Stemloc - Stemloc
| Geliştirici (ler) | Ian Holmes (Kaliforniya Üniversitesi, Berkeley ) |
|---|---|
| Kararlı sürüm | 1 |
| İşletim sistemi | UNIX, Linux, Mac, Cygwin açık Windows XP |
| Tür | Biyoinformatik aracı |
| Lisans | Açık kaynak |
| İnternet sitesi | Stemloc ana sayfası |
Stemloc olasılık modellerine dayalı ikili RNA yapısal hizalaması için bir programdır. RNA yapısı olarak bilinir Stokastik bağlamdan bağımsız gramerleri eşleştirin. Stemloc Eşzamanlı yapı tahmini için Sankoff algoritmalarının kısıtlı sürümlerini uygular ve sıra hizalaması çoklu RNA'ların.
Stemloc bir parçası olarak indirilebilir DART yazılım paketi. Her ikisinde de giriş dosyalarını kabul eder FAŞTA veya Stockholm biçimi.
Referanslar
- Holmes I. (2005) RNA yapısı evriminin hızlandırılmış olasılıksal çıkarımı. BMC Biyoinformatik. 24 Mart 2005; 06:73.