SRRM1 - SRRM1

SRRM1

Protein SRRM1 PDB 1mp1.png

Mevcut yapılar

İnsan UniProt araması: PDBe RCSB

PDB kimlik kodlarının listesi
1 MP1

Tanımlayıcılar

SRRM1, 160-KD, POP101, SRM160, serin ve arginin tekrarlayan matris 1

Harici kimlikler

OMIM: 605975 HomoloGene: 136796 GeneCard'lar: SRRM1

Gen konumu (İnsan)

Chr.	Kromozom 1 (insan)^[1]

Grup	1p36.11	Başlat	24,631,716 bp^[1]
Grup	1p36.11	Son	24,673,267 bp^[1]

RNA ifadesi Desen

Daha fazla referans ifade verisi

Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• DNA bağlanması • GO: 0001948 protein bağlama • RNA bağlanması
Hücresel bileşen	• nükleer matris • sitozol • katalitik adım 2 spliceosome • spliceozomal kompleks • hücre çekirdeği • nükleoplazma • nükleer benek
Biyolojik süreç	• Transesterifikasyon reaksiyonları yoluyla RNA ekleme • spliceozom yoluyla mRNA ekleme • RNA polimeraz II transkripsiyonunun sonlandırılması • mRNA işleme • mRNA 3'-uç işleme • Çekirdekten mRNA ihracatı • RNA ekleme • Çekirdekten RNA ihracatı
Kaynaklar:Amigo / QuickGO

Türler

İnsan

Fare


10250


n / a


ENSG00000133226


n / a


Q8IYB3


n / a

RefSeq (mRNA)


NM_001303448 NM_001303449 NM_005839


n / a

RefSeq (protein)

NP_001290377 NP_001290378 NP_005830 NP_001353494 NP_001353495
NP_001353496 NP_001353497 NP_001353498 NP_001353499 NP_001353500 NP_001353501 NP_001353502 NP_001353504 NP_001353505 NP_001353506 NP_001353507 NP_001353510 NP_001353511 NP_001353513 NP_001353514 NP_001353515 NP_001353516 NP_001353517 NP_001353518 NP_001353519 NP_001353520 NP_001353521 NP_001353522 NP_001353523 NP_001353524 NP_001353525 NP_001353526 NP_001353527 NP_001353528 NP_001353529


n / a

Konum (UCSC)

Tarih 1: 24.63 - 24.67 Mb

n / a

PubMed arama

^[2]

n / a

İnsanı Görüntüle / Düzenle

Serin / arginin tekrarlayan matriks proteini 1 bir protein insanlarda kodlanır SRRM1 gen.^[3]^[4]

Etkileşimler

SRRM1'in gösterdiği etkileşim ile CDC5L.^[5]

Referanslar

^ ^a ^b ^c GRCh38: Ensembl sürümü 89: ENSG00000133226 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ Blencowe BJ, Issner R, Nickerson JA, Sharp PA (Mayıs 1998). "Pre-mRNA eklemenin bir ortak aktivatörü". Genes Dev. 12 (7): 996–1009. doi:10.1101 / gad.12.7.996. PMC 316672. PMID 9531537.
^ "Entrez Geni: SRRM1 serin / arginin tekrarlayan matris 1".
^ Ajuh P, Kuster B, Panov K, Zomerdijk JC, Mann M, Lamond AI (Aralık 2000). "İnsan CDC5L kompleksinin fonksiyonel analizi ve bileşenlerinin kütle spektrometresi ile tanımlanması". EMBO J. 19 (23): 6569–81. doi:10.1093 / emboj / 19.23.6569. PMC 305846. PMID 11101529.

daha fazla okuma

Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998). "SRPK2: memeli hücrelerinde pre-mRNA ekleme faktörlerinin etkileşimine ve lokalizasyonuna aracılık etmede yer alan, farklı şekilde eksprese edilen SR proteinine özgü bir kinaz". J. Hücre Biol. 140 (4): 737–50. doi:10.1083 / jcb.140.4.737. PMC 2141757. PMID 9472028.
Wilson KF, Fortes P, Singh ABD, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (1999). "Nükleer başlık bağlama kompleksi, büyüme faktörü reseptörüne bağlı sinyal iletiminde yeni bir hedeftir". J. Biol. Kimya. 274 (7): 4166–73. doi:10.1074 / jbc.274.7.4166. PMID 9933612.
Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). "SRm160 / 300 ekleme koaktivatörü, ekson güçlendirici işlevi için gereklidir". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 96 (11): 6125–30. doi:10.1073 / pnas.96.11.6125. PMC 26846. PMID 10339552.
Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (2000). "SRm160 / 300 ekleme ortak etkinleştirici alt birimleri". RNA. 6 (1): 111–20. doi:10.1017 / S1355838200991982. PMC 1369899. PMID 10668804.
Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (2000). "Pre-mRNA splicing, mRNP kompozisyonunu değiştirir: proteinlerin ekson-ekson birleşimlerinde stabil bir şekilde birleştiğine dair kanıt". Genes Dev. 14 (9): 1098–108. PMC 316578. PMID 10809668.
McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). "Akut miyeloid lösemi ile ilişkili protein, DEK, ekson-ürün kompleksleri ile eklemeye bağlı bir etkileşim oluşturur". J. Hücre Biol. 150 (2): 309–20. doi:10.1083 / jcb.150.2.309. PMC 2180225. PMID 10908574.
Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). "Spliceozom, mRNA ekson-ekson bağlantılarının yukarısında çok sayıda protein 20-24 nükleotid biriktirir". EMBO J. 19 (24): 6860–9. doi:10.1093 / emboj / 19.24.6860. PMC 305905. PMID 11118221.
Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). "Ekson-ekson bağlantılarının pozisyonunun mRNA gözetim mekanizmasına RNPS1 proteini tarafından iletilmesi". Bilim. 293 (5536): 1836–9. doi:10.1126 / science.1062786. PMID 11546874.
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). "SRm160 ekleme ortak etkinleştiricisi, transkript 3'-uç bölünmesini destekler". Mol. Hücre. Biol. 22 (1): 148–60. doi:10.1128 / MCB.22.1.148-160.2002. PMC 134228. PMID 11739730.
Szymczyna BR, Pineda-Lucena A, Mills JL, Szyperski T, Arrowsmith CH (2002). "İH, 13C ve 15N rezonans atamaları ve azaltılmış boyutsallık NMR kullanılarak SRm160'dan PWI alanının ikincil yapısı". J. Biomol. NMR. 22 (3): 299–300. doi:10.1023 / A: 1014904502424. PMID 11991360.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002). "Üç boyutlu yapısal analize uygun doğal spliceozomların saflaştırılması ve karakterizasyonu". RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). "Ekson bağlantı kompleksi, memeli hücrelerinde CBP80'e bağlı ancak eIF4E'ye bağlı mRNA'da tespit edilmedi: mRNP yeniden modellemesinin dinamikleri". EMBO J. 21 (13): 3536–45. doi:10.1093 / emboj / cdf345. PMC 126094. PMID 12093754.
Meissner M, Lopato S, Gotzmann J, Sauermann G, Barta A (2003). "Proto-onkoprotein TLS / FUS, nükleer matris ile ilişkilidir ve ekleme faktörleri PTB, SRm160 ve SR proteinleri ile komplekslenmiştir". Tecrübe. Hücre Res. 283 (2): 184–95. doi:10.1016 / S0014-4827 (02) 00046-0. PMID 12581738.
Szymczyna BR, Bowman J, McCracken S, Pineda-Lucena A, Lu Y, Cox B, Lambermon M, Graveley BR, Arrowsmith CH, Blencowe BJ (2003). "PWI motifinin yapısı ve işlevi: mRNA öncesi işlemeyi kolaylaştıran yeni bir nükleik asit bağlama alanı". Genes Dev. 17 (4): 461–75. doi:10.1101 / gad.1060403. PMC 196000. PMID 12600940.
Wagner S, Chiosea S, Nickerson JA (2003). "SRm160'ın uzaysal hedefleme ve nükleer matris bağlama alanları". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 100 (6): 3269–74. doi:10.1073 / pnas.0438055100. PMC 152281. PMID 12624182.
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (2003). "Ekson bağlantı kompleksi oluşumundan bağımsız olarak çalışan 3 'uç işlemede SRm160 için evrimsel olarak korunan bir rol". J. Biol. Kimya. 278 (45): 44153–60. doi:10.1074 / jbc.M306856200. PMID 12944400.
Wagner S, Chiosea S, Ivshina M, Nickerson JA (2004). "In vitro FRAP, ekson bağlantı kompleks proteini SRm160'ın ATP'ye bağlı nükleer mobilizasyonunu ortaya koyuyor". J. Hücre Biol. 164 (6): 843–50. doi:10.1083 / jcb.200307002. PMC 2172284. PMID 15024032.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). "Hareketsizleştirilmiş metal afinite kromatografisi ve tandem kütle spektrometrisi kullanılarak insan T hücrelerinden tirozin fosforilasyon bölgelerinin sağlam fosfoproteomik profili". Anal. Kimya. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.

Dış bağlantılar

SRRM1 insan gen konumu UCSC Genom Tarayıcısı.
SRRM1 insan geni ayrıntıları UCSC Genom Tarayıcısı.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 1 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.