SOX17 - SOX17

SOX17
Mevcut yapılar
PDB	Ortolog araması: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	2 YIL, 4A3N
Tanımlayıcılar
Takma adlar	SOX17, VUR3, SRY-box 17, SRY-box transkripsiyon faktörü 17
Harici kimlikler	OMIM: 610928 MGI: 107543 HomoloGene: 7948 GeneCard'lar: SOX17
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 8 (insan)
Son	54,460,892 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 1 (fare)
Son	4,497,354 bp
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• diziye özgü DNA bağlanması; • DNA bağlanması; • beta-katenin bağlanması; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 DNA bağlayıcı transkripsiyon aktivatör aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü; • GO: 0001105 transkripsiyon koaktivatör aktivitesi; • transkripsiyon faktör bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama; • protein heterodimerizasyon aktivitesi; • transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II distal güçlendirici diziye özgü bağlanma; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü;
Hücresel bileşen	• transkripsiyon düzenleyici kompleksi; • nükleoplazma; • hücre çekirdeği;
Biyolojik süreç	• böbrek sistemi gelişimi; • endoderm gelişimi; • embriyonik gelişimin düzenlenmesi; • transkripsiyonun düzenlenmesi, DNA şablonlu; • protein katabolik sürecinin pozitif düzenlenmesi; • kök hücre kaderi spesifikasyonu; • iskelet kası dokusu gelişiminin pozitif düzenlenmesi; • embriyonik ön bağırsak morfogenezi; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun düzenlenmesi, kesin endodermal hücre kaderi spesifikasyonunda yer alır; • embriyonik organ gelişimi; • endodermal sindirim sistemi morfogenezi; • mezodermal hücre kaderi spesifikasyonunun negatif düzenlenmesi; • iç hücre kütlesi hücresel morfogenezi; • Wnt sinyal yolunun negatif regülasyonu; • protein stabilizasyonu; • endokardiyum oluşumu; • çıkış yolu morfogenezi; • gen ifadesinin düzenlenmesinde yer alan sinyal iletimi; • endodermal hücre kaderi belirleme; • RNA polimeraz II promotöründen mRNA transkripsiyonu; • mezodermal hücre kaderi spesifikasyonunun düzenlenmesi; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun negatif düzenlenmesi; • Wnt sinyal yolu; • endokardiyal hücre farklılaşması; • kardiyak hücre kaderi spesifikasyonunun düzenlenmesi; • transkripsiyon, DNA şablonlu; • kök hücre farklılaşması; • embriyonik kalp tüpü gelişimi; • vaskülogenez; • pozitif transkripsiyon düzenlemesi, DNA şablonlu; • kalp döngüsü; • kalp hücresi kaderi belirleme; • ortak safra kanalı gelişimi; • kalp gelişiminde rol oynayan Wnt sinyal yolunun negatif düzenlenmesi; • rostrokaudal nöral tüp modellemesi; • gen ifadesinin pozitif düzenlenmesi; • kardiyojenik plaka morfogenezi; • kalp oluşumu; • embriyonik kalp tüpü morfogenezi; • hücre büyümesinin negatif düzenlenmesi; • protein dengesizliği; • damarlanma; • spermatogenez; • hücre farklılaşmasının pozitif düzenlenmesi; • kök hücre bölünmesinin düzenlenmesi; • gastrulasyon; • safra kesesi gelişimi; • kanonik Wnt sinyal yolu; • hücre farklılaşmasının düzenlenmesi; • gastrulasyonla ilgili hücre göçü; • endoderm oluşumu; • kök hücre proliferasyonunun düzenlenmesi; • kanonik Wnt sinyal yolunun negatif regülasyonu; • RNA polimeraz II promotöründen transkripsiyonun pozitif düzenlenmesi; • lösemi inhibitör faktörüne hücresel yanıt; • hücre farklılaşması;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	64321
	20671
	ENSG00000164736
	ENSMUSG00000025902
	Q9H6I2
	Q61473
	NM_022454
	NM_001289464; NM_001289465; NM_001289466; NM_001289467; NM_011441
	NP_071899
	NP_001276393; NP_001276394; NP_001276395; NP_001276396; NP_035571
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

SRY kutusu 17 bir protein insanlarda SOX17 tarafından kodlandığı gen.^[5]

Fonksiyon

Bu gen, embriyonik gelişimin düzenlenmesinde ve hücre kaderinin belirlenmesinde rol alan SOX (SRY-ilişkili HMG-kutusu) ailesinin bir kopyalama faktörleri üyesini kodlar. Kodlanan protein, diğer proteinlerle bir protein kompleksi oluşturduktan sonra bir transkripsiyon düzenleyici olarak hareket edebilir.

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000164736 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000025902 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Entrez Gene: SRY-box 17". Alındı 2017-09-07.

daha fazla okuma

Zhang W, Glöckner SC, Guo M, Machida EO, Wang DH, Easwaran H, Van Neste L, Herman JG, Schuebel KE, Watkins DN, Ahuja N, Baylin SB (2008). "Kolorektal kanserde gen 17 içeren kanonik Wnt antagonisti SRY kutusunun epigenetik inaktivasyonu". Kanser Res. 68 (8): 2764–72. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-07-6349. PMC 2823123. PMID 18413743.
Patterson ES, Addis RC, Shamblott MJ, Gearhart JD (2008). "SOX17, in vitro endoderm farklılaşması sırasında Zfp202 transkripsiyonunu doğrudan aktive eder". Physiol. Genomik. 34 (3): 277–84. doi:10.1152 / physiolgenomics.90236.2008. PMID 18523156.
Ferrell RE, Kimak MA, Lawrence EC, Finegold DN (2008). "Birincil lenfödemde aday gen analizi". Lymphat Res Biol. 6 (2): 69–76. doi:10.1089 / lrb.2007.1022. PMID 18564921.
Séguin CA, Draper JS, Nagy A, Rossant J (2008). "İnsan embriyonik kök hücrelerinde SOX transkripsiyon faktörü ekspresyonu ile endoderm progenitörlerinin oluşturulması". Hücre Kök Hücre. 3 (2): 182–95. doi:10.1016 / j.stem.2008.06.018. PMID 18682240.
Semb H (2008). "Genişletilebilir endodermal öncüler: endoderm ve türevlerini keşfetmek için yeni araçlar". Hücre Kök Hücre. 3 (4): 355–6. doi:10.1016 / j.stem.2008.09.010. PMID 18940723.
Fu DY, Wang ZM, Li-Chen, Wang BL, Shen ZZ, Huang W, Shao ZM (2010). "Kanonik Wnt antagonisti olan Sox17, insan göğüs kanserinde promoter metilasyonu ile epigenetik olarak etkisiz hale getirilir". Meme Kanseri Arş. Tedavi etmek. 119 (3): 601–12. doi:10.1007 / s10549-009-0339-8. PMID 19301122. S2CID 8614063.
Nonaka D (2009). "Testis germ hücre tümörlerinde SOX2 ve SOX17'nin diferansiyel ekspresyonu". Am. J. Clin. Pathol. 131 (5): 731–6. doi:10.1309 / AJCP7MNCNBCRN8NO. PMID 19369635.
Du YC, Oshima H, Oguma K, Kitamura T, Itadani H, Fujimura T, Piao YS, Yoshimoto T, Minamoto T, Kotani H, Taketo MM, Oshima M (2009). "Sox17'nin indüksiyonu ve aşağı regülasyonu ve gastrointestinal tümörigenez sırasında olası rolleri". Gastroenteroloji. 137 (4): 1346–57. doi:10.1053 / j.gastro.2009.06.041. PMID 19549530.
Stefanovic S, Abboud N, Désilets S, Nury D, Cowan C, Pucéat M (2009). "Oct4'ün Sox2 ve Sox17 ile etkileşimi: kök hücre pluripotensinden bir kardiyak kaderi belirlemeye moleküler geçiş". J. Hücre Biol. 186 (5): 665–73. doi:10.1083 / jcb.200901040. PMC 2742180. PMID 19736317.

Bu makale, Birleşik Devletler Ulusal Tıp Kütüphanesi içinde olan kamu malı.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 8 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000164736 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000025902 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-5] "Entrez Gene: SRY-box 17". Alındı 2017-09-07.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]