WcaG RNA motifi - wcaG RNA motif - Wikipedia
| wcaG RNA motifi | |
|---|---|
 Konsensüs ikincil yapısı wcaG RNA'lar | |
| Tanımlayıcılar | |
| Sembol | wcaG RNA |
| Rfam | RF01761 |
| Diğer veri | |
| RNA tip | Cisdüzenleyici unsur |
| Alan (lar) | Siyanobakteriler |
| PDB yapılar | PDBe |
wcaG RNA motifi bir RNA bazılarında korunan yapı bakteri tarafından tespit edildi biyoinformatik.[1] wcaG RNA'lar belirli fajlar bu enfekte siyanobakteriler. En bilinen wcaG RNA'lar aşağıdaki dizilerde bulundu DNA ekilmemişten çıkarıldı deniz bakterileri. wcaG RNA'lar şu şekilde işlev görebilir: cis-düzenleyici unsurlar, mümkün olduğunca tutarlı konumlarına göre 5 'çevrilmemiş bölgeler nın-nin genler. Önerildi wcaG RNA'lar ayrıca şu şekilde işlev görebilir: riboswitchler.
Düzenlendiği varsayılan genler wcaG RNA'lar sentezinde işlev görür ekzopolisakkaritler veya yüksek miktarda ışık. Bu son genler muhtemelen siyanobakteriyel fotosentez. Tespit edilen wcaG Saflaştırılmış fajlardaki RNA'lar, vurgulanan indüklenmiş genlerin üst kısmındadır. Bu genlerin tipik fajlar olduğu düşünülmese de, daha önce siyanobakterileri enfekte eden fajların genellikle bu tür genleri içerdiği gözlemlenmişti.[2][3][4]
Referanslar
- ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, vd. (Mart 2010). "Karşılaştırmalı genomik, bakteriler, arkeler ve bunların metagenomlarından 104 aday yapılandırılmış RNA ortaya koyuyor". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC 2864571. PMID 20230605.
- ^ Sullivan MB, Coleman ML, Weigele P, Rohwer F, Chisholm SW (Mayıs 2005). "Üç Prochlorococcus cyanophage genomu: imza özellikleri ve ekolojik yorumlar". PLoS Biol. 3 (5): e144. doi:10.1371 / journal.pbio.0030144. PMC 1079782. PMID 15828858.
- ^ Rohwer F, Thurber RV (Mayıs 2009). "Virüsler deniz ortamını manipüle eder". Doğa. 459 (7244): 207–212. doi:10.1038 / nature08060. PMID 19444207.
- ^ Lindell D, Jaffe JD, Coleman ML ve diğerleri. (Eylül 2007). "Bir deniz virüsünün ve konağın genom çapında ifade dinamikleri, birlikte evrimin özelliklerini ortaya çıkarır". Doğa. 449 (7158): 83–86. doi:10.1038 / nature06130. PMID 17805294.
Dış bağlantılar
- WcaG RNA sayfası -de Rfam