TCEA1 - TCEA1 - Wikipedia

TCEA1
Protein TCEA1 PDB 1tfi.png
Mevcut yapılar
PDBOrtolog araması: PDBe RCSB
Tanımlayıcılar
Takma adlarTCEA1, GTF2S, SII, TCEA, TF2S, TFIIS, transkripsiyon uzatma faktörü A1
Harici kimliklerOMIM: 601425 MGI: 1196624 HomoloGene: 55984 GeneCard'lar: TCEA1
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 8 (insan)
Chr.Kromozom 8 (insan)[1]
Kromozom 8 (insan)
TCEA1 için genomik konum
TCEA1 için genomik konum
Grup8q11.23Başlat53,966,552 bp[1]
Son54,022,456 bp[1]
RNA ifadesi Desen
PBB GE TCEA1 216241 s fs.png'de
Daha fazla referans ifade verisi
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_006756
NM_201437

NM_001159750
NM_001159751
NM_011541

RefSeq (protein)

NP_006747
NP_958845

NP_001153222
NP_001153223
NP_035671

Konum (UCSC)Chr 8: 53.97 - 54.02 MbChr 1: 4,86 ​​- 4,9 Mb
PubMed arama[3][4]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Transkripsiyon uzama faktörü A protein 1 bir protein insanlarda kodlanır TCEA1 gen.[5][6][7]

Diğer organizmalarda bu gen daha çok transkripsiyon uzama faktörü II S (TFIIS). Esas olarak, RNAP aktif sahasında bir kesik oluşturarak geri izlenen uzama komplekslerinin çözümlenmesine yardımcı olur, böylece reaksiyon tekrar mümkün hale gelir. Ökaryotikte de bulunur. transkripsiyon ön başlatma kompleksi.[8] Arkeadaki bir homolog aynı ana görevi yerine getirirken, bakteriler homolog olmayan Gre'yi kullanır.[9]

Etkileşimler

TCEA1'in gösterdiği etkileşim ile GTF2H1[10][11] ve POLR2A.[10][11][12]

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl sürüm 89: ENSG00000187735 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Topluluk sürümü 89: ENSMUSG00000033813 - Topluluk, Mayıs 2017
  3. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  5. ^ DiMarco SP, Glover TW, Miller DE, Reines D, Warren ST (Ağustos 1996). "Transkripsiyon uzatma faktörü SII (TCEA), insan kromozomu 3p22 -> p21.3'e eşlenir". Genomik. 36 (1): 185–8. doi:10.1006 / geno.1996.0443. PMID  8812434.
  6. ^ Park H, Baek K, Jeon C, Agarwal K, Yoo O (Şubat 1994). "İnsan transkripsiyonel uzama faktörü TFIIS'i kodlayan genin karakterizasyonu". Gen. 139 (2): 263–7. doi:10.1016/0378-1119(94)90767-6. PMID  8112616.
  7. ^ "Entrez Geni: TCEA1 transkripsiyon uzama faktörü A (SII), 1".
  8. ^ Kim B, Nesvizhskii AI, Rani PG, Hahn S, Aebersold R, Ranish JA (Ekim 2007). "Transkripsiyon uzatma faktörü TFIIS, RNA polimeraz II ön başlatma komplekslerinin bir bileşenidir". Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri. 104 (41): 16068–73. doi:10.1073 / pnas.0704573104. PMC  2042163. PMID  17913884.
  9. ^ Robinson, Nicholas P .; Fouqueau, Thomas; Blombach, Fabian; Cackett, Gwenny; Carty, Alice E .; Matelska, Dorota M .; Ofer, Sapir; Pilotto, Simona; Phung, Duy Khanh; Werner, Finn (14 Aralık 2018). "Archaeal transkripsiyonun keskin kenarı". Yaşam Bilimlerinde Ortaya Çıkan Konular. 2 (4): 517–533. doi:10.1042 / ETLS20180014.
  10. ^ a b Archambault J, Pan G, Dahmus GK, Cartier M, Marshall N, Zhang S, ve diğerleri. (Ekim 1998). "FCP1, RNA polimeraz IIO'nun karboksil terminal alanını defosforile eden bir insan protein fosfatazının RAP74 ile etkileşen alt birimi". Biyolojik Kimya Dergisi. 273 (42): 27593–601. doi:10.1074 / jbc.273.42.27593. PMID  9765293.
  11. ^ a b Pan G, Aso T, Greenblatt J (Eylül 1997). "Uzatma faktörleri TFIIS ve elongin A'nın, promoter spesifik başlatma yeteneğine sahip ve transkripsiyonel aktivatörlere yanıt verebilen bir insan RNA polimeraz II holoenzimi ile etkileşimi". Biyolojik Kimya Dergisi. 272 (39): 24563–71. doi:10.1074 / jbc.272.39.24563. PMID  9305922.
  12. ^ Kettenberger H, Armache KJ, Cramer P (Ağustos 2003). "RNA polimeraz II-TFIIS kompleksinin mimarisi ve mRNA klevajı için çıkarımlar". Hücre. 114 (3): 347–57. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00598-1. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-8647-8. PMID  12914699. S2CID  17184533.

daha fazla okuma