Benzersiz moleküler tanımlayıcı - Unique molecular identifier - Wikipedia

Benzersiz moleküler tanımlayıcılar (UMI'lar) veya moleküler barkodlar (MBC) bazılarında DNA fragmanlarına eklenen kısa diziler veya moleküler "etiketler" dir. Yeni nesil sıralama giriş DNA molekülünü tanımlamak için kütüphane hazırlama protokolleri. Bu etiketler daha önce eklenir PCR amplifikasyon ve hataları ve nicelikselliği azaltmak için kullanılabilir önyargı amplifikasyon tarafından tanıtıldı.

Uygulamalar şunları içerir değişken arama içinde ctDNA, gen ifadesi içinde tek hücreli RNA dizisi (scRNA-seq)[1][2] ve haplotipleme bağlantılı okumalar aracılığıyla[açıklama gerekli ].

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Kivioja T, Vähärautio A, Karlsson K, Bonke M, Enge M, Linnarsson S, Taipale J (2012). "Benzersiz moleküler tanımlayıcılar kullanarak moleküllerin mutlak sayılarının sayılması". Nat. Yöntemler. 9 (1): 72–4. doi:10.1038 / nmeth.1778. PMID  22101854. S2CID  39225091.
  2. ^ Islam S, Zeisel A, Joost S, La Manno G, Zajac P, Kasper M, Lönnerberg P, Linnarsson S (2014). "Benzersiz moleküler tanımlayıcılara sahip kantitatif tek hücreli RNA sekansı". Nat. Yöntemler. 11 (2): 163–6. doi:10.1038 / nmeth.2772. PMID  24363023. S2CID  6765530.