, bir laboratuvar ortamında rRNA için afinite. Birkaç rRNA kalite kontrol yolunda, RNase R, hatalı rRNA moleküllerinin uzaklaştırılmasını artırarak bir ana faktör olarak davranır. Bu protein aynı zamanda rRNA öncüllerini işlemek ve ribozom bütünlüğünü gözlemlemek için kritiktir.[3]

RNA sindirimi

RNase R'nin iki soğuk şok alanı, bir RNase katalitik alanı, bir S1 alanı ve bir temel alanı vardır.[4]

Bir hücrede RNaz R'nin fazla bolluğu zararlıdır çünkü RNaz R, RNA'ları parçalamada diğer bakteriyel ekzoribonükleazlara göre daha aktif ve daha etkilidir. RNase II.[5] Yedi nükleotidden daha kısa 3 'çıkıntıları olan çift sarmallı RNA oluşturan substrat RNA'ların yanı sıra, RNase R tüm doğrusal RNA'ları bozabilir.[6]Ökaryotik lineer RNA'ların metodik sindirimi için, RNase R iyi bir 3 'ila 5' ekzoribonükleazdır, ancak nadiren RNaz R direnci vakaları vardır. MRNA'lar, başlık yapısı tarafından 5 'uçlarında sağlanan korumanın aksine, 3' uçlarında kimyasal olarak korunmadığından, RNase R doğrusal mRNA'ları korumasız 3 'uçlarından başarıyla bozar.[4]

Referanslar

  1. ^ Cheng ZF, Deutscher MP (Ocak 2005). "MRNA bozunmasında RNaz R için önemli bir rol". Moleküler Hücre. 17 (2): 313–8. doi:10.1016 / j.molcel.2004.11.048. PMID  15664199.
  2. ^ Venkataraman K, Guja KE, Garcia-Diaz M, Karzai AW (2014). "Kesintisiz mRNA bozunması: trans-translasyon aracılı ribozom kurtarmanın özel bir niteliği". Mikrobiyolojide Sınırlar. 5: 93. doi:10.3389 / fmicb.2014.00093. PMC  3949413. PMID  24653719.
  3. ^ a b c Domingues S, Moreira RN, Andrade JM, Dos Santos RF, Bárria C, Viegas SC, Arraiano CM (Temmuz 2015). "Trans-translasyon ve ribozomal kalite kontrolünde RNase R'nin rolü". Biochimie. 114: 113–8. doi:10.1016 / j.biochi.2014.12.012. PMID  25542646.
  4. ^ a b Suzuki H, Tsukahara T (Mayıs 2014). "RNase R dirençli RNA'lardan pre-mRNA eklemesinin bir görünümü". Uluslararası Moleküler Bilimler Dergisi. 15 (6): 9331–42. doi:10.3390 / ijms15069331. PMC  4100097. PMID  24865493.
  5. ^ Cheng ZF, Deutscher MP (Haziran 2002). "Escherichia coli ekzoribonükleaz RNaz R'nin saflaştırılması ve karakterizasyonu RNase II ile Karşılaştırma". Biyolojik Kimya Dergisi. 277 (24): 21624–9. doi:10.1074 / jbc.M202942200. PMID  11948193.
  6. ^ Vincent HA, Deutscher MP (Ekim 2006). "Ekzoribonükleaz RNaz R ile substrat tanıma ve kataliz". Biyolojik Kimya Dergisi. 281 (40): 29769–75. doi:10.1074 / jbc.M606744200. PMID  16893880.