Whalefall-1 RNA motifi - Whalefall-1 RNA motif

Whalefall-1 RNA motifi
Whalefall-1-RNA.svg
Whalefall-1 RNA'larının konsensüs ikincil yapısı
Tanımlayıcılar
Sembolwf-1
RfamRF01762
Diğer veri
RNA tipsRNA
Alan (lar)Balina düşüşü metagenomu
PDB yapılarPDBe

Whalefall-1 RNA motifi (olarak da adlandırılır wf-1) korunmuş bir RNA kullanılarak keşfedilen yapı biyoinformatik.[1][2] Yapısal olarak motif iki gövde döngüleri (şemaya bakın), ikincisi genellikle bir CUUG tarafından sonlandırılır tetraloop enerjik olarak uygun bir RNA dizisi olan. Whalefall-1 RNA'ları yalnızca DNA ekilmemişten çıkarıldı bakteri bulundu balina düşüşü yani a balina karkas. 2010 yılı itibarıyla Whalefall-1 RNA'ları, bilinen, kültürlenmiş bakteri türlerinin hiçbirinde tespit edilmemiştir ve bu nedenle, birkaç Çevresel örneklerde bulunan RNA'lar.

Referanslar

  1. ^ Weinberg Z, Wang JX, Bogue J, vd. (Mart 2010). "Karşılaştırmalı genomik, bakteriler, arkeler ve bunların metagenomlarından 104 aday yapılandırılmış RNA ortaya koyuyor". Genom Biol. 11 (3): R31. doi:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. PMC  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Weinberg Z, Perreault J, Meyer MM, Breaker RR (Aralık 2009). "Bakteriyel metagenom analizi ile ortaya çıkan olağanüstü yapılandırılmış kodlamayan RNA'lar". Doğa. 462 (7273): 656–9. doi:10.1038 / nature08586. PMC  4140389. PMID  19956260.

Dış bağlantılar