Transmembran protein 134 - Transmembrane protein 134 - Wikipedia

TMEM134
Tanımlayıcılar
Takma adlarTMEM134, 2410001H17Rik, AI463452, transmembran protein 134
Harici kimliklerMGI: 1914240 HomoloGene: 11837 GeneCard'lar: TMEM134
Gen konumu (İnsan)
Kromozom 11 (insan)
Chr.Kromozom 11 (insan)[1]
Kromozom 11 (insan)
TMEM134 için genomik konum
TMEM134 için genomik konum
Grup11q13.2Başlat67,461,710 bp[1]
Son67,469,272 bp[1]
Ortologlar
TürlerİnsanFare
Entrez
Topluluk
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001078650
NM_001078651
NM_025124

NM_001078649
NM_025889

RefSeq (protein)

NP_001072118
NP_001072119
NP_079400

NP_001072117
NP_080165

Konum (UCSC)Tarih 11: 67.46 - 67.47 Mbn / a
PubMed arama[2][3]
Vikiveri
İnsanı Görüntüle / DüzenleFareyi Görüntüle / Düzenle

Transmembran protein 134 tarafından kodlanan bir proteindir TMEM134 gen. TMEM134'ün bilinen başka bir adı yoktur. İki transmembran alanı ve bilinmeyen işlevli bir alan (DUF872) vardır.[4] Evrimsel, bu gene sahip organizmaların çoğu primatlar ve memelilerdir, ancak bazı organizmalar Drosphila ve C. elegans. Mevcut araştırmalar sayesinde, TMEM134'ün onaylanmış herhangi bir işlevi olmamıştır.

Gen Yapısı

Gen, 67464348'den 67469277 kilo baza uzanan 6 eksondan oluşur. Kromozomun eksi sarmalı olan 11q13.2 kromozomunda bulunur. Gende üç izoform vardır; a, b ve c.

Protein

Protein Yapısı

Protein, TMEM134 geni tarafından kodlanır ve 195 amino asit uzunluğundadır. Protein, iki transmembran alan içerir, ancak bir sinyal peptidi içermez. Bu, proteinin çevrilmiş kısmının akış yukarısında bir dahili sinyal peptidinin olduğunu gösterir. Protein, amino asit içeriği ile genel olarak normal kabul edilir, ancak proteinin transmembran bölgelerinde meydana gelen iki yüksek hidrofobik bölgeye sahiptir. Bu, proteine ​​6.08'lik bir izoelektrik noktası verir. Proteinin toplam ağırlığı, farklı ortologlar boyunca korunan 21.6 kilodaltondur. Protein ayrıca işlevi bilinmeyen bir alan içerir 872 (DUF872). Şu anda bu alanın olası işlevi hakkında hiçbir düşünce yoktur.

Bu, iki transmembran alanı ve DUF872 içeren TMEM134'ün bir protein yapısıdır.

Düzenleme ve Tercüme

TMEM134, destekleyici GXP50275 tarafından düzenlenir.[5] Destekleyicide 870 amino asit ve bunun 15 transkript varyantı vardır. Destekleyici memelilerde iyi korunmuştur. Destekleyicide EGR / sinir faktörü ve Huntington hastalığı gen düzenleyici bölgesi dahil olmak üzere bazı korunmuş bağlanma bölgeleri vardır.

yer

Son proteinin, endoplazmik retikulum ve nükleer membranda olduğu düşünülmektedir.[6] Protein, 123-145 ve 155-177 olmak üzere iki farklı bölgede demirlenmiştir. Proteinin sitozole uzanan kısmı yoğun şekilde fosforile edilir. Bu fosforilasyon siteleri kemikli balıklar halinde korunur.

Çeviri Sonrası Değişiklik

Tek çeviri sonrası değişiklik meydana gelen fosforilasyondur. Glikosilasyon, sülfinasyon veya sumoilasyon bölgesi yoktur.

Etkileşimler

TMEM134, başka bir protein olan ELAVL1 ile bir etkileşime sahiptir. Bu protein, FOS ve IL3 / interlökin-3 mRNA'larda AU açısından zengin elementlere bağlanır.[7]

İfade

GEO profillerinin mikroarray analizi yapıldı ve TMEM134'ün insan dokularının çoğunda her yerde eksprese edildiği gösterildi.[8] İnsan dokularında her yerde ekspresyon bulunmasına rağmen, kalp, göğüs dokusu ve prostat dokusu gibi daha yüksek ekspresyon seviyelerine sahip başka dokular da vardır.

Homoloji

Daha önce tartışıldığı gibi, primatlarda ve memelilerde oldukça fazla koruma vardır, ancak bazı uzak zebra balığı ortologları vardır ve Drosphilave homologu C. elegans.

Cins ve TürlerYaygın isimUzunlukKatılımYüzde Kimlik[9]
Homo sapiensİnsan195 aaNP_079400100%
Papio anubisZeytin babun195 aaXP_003905916.197%
Sus scrofaYaban domuzu246 aaXP_00348071095%
Orincus ocraOrca195 aaXP_00427806494%
Equua nasırAt208 aaXP_00559852592%
Ceratotherium simum simumBeyaz gergedan186 aaXP_00443776689%
Bos taurusİnek229 aaXP_00522709778%
Drosphilia melangostarMeyve sineği170 aaNP_00126129632%
Caenorhabditis elegansSolucan168 aaNP_00102140126%

Referanslar

  1. ^ a b c GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000172663 - Topluluk, Mayıs 2017
  2. ^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  3. ^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
  4. ^ Genecards https://www.genecards.org/
  5. ^ El Dorado http://www.genomatix.de/cgi-bin/eldorado/main.pl
  6. ^ ExPasy http://www.expasy.org/
  7. ^ Genecards https://www.genecards.org/cgi-bin/carddisp.pl?gene=ELAVL1
  8. ^ NCBI GEO Profilleri https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geoprofiles/?term=tmem134
  9. ^ NCBI PATLATMA http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi