VPS28 - VPS28

VPS28
Tanımlayıcılar
Takma adlar	VPS28, ESCRT-I alt birimi, ESCRT-I'in VPS28 alt birimi
Harici kimlikler	OMIM: 611952 MGI: 1914164 HomoloGene: 69205 GeneCard'lar: VPS28
Gen konumu (İnsan)
Chr.	Kromozom 8 (insan)
Son	144,428,563 bp
Gen konumu (Fare)
Chr.	Kromozom 15 (fare)
Son	76,626,086 bp
RNA ifadesi Desen
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
Moleküler fonksiyon	• GO: 0032403 makromoleküler kompleks bağlanması; • ubikitin bağlanması; • GO: 0001948 protein bağlama;
Hücresel bileşen	• sitoplazma; • sitozol; • endozom; • zar; • geç endozom zarı; • hücre zarı; • erken endozom; • endozom zarı; • hücre dışı eksozom; • ESCRT I kompleksi; • konakçı hücre;
Biyolojik süreç	• GO: 0046795 virüsün hücre içi taşınması; • ubikuitine bağlı endositozun pozitif düzenlenmesi; • protein katabolik sürecinin pozitif düzenlenmesi; • konak ESCRT kompleksi yoluyla viral tomurcuklanma; • GO: 0019067 viral yaşam döngüsü; • çok biçimli gövde montajı; • endozomal nakil; • protein ubikitinasyonunun negatif düzenlenmesi; • protein taşınması; • ubikitine bağımlı protein katabolik süreci, çok biçimli vücut sıralama yolu aracılığıyla; • ubikuitine bağlı protein katabolik sürecine dahil olan vakuole çok gözlü vücut sıralama yolu yoluyla protein taşınması; • makrootofaji; • Ulaşım; • çok biçimli vücut sıralama yolu ile endozom nakli;
	Kaynaklar:Amigo / QuickGO
Ortologlar
	51160
	66914
	ENSG00000160948; ENSG00000285339
	ENSMUSG00000115987
	Q9UK41; Q548N1
	Q9D1C8
	NM_016208; NM_183057
	NM_025842; NM_001305668
	NP_057292; NP_898880; NP_057292.1
	NP_001292597; NP_080118
	Vikiveri
İnsanı Görüntüle / Düzenle	Fareyi Görüntüle / Düzenle

Vakuolar protein ayırma ile ilişkili protein 28 homolog bir protein insanlarda kodlanır VPS28 gen.^[5]

Fonksiyon

Bu gen, hücre yüzeyi reseptörlerinin çok biçimli bir gövde / geç endozom yolu aracılığıyla endozomal sınıflandırılmasına dahil olan bir proteini kodlar. Kodlanmış protein, üç alt birimden biridir. ESCRT-I sınıflandırılmasında yer alan kompleks (taşıma için gerekli endozomal kompleksler) ubikitinlenmiş protein. ESCRT-I'in diğer iki alt birimi, vakuolar protein sıralama 23'tür (VPS23). tümör duyarlılık geni 101 (TSG101) ve vakuolar protein sınıflandırması 37 (VPS37). Farklı izoformları kodlayan iki alternatif transkript açıklanmıştır. İlave alternatif transkriptler mevcut olabilir, ancak bu transkriptler tarafından kodlanan proteinler deneysel olarak doğrulanmamıştır.^[5]

Etkileşimler

VPS28'in gösterdiği etkileşim ile TSG101.^[6]^[7]^[8]

Referanslar

^ ^a ^b ^c ENSG00000285339 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000160948, ENSG00000285339 - Topluluk, Mayıs 2017
^ ^a ^b ^c GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000115987 - Topluluk, Mayıs 2017
^ "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
^ ^a ^b "Entrez Gene: VPS28 vakuolar protein sıralama 28 homolog (S. cerevisiae)".
^ Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Çevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Ekim 2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
^ Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (Ağustos 2004). "Taşıma için gerekli insan endozomal ayırma kompleksi (ESCRT-I) ve bunun HIV-1 tomurcuklanmasındaki rolü". J. Biol. Kimya. 279 (34): 36059–71. doi:10.1074 / jbc.M405226200. PMID 15218037.
^ Bishop N, Woodman P (Nisan 2001). "TSG101 / memeli VPS23 ve memeli VPS28 doğrudan etkileşime girer ve VPS4 ile indüklenen endozomlara dahil edilir". J. Biol. Kimya. 276 (15): 11735–42. doi:10.1074 / jbc.M009863200. PMID 11134028.

daha fazla okuma

Raiborg C, Rusten TE, Stenmark H (2004). "Proteinlerin multiviküler endozomlara ayrılması". Curr. Opin. Hücre Biol. 15 (4): 446–55. doi:10.1016 / S0955-0674 (03) 00080-2. PMID 12892785.
Piskopos N, Woodman P (2001). "TSG101 / memeli VPS23 ve memeli VPS28, doğrudan etkileşime girer ve VPS4 ile indüklenen endozomlara dahil edilir". J. Biol. Kimya. 276 (15): 11735–42. doi:10.1074 / jbc.M009863200. PMID 11134028.
Suzuki H, Fukunishi Y, Kagawa I, Saito R, Oda H, Endo T, Kondo S, Bono H, Okazaki Y, Hayashizaki Y (2001). "Tam Uzunlukta Fare cDNA'larını Kullanan Protein-Protein Etkileşim Paneli". Genom Res. 11 (10): 1758–65. doi:10.1101 / gr.180101. PMC 311163. PMID 11591653.
Piskopos N, Horman A, Woodman P (2002). "Memeli sınıfı E vps proteinleri ubikitini tanır ve endozomal protein-ubikuitin konjugatlarının uzaklaştırılmasında rol oynar". J. Hücre Biol. 157 (1): 91–101. doi:10.1083 / jcb.200112080. PMC 2173266. PMID 11916981.
Martin-Serrano J, Zang T, Bieniasz PD (2003). "Retroviral Gelişmede ESCRT-I'in Rolü". J. Virol. 77 (8): 4794–804. doi:10.1128 / JVI.77.8.4794-4804.2003. PMC 152150. PMID 12663786.
Tanzi GO, Piefer AJ, Bates P (2003). "At Enfeksiyöz Anemi Virüsü, Partikül Salımı Sırasında Ev Sahibi Vesiküler Protein Ayırma Makinasını Kullanıyor". J. Virol. 77 (15): 8440–7. doi:10.1128 / JVI.77.15.8440-8447.2003. PMC 165230. PMID 12857913.
Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D, Bieniasz PD, Yaravoy A (2003). "Iraksak retroviral geç tomurcuklanan alanlar, alternatif adaptör proteinler kullanarak vakuolar protein sıralama faktörlerini işe alır". Proc. Natl. Acad. Sci. AMERİKA BİRLEŞİK DEVLETLERİ. 100 (21): 12414–9. Bibcode:2003PNAS..10012414M. doi:10.1073 / pnas.2133846100. PMC 218772. PMID 14519844.
Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (2005). "Taşıma için gerekli insan endozomal ayırma kompleksi (ESCRT-I) ve bunun HIV-1 tomurcuklanmasındaki rolü". J. Biol. Kimya. 279 (34): 36059–71. doi:10.1074 / jbc.M405226200. PMID 15218037.
Bache KG, Slagsvold T, Cabezas A, Rosendal KR, Raiborg C, Stenmark H (2005). "Büyüme Düzenleyici Protein HCRP1 / hVps37A, Memeli ESCRT-I'in bir Alt Birimidir ve Reseptör Aşağı Düzenlemesine Aracıdır". Mol. Biol. Hücre. 15 (9): 4337–46. doi:10.1091 / mbc.E04-03-0250. PMC 515363. PMID 15240819.
Eastman SW, Martin-Serrano J, Chung W, Zang T, Bieniasz PD (2005). "Taşıma için gerekli olan endozomal sıralama kompleksinin bir bileşeni olan insan VPS37C'nin tanımlanması - viral tomurcuklanma için önemlidir". J. Biol. Kimya. 280 (1): 628–36. doi:10.1074 / jbc.M410384200. PMID 15509564.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Çevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Bu makale bir gen açık insan kromozomu 8 bir Taslak. Wikipedia'ya şu yolla yardım edebilirsiniz: genişletmek.

[refGRCh38Ensembl-1] ENSG00000285339 GRCh38: Topluluk sürümü 89: ENSG00000160948, ENSG00000285339 - Topluluk, Mayıs 2017

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl sürüm 89: ENSMUSG00000115987 - Topluluk, Mayıs 2017

[3] "İnsan PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[4] "Mouse PubMed Referansı:". Ulusal Biyoteknoloji Bilgi Merkezi, ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.

[entrez-5] "Entrez Gene: VPS28 vakuolar protein sıralama 28 homolog (S. cerevisiae)".

[pmid16189514-6] Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Çevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (Ekim 2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli bir haritasına doğru". Doğa. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

[pmid15218037-7] Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (Ağustos 2004). "Taşıma için gerekli insan endozomal ayırma kompleksi (ESCRT-I) ve bunun HIV-1 tomurcuklanmasındaki rolü". J. Biol. Kimya. 279 (34): 36059–71. doi:10.1074 / jbc.M405226200. PMID 15218037.

[pmid11134028-8] Bishop N, Woodman P (Nisan 2001). "TSG101 / memeli VPS23 ve memeli VPS28 doğrudan etkileşime girer ve VPS4 ile indüklenen endozomlara dahil edilir". J. Biol. Kimya. 276 (15): 11735–42. doi:10.1074 / jbc.M009863200. PMID 11134028.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]